兒童系統(tǒng)性紅斑狼瘡基因組甲基化水平及LINE-1序列甲基化水平的研究
發(fā)布時間:2019-08-26 20:10
【摘要】:研究目的:探討兒童系統(tǒng)性紅斑狼瘡(pediatric systemic lupus erythematosus, pSLE)患者基因組DNA甲基化水平在發(fā)病過程中的變化、LINE-1序列甲基化水平的變化及其與病情活動度、補(bǔ)體C3及血漿同型半胱氨酸的相關(guān)性。研究方法:一、對象為2010-2012年在我院風(fēng)濕免疫科確診的pSLE患兒。選取pSLE患兒外周血單個核細(xì)胞的DNA標(biāo)本為病例組,同期采集健康查體兒童DNA標(biāo)本為對照組。SLEDAI≥10分為疾病活動組,10分為相對靜止組;按年齡分為12歲和≥12歲組。取100ng DNA標(biāo)本,加入0.25U Benzonase核酸酶,0.3 mU磷酸二酯酶I和0.2 U堿磷酸酶,用Tris緩沖液控制pH值在7.9,37℃水解6小時。利用Agilent1200-6410B液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜儀和Agilent ZORBAX SB-AQ C18 (2.1×50 mm,3.5肛)色譜柱對水解后樣品分離定量。優(yōu)化方法在5 min內(nèi)完成一份樣品檢測,并行方法的日內(nèi)穩(wěn)定和日間穩(wěn)定性評價,證明方法穩(wěn)定可靠。實際樣品進(jìn)樣量為10此,檢測模式為MRM模式。測定5mdC和dG的峰面積比。以dG為內(nèi)標(biāo),用標(biāo)準(zhǔn)曲線計算標(biāo)本中DNA總體甲基化水平。二、通過基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜法(MALDI-TOF)聯(lián)合RNA堿基特異性剪切法(MassCLEAVE)測定外周血單個核細(xì)胞中LINE-1甲基化水平,以及應(yīng)用化學(xué)發(fā)光法測定血漿總同型半胱氨酸(tHcy)水平。研究結(jié)果:一、病例組38例,男女比8:30,年齡4-18歲,對照組30例,男女比11:19,年齡8-18歲。病例組12歲16例,≥12歲22例;對照組12歲28例,≥12歲2例。SLEDAI≥10分12例,SLEDAI10分26例。病例組基因組DNA甲基化水平(5.89%±0.41%)低于對照組(6.75±0.79%),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=-5.613,P0.001)。病例組按12歲組與≥12歲組組間比較,其基因組DNA甲基化水平差異無統(tǒng)計學(xué)意義,對照組依同樣方法分組比較,組間甲基化水平無明顯差異。分別比較兩組中男女間甲基化水平,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。SLEDAI10分和SLEDAI≥10分組分別與對照組比較,甲基化水平均存在差異(p0.001);SLEDAI10分和≥10分組之間差異無統(tǒng)計學(xué)意義(p=0.993)。二、病例組59例,男女比16:43,年齡4-18歲,對照組47例,男女比16:31;年齡6-18歲。pSLE病例組及健康對照組的LINE-1甲基化水平分別為60.93%及62.88%,二者比較差異顯著(p=0.001)。病例組LINE-1甲基化水平與SLEDAI評分相關(guān)(r=-0.285,P=0.032)。病例組LINE-1甲基化水平與C3顯著相關(guān)(r=0.317,P=0.044)。低甲基化水平者pSLE發(fā)病風(fēng)險升高(AOR:14.5; 95% CI:2.8,75.6)。病例組血漿同型半胱氨酸水平顯著高于對照組,(分別為15. 11μmol/L及11.022μmol/L, P= 0.028), LINE-1甲基化與血漿同型半胱氨酸顯著相關(guān)(r=-0.4,P=0.013)。結(jié)論:pSLE患者基因組DNA甲基化水平降低,LINE-1序列甲基化水平降低,LINE-1甲基化水平與pSLE病情活動度及補(bǔ)體C3顯著相關(guān),與血漿同型半胱氨酸水平顯著相關(guān)。
【圖文】:
圖3所示,5mdC的LOD和逡逑LOQ分別為1x10-i7M,,IxlO-iSM
60.04%、61.67%、62.88%,P=0.001)。中重度活動狼瘡與緩解及輕度活動狼瘡LINE-逡逑1甲基化水平相比,差異顯著(P=0.03)。(表4)評估位于LINE-1的每一個坤G位逡逑點(diǎn)的甲基化水平,(圖2),不同CpG位點(diǎn)甲基化水平不同,CpG-5位點(diǎn)甲基化水平逡逑最低(20.63%),相反,位于51尾端的CpG-11、CpG-12位點(diǎn)則甲基化水平最高逡逑(85.54%)。CpG-l,2,5位點(diǎn)甲基化水平明濕低于健康對照姐(P<0.05)。依據(jù)病情活逡逑動性分析,將LINE-1上每一個CpG位點(diǎn)的甲基化水平進(jìn)行比較,中重度活動狼瘡逡逑CpG-l,2,5甲基化水平顯著低于緩解及哲度活動狼瘡(分別P<0.01,P<0.01,P<0.05)。逡逑表4.不同疾病活動度病例組與對照組LINE-1甲基化水平比較逡逑n邐LINE-1甲基化水平(%)邋P逡逑中重度活動邋pSLE邐28邐60.04±2.67邐0.001*逡逑緩解及輕度活動邋pSLE邐28邐61.67±3.13邐0.0012逡逑病例組邐56*邐60.85巧.00邐0.0013逡逑對照組邐47邐化88±2.76逡逑1:中重度活動pSLE與對照組相比差異顯著逡逑2:緩解及容度活動pSLE與對照}D相比差異顯著逡逑3:病例組與對照組相比差異顯著逡逑*3個病例無實驗結(jié)果逡逑25逡逑
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R725.9
【圖文】:
圖3所示,5mdC的LOD和逡逑LOQ分別為1x10-i7M,,IxlO-iSM
60.04%、61.67%、62.88%,P=0.001)。中重度活動狼瘡與緩解及輕度活動狼瘡LINE-逡逑1甲基化水平相比,差異顯著(P=0.03)。(表4)評估位于LINE-1的每一個坤G位逡逑點(diǎn)的甲基化水平,(圖2),不同CpG位點(diǎn)甲基化水平不同,CpG-5位點(diǎn)甲基化水平逡逑最低(20.63%),相反,位于51尾端的CpG-11、CpG-12位點(diǎn)則甲基化水平最高逡逑(85.54%)。CpG-l,2,5位點(diǎn)甲基化水平明濕低于健康對照姐(P<0.05)。依據(jù)病情活逡逑動性分析,將LINE-1上每一個CpG位點(diǎn)的甲基化水平進(jìn)行比較,中重度活動狼瘡逡逑CpG-l,2,5甲基化水平顯著低于緩解及哲度活動狼瘡(分別P<0.01,P<0.01,P<0.05)。逡逑表4.不同疾病活動度病例組與對照組LINE-1甲基化水平比較逡逑n邐LINE-1甲基化水平(%)邋P逡逑中重度活動邋pSLE邐28邐60.04±2.67邐0.001*逡逑緩解及輕度活動邋pSLE邐28邐61.67±3.13邐0.0012逡逑病例組邐56*邐60.85巧.00邐0.0013逡逑對照組邐47邐化88±2.76逡逑1:中重度活動pSLE與對照組相比差異顯著逡逑2:緩解及容度活動pSLE與對照}D相比差異顯著逡逑3:病例組與對照組相比差異顯著逡逑*3個病例無實驗結(jié)果逡逑25逡逑
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R725.9
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7 徐酩;呂京o
本文編號:2529519
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