激素敏感型及依賴型腎病綜合征患兒基因甲基化研究及其生物信息學分析
[Abstract]:Objective there are few studies on gene methylation in children with hormone sensitive nephrotic syndrome (SSNS) and steroid-dependent nephrotic syndrome (SDNS). The purpose of this study was to screen the differentially expressed genes between SSNS and SDNS and to make bioinformatics analysis. To explore the possible pathogenesis and search for potential therapeutic targets. Methods from January to December 2015, 7 inpatients with SSNs in Nanjing General Hospital of Nanjing military region were treated with prednisone [2 mg/ (kg d) or 60mg/ (m2 d)] for 4 weeks. However, two consecutive drug reduction or withdrawal within 2 weeks of recurrence. The DNA of peripheral blood was extracted from two groups of children. The differentially expressed methylated genes were screened by gene methylation microarray, and the results were analyzed by bioinformatics. Results the results of methylation microarray showed that there were 318 differentially methylated genes in SSNS group, among which 193 were hypermethylated and 125 were hypomethylated. These abnormal genes were mainly located in the open reading frame and CP G island region of DNA. Methylation differential genes are mainly involved in the activities of Rho guanine nucleotide exchange factor, nucleoside triphosphatase regulating activity and so on. Biological processes are mainly involved in the regulation of precursor metabolites and energy, antigen processing and presentation of Rho and Ras protein signal transduction pathways, pseudopodia collection, regeneration and other biological processes. In cell composition, MHC protein complex, perichromatin fiber and MHC class 1 protein complex are involved. KEGG signaling pathway analysis showed that differential genes were involved in 9 signaling pathways, including type I diabetes mellitus, metabolism of starch and sucrose, allograft rejection and autoimmune thyroid disease. Conclusion the abnormal methylation of SDNS gene is one of the causes of hormone dependence in children with SDNS, which provides a basis for searching for potential therapeutic targets.
【作者單位】: 南方醫(yī)科大學金陵醫(yī)院(南京軍區(qū)南京總醫(yī)院)兒科;
【基金】:國家自然科學基金(81270800)
【分類號】:R726.9
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,本文編號:2196841
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