發(fā)布時(shí)間：2018-07-08 14:37

  本文選題：手足口病 + 監(jiān)測(cè)��； 參考：《中國疾病預(yù)防控制中心》2012年博士論文

【摘要】：自2008年以來,手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)在我國大陸發(fā)生全國范圍的大流行,成為危害嬰幼兒健康的重要傳染病。由此,HFMD于2008年5月2日開始,作為第38種法定報(bào)告?zhèn)魅静?納入C類進(jìn)行管理。同時(shí)開展全國范圍的流行病學(xué)和病毒學(xué)監(jiān)測(cè)。從國家法定傳染病報(bào)告系統(tǒng)(National Notifiable Disease Reporting System, NNDRS)對(duì)發(fā)病時(shí)間為2008年1月1日至2011年12月31日的病例信息進(jìn)行收集、整理和分析。數(shù)據(jù)顯示2009-2011年,每年報(bào)告病例數(shù)為1,155,491-1,619,689例,其中具有神經(jīng)體統(tǒng)癥狀的重癥病例13,481-27,043例,死亡病例355-904例。1歲和2歲年齡組兒童具有最高的發(fā)病和死亡率,分別為(/10萬)1,211-2,953和0.61-2.12。病毒學(xué)監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)顯示：EV71和CA16為主要的病原,而EV71感染在重癥和死亡病例具有較高比例,分別占79%-82%和92%-95%。為了對(duì)流行的EV71的分子流行病學(xué)特征進(jìn)行分析,本研究共測(cè)定或下載了(從GenBank)共3435株本土分離株的VP1全序列,以及129株的全基因組序列。采用生物信息學(xué)軟件對(duì)序列進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,C4亞型自1998年以來作為優(yōu)勢(shì)型別在我國大陸持續(xù)循環(huán),其起源于～1994年,以4.6×10-3的速率不斷進(jìn)化。在不斷進(jìn)化中,C4分離株與SHZH98的進(jìn)化距離隨著流行年代逐漸增大。從2002-2004年,進(jìn)化分支從C4b轉(zhuǎn)化為了C4a�；谌蚪M序列的分析結(jié)果顯示,我國流行的EV71均與HEV-A組的其它EV發(fā)生型間重組。親緣性和進(jìn)化距離分析均表明：除P1以外的其它所有非結(jié)構(gòu)區(qū)(P2、P3和UTR)均與HEV-A的其它EV發(fā)生了重組。雖然,重組發(fā)生部位和重組來源具有多樣性,但大部分的流行株在基于各基因構(gòu)建的親緣性關(guān)系樹上均相互聚為一簇,且相互間具有較小的進(jìn)化距離(0.019-0.041)。提示：在我國大陸流行的C4亞型EV71為一群具有較高同源性的病毒。對(duì)各個(gè)基因進(jìn)行的自然選擇分析顯示：EV71的整個(gè)基因組均處于負(fù)選擇壓力下,只有VP3的第93位密碼子和VP1的第98位密碼子為廣泛存在的正選擇位點(diǎn)。根據(jù)本研究得出的結(jié)果,我們認(rèn)為：1)低年齡兒童,尤其是3歲以下嬰幼兒是對(duì)HFMD進(jìn)行預(yù)防和控制的重點(diǎn)目標(biāo)人群；2)應(yīng)對(duì)HFMD帶來的健康威脅,重點(diǎn)應(yīng)放在EV71；3)在持續(xù)傳播過程中,C4亞型EV71通過點(diǎn)突變和基因重組的方式不斷進(jìn)化,但還需通過進(jìn)一步的研究來闡述其在進(jìn)化中是否獲得了利于其傳播的生物學(xué)性狀;4)EV71基因組處于較強(qiáng)的負(fù)選擇壓力下,這將為EV71疫苗的研制提供便利。
[Abstract]:Since 2008, HFMD (hand, foot and mouth disease) has become a national epidemic in mainland China, and has become an important infectious disease endangering the health of infants and young children. HFMD, as the 38th legally reported infectious disease, was included in category C management since May 2, 2008. At the same time, epidemiological and virological surveillance was carried out nationwide. From the National Notifiable Disease reporting system (NNDRS), this paper collected, collated and analyzed the case information from January 1, 2008 to December 31, 2011. The data showed that 1155491-1619689 cases were reported every year in 2009-2011, of which 13481-27043 were severe cases with neurosomatic symptoms, 355-904 children aged 1. 1 years and 2 years old had the highest morbidity and mortality, respectively (1 / 100000) 1211-2953 and 0.61-2.12, respectively. Virological monitoring data showed that: EV71 and CA16 were the main pathogens, and EV71 infection had a higher proportion in severe cases and deaths, accounting for 79-82% and 92-9550%, respectively. In order to analyze the molecular epidemiological characteristics of EV71, the whole VP1 sequence of 3435 strains isolated from GenBank and the whole genome sequence of 129 strains were determined or downloaded in this study. The sequence was analyzed by bioinformatics software. The results show that the C _ 4 subtype has been circulating continuously in China continent since 1998, which originated from 1994 and evolved at a rate of 4.6 脳 10 ~ (-3). The evolutionary distance between C _ 4 isolate and SHZH98 gradually increased with the epidemic age. From 2002 to 2004, the evolutionary branch was transformed from C4b to C4a. The results based on the whole genome sequence showed that EV71 in China was recombined with other EV genomes in HEV-A group. Phylogenetic analysis and evolutionary distance analysis showed that all the non-structural regions (P2P3 and UTR) except P1 were recombined with other EV of HEV-A. Although the site and source of recombination are diverse, most of the prevalent strains are clustered into one cluster in the genetic tree based on each gene, and there is a small evolutionary distance between them (0.019-0.041). It is suggested that the C4 subtype EV71, which is prevalent in mainland China, is a group of viruses with high homology. The natural selection analysis of each gene showed that the whole genome of VEV71 was under negative selection pressure, and only the 93rd codon of VP3 and the 98th codon of VP1 were the ubiquitous positive selection sites. According to the results of this study, we think that low age children, especially children under 3 years old, are the key target population for HFMD prevention and control. 2) to deal with the health threat caused by HFMD, the emphasis should be on EV71. 3) during the process of continuous transmission, EV71 subtype C _ 4 evolved continuously through point mutation and gene recombination. However, further research is needed to explain whether the EV71 genome is under strong negative selection pressure, which will facilitate the development of EV71 vaccine.
【學(xué)位授予單位】：中國疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2012
【分類號(hào)】：R725.1

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8 特約記者 曾航邋本報(bào)記者 周揚(yáng);阜陽致命EV71病毒調(diào)查[N];21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道;2008年

9 記者 袁立新 通訊員 段立華;腸道病毒71型研究步步深入[N];健康報(bào);2000年

10 本版編輯邋代群 崔靜 周立民 熊潤(rùn)頻;阜陽EV71感染事件：已有585例患兒痊愈[N];新華每日電訊;2008年

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本文編號(hào)：2107757