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RNA編輯酶ADAR1對EV71感染及變異的影響

發(fā)布時間:2018-05-30 06:36

  本文選題:EV + ADAR�。� 參考:《復旦學報(醫(yī)學版)》2017年03期


【摘要】:目的研究RNA編輯酶腺苷酸脫氨酶(adenosine deaminase acting on RNA,ADAR1)對新型腸道病毒71型(enterovirus 71,EV71)感染及變異的影響。方法運用RNAi技術篩選ADAR1基因沉默穩(wěn)定細胞株,通過MTT分析病毒感染后細胞活力變化、噬斑形成分析病毒滴度及細胞對病毒的敏感性,以及Western blot測定病毒蛋白表達水平等,分析ADAR1對EV71感染的影響。由于ADAR1介導的RNA編輯可使基因形成A-G或T-C突變,為確定ADAR1影響EV71感染是否與其編輯EV71基因組導致病毒變異有關,對EV71流行區(qū)EV71的突變特征進行分析;并利用EV71感染ADAR1基因沉默細胞,通過對病毒基因組測序分析,研究ADAR1是否直接編輯EV71基因組。結果 ADAR1基因沉默后,與對照細胞相比,病毒感染細胞的存活率下降更快,并形成更多、更大的噬斑。病毒感染細胞中的VP1蛋白和細胞培養(yǎng)基上清中的病毒滴度均明顯增加。EV71突變特征分析表明,雖然A-G和T-C之間的變異是病毒突變的主要類型,但EV71感染實驗初步證明,ADAR1并不直接編輯EV71病毒基因組。結論 ADAR1可能具有抗EV71感染的作用,但ADAR1可能并不直接編輯EV71基因組。
[Abstract]:Objective to study the effect of adenosine deaminase acting on RNA (ADAR1), an RNA editing enzyme, on the infection and variation of enterovirus 71 (EV71). Methods ADAR1 gene silencing stable cell lines were screened by RNAi technique. The changes of cell viability after virus infection were analyzed by MTT, the titer of virus and the sensitivity of cells to virus were analyzed by plaque formation, and the expression level of viral protein was determined by Western blot. The effect of ADAR1 on EV71 infection was analyzed. Because RNA editing mediated by ADAR1 can make gene A-G or T-C mutation, in order to determine whether the influence of ADAR1 on EV71 infection is related to the virus mutation caused by ADAR1 editing EV71 genome, the mutation characteristics of EV71 in EV71 endemic area are analyzed. The viral genome was sequenced by EV71 infection with ADAR1 gene silencing cells to study whether ADAR1 directly edited the EV71 genome. Results after ADAR1 gene silencing, the survival rate of viral infected cells decreased more rapidly than that of control cells, and more and larger plaque was formed. The analysis of VP1 protein in virus infected cells and virus titer in supernatant of cell culture medium showed that the mutation between A-G and T-C was the main type of virus mutation. However, EV71 infection test showed that ADAR1 did not directly edit the genome of EV71 virus. Conclusion ADAR1 may have the effect of resisting EV71 infection, but ADAR1 may not directly edit EV71 genome.
【作者單位】: 復旦大學基礎醫(yī)學院病原生物學系-衛(wèi)生部、教育部醫(yī)學分子病毒學重點實驗室;
【基金】:國家自然科學基金(31570156) 傳染病防治國家科技重大專項(2012ZX10004503-003)~~
【分類號】:R725.1

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