發(fā)布時間：2018-05-12 04:29

  本文選題：肺動脈閉鎖 + 染色體�。� 參考：《華中科技大學(xué)》2013年博士論文

【摘要】：第一部分肺動脈閉鎖染色體核型分析 [目的]對肺動脈閉鎖患兒進(jìn)行核型檢測,分析染色體異常與肺動脈閉鎖的關(guān)系。 [方法]35例肺動脈閉鎖患兒行G顯帶常染色體檢測。 [結(jié)果]發(fā)現(xiàn)1例合并有21三體綜合征,余染色體核型正常。 [結(jié)論]21三體綜合征可合并有肺動脈閉鎖,肺動脈閉鎖患兒染色體核型異常并不多見,提示應(yīng)用常規(guī)染色體核型分析無法對這種嚴(yán)重復(fù)雜的先心病進(jìn)行篩查。 第二部分肺動脈閉鎖TBX1微缺失研究 [目的]對肺動脈閉鎖患兒進(jìn)行TBX1微缺失檢測,探討肺動脈閉鎖與TBX1的關(guān)系。 [方法]選用荷蘭Kreatech公司Poseidon FISH DNA的KBI-40104MD DiGeorge T-boxl(22q11)/22q13(SHANK3),應(yīng)用染色體原位熒光雜交技術(shù)(FISH)對染色體核型正常的34例肺動脈閉鎖患兒進(jìn)行TBX1微缺失檢測。 [結(jié)果]發(fā)現(xiàn)3例TBX1微缺失陽性患兒,陽性率為8.82%。 [結(jié)論]TBX1是22q11.2微缺失的核心基因,22q11.2微缺失是肺動脈閉鎖的主要致病原因之一,TBX1可能是肺動脈閉鎖易感基因。 第三部分全外顯子測序初步篩選右室流出道梗阻易感基因 [目的]對一個右室流出道梗阻家系中2名成員進(jìn)行全外顯子測序,進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,初步篩選右室流出道梗阻易感基因。 [方法]收集一個右室流出道梗阻家系中2名成員的靜脈血,采用life technology全外顯子捕獲試劑盒進(jìn)行捕獲,用Life technology solid5500x1高通量測序儀進(jìn)行高通量測序,測序結(jié)果與公共遺傳突變數(shù)據(jù)庫(db132SNP)及華中科技大學(xué)人類基因組中心正常人外顯子數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,過濾已報(bào)道的常見變異,再將單核苷酸非同義突變進(jìn)行整合,初步篩選出候選基因。 [結(jié)果]結(jié)果顯示過濾后落在外顯子區(qū)域的單核苷酸變異(SNP)數(shù)目外婆為42727個,孫子為38207個；過濾后落在外顯子區(qū)域未報(bào)道的單核苷酸變異數(shù)目外婆為4582個,孫子為4249個；通過ACCESS數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),有121個新發(fā)現(xiàn)單核苷酸變異同時存在于祖孫兩人的基因組中。同時使用華中科技大學(xué)人類基因組中心已有正常人外顯子對照數(shù)據(jù)庫進(jìn)行篩選,46個變異沒有在對照數(shù)據(jù)庫中發(fā)現(xiàn)。將46個變異輸入到使用ANNOVAR軟件預(yù)測可能有害的突變位點(diǎn),將候選基因范圍縮小到19個。 [結(jié)論]WNK1、KRTAP1-1、UBR2、EPS15、CKAP2、PIGB、DENND4A、 HYDIN、CNTN3、NDUFC2、SAMD9L、KIAA0825、C7orf58、NCKAP5、SPINK5、 FCRL3、TTN、MUC等19個基因可能是右室流出道梗阻易感基因,但須進(jìn)一步確認(rèn)。
[Abstract]:Chromosome karyotype analysis of pulmonary atresia Objective: to study the relationship between chromosomal abnormalities and pulmonary atresia in children with pulmonary atresia. [methods] 35 children with pulmonary atresia were detected with G-banded autosomes. [results] A case with trisomy 21 syndrome was found, and the karyotype of cochromosome was normal. [conclusion] trisomy 21 syndrome may be associated with pulmonary atresia, and chromosomal karyotype abnormalities are rare in children with pulmonary atresia, suggesting that routine chromosome karyotype analysis cannot be used to screen this serious complex congenital heart disease. Part II study of TBX1 microdeletion in pulmonary atresia [objective] to investigate the relationship between pulmonary atresia and TBX1 by detecting TBX1 microdeletion in children with pulmonary atresia. [methods] TBX1 microdeletions were detected in 34 children with pulmonary atresia with normal karyotype by using KBI-40104MD DiGeorge T-boxlus 22q11 / 22q13 SHANK3P from Poseidon FISH DNA of Kreatech Company, Netherlands, and fluorescence in situ hybridization (fish). [results] 3 cases of TBX1 microdeletion positive were found, the positive rate was 8.82%. [conclusion] TBX1, the core gene of 22q11.2 microdeletion, is one of the major causes of pulmonary atresia. TBX1 may be a susceptible gene for pulmonary atresia. Part III screening of susceptible genes for right Ventricular outflow tract obstruction by Total Exon sequencing [objective] two members of a family with right ventricular outflow tract obstruction (RVOO) were sequenced, the data were analyzed and the susceptibility genes of RVO were preliminarily screened. [methods] the venous blood of two members of a family with right ventricular outflow tract obstruction was collected and captured by life technology whole exon capture kit. High throughput sequencing was performed by Life technology solid5500x1 high throughput sequencing instrument. The results of sequencing were compared with the common genetic mutation database (Pb132SNPP) and the normal human exon database of the Human Genome Center of Huazhong University of Science and Technology. The reported common mutations were filtered, and the single nucleotide nonsynonymous mutations were integrated. Candidate genes were preliminarily screened. [results] the results showed that the number of single nucleotide mutation (SNPs) in exon region after filtration was 42727 for grandmother and 38207 for grandson, and 4582 for grandmother and 4249 for grandchild after filtering. By ACCESS data analysis, 121 new single nucleotide mutations were found in the genomes of both grandsons and grandsons. At the same time, 46 mutations were not found in the control database using the normal human exon control database in the Human Genome Center of Huazhong University of Science and Technology (Huazhong University of Science and Technology). 46 mutations were inputted to the potentially harmful mutation sites using ANNOVAR software, and the range of candidate genes was reduced to 19. [conclusion] the 19 genes WNK1, KRTAP1-1, UBR2, EPS15, CKAP2PIGBN4A, HYDINC CNTN3NUFC2SAMD9L, KIAA0825, NCKAP5SPINK5, FCRL3TTNMUC, etc., may be susceptible genes to right ventricular outflow tract obstruction, but need to be further confirmed.
【學(xué)位授予單位】：華中科技大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號】：R722.11

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本文編號：1877101