基因多態(tài)性與鐵營(yíng)養(yǎng)狀況及神經(jīng)管畸形的關(guān)聯(lián)性分析
本文選題:鐵 切入點(diǎn):葉酸 出處:《中國(guó)疾病預(yù)防控制中心》2016年博士論文
【摘要】:背景鐵是維持人體正常生理活動(dòng)的必需微量元素之一。以往研究認(rèn)為,人體鐵營(yíng)養(yǎng)狀況主要與環(huán)境和膳食因素有關(guān)。然而隨著對(duì)與鐵代謝相關(guān)基因認(rèn)識(shí)的不斷深入,單核苷酸多態(tài)性與人體鐵營(yíng)養(yǎng)狀況指標(biāo)之間的關(guān)聯(lián)性被相繼發(fā)現(xiàn),并被越來(lái)越多的研究所證實(shí)。然而,目前的有關(guān)數(shù)據(jù)基本來(lái)自于對(duì)西方人群的研究,而中國(guó)人的相關(guān)數(shù)據(jù)鮮有報(bào)道。因此,本課題旨在研究中國(guó)青少年人群基因多態(tài)性的與鐵營(yíng)養(yǎng)狀況的關(guān)系。葉酸介導(dǎo)一碳單位代謝途徑,相關(guān)基因的多態(tài)性可能是誘發(fā)神經(jīng)管畸形的危險(xiǎn)因素。本研究以中國(guó)漢族人群為研究對(duì)象,觀察BHMT、CUBN、FTCD、GAMT、 GART、SARDH、SHMT1和MUT基因上單核苷酸多態(tài)性對(duì)于神經(jīng)管畸形的作用。并首次對(duì)FTCD、GAMT和MUT基因在對(duì)神經(jīng)管畸形作用方面進(jìn)行了觀察。目的本研究立足于以往研究結(jié)果,觀察中國(guó)人群鐵營(yíng)養(yǎng)狀況及神經(jīng)管畸形相關(guān)的多態(tài)性位點(diǎn)的分布及關(guān)聯(lián),初步確定在中國(guó)人群中與鐵營(yíng)養(yǎng)狀況和神經(jīng)管畸形相關(guān)的基因多態(tài)性位點(diǎn)。方法鐵營(yíng)養(yǎng)狀況方面,本研究采用多階段整群隨機(jī)抽樣方法在廣東省肇慶市、四川省成都市、山東省汶上縣、寧夏回族自治區(qū)吳忠市、天津市和浙江省松陽(yáng)縣等6個(gè)地區(qū)共抽取農(nóng)村寄宿制學(xué)校中初中學(xué)一年級(jí)學(xué)生700名。分別檢測(cè)研究對(duì)象的Hb、SF、sTfR和CRP水平,以及納入研究的多態(tài)性位點(diǎn)的基因型。在以CRP5mg/L和基因分型結(jié)果對(duì)樣本進(jìn)行質(zhì)量控制并排除不合格樣本后,將進(jìn)入最終研究的研究對(duì)象不同基因型和等位基因進(jìn)行分組,比較各組之間生化指標(biāo)的水平差異。再按照貧血、SF25 ng/ml;sTfR≥4.4 mg/L分別設(shè)定鐵缺乏標(biāo)準(zhǔn),將研究對(duì)象分為病例組和對(duì)照組,通過(guò)率的比較得出不同基因型和等位基因之間的差異,計(jì)算OR值并評(píng)價(jià)其相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)。神經(jīng)管畸形研究方面,本研究通過(guò)臨床診斷分別遴選了270名對(duì)照組研究對(duì)象和192名病例組研究對(duì)象,并使用二代測(cè)序方法,對(duì)從研究對(duì)象腦組織中提取的DNA進(jìn)行SNP分析。分別采集了113名病例組研究對(duì)象和123名對(duì)照組研究對(duì)象的腦組織,使用化學(xué)發(fā)光免疫分析法對(duì)研究對(duì)象腦組織中的葉酸水平進(jìn)行測(cè)定。通過(guò)比較不同組別之間基因型和等位基因頻率差異,以及不同基因型之間葉酸水平的差異,確定中國(guó)人群中與神經(jīng)管畸形存在關(guān)聯(lián)的多態(tài)性位點(diǎn)。結(jié)果鐵營(yíng)養(yǎng)狀況研究中,有681名研究對(duì)象人最終進(jìn)入本研究,總體平均年齡13.80±1.13歲,性別之間年齡差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.05)�?傮wXG SF水平為51.94±1.86ng/mL,性別之間無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(p0.05)�?傮wXG sTfR水平為3.35±1.32mg/L,男性高于女性(p0.05)�?傮wXG CRP水平為0.35±2.51 mg/L,男性高于女性(p0.05)�?傮wHb水平為144.8±13.6g/L,男性人群Hb水平高于女性(p0.05)。根據(jù)基因型分型結(jié)果,候選的36個(gè)SNP位點(diǎn)中,共有24個(gè)位點(diǎn)進(jìn)入與鐵指標(biāo)的關(guān)聯(lián)性分析。TMPRSS6基因上rs855791位點(diǎn)的C等位基因是貧血的風(fēng)險(xiǎn)等位基因,與TT純合子攜帶者人群相比起OR值為3.93(p=0.017)。rs4820268位點(diǎn)A等位基因攜帶者人群的Hb水平高于GG純合子攜帶者人群(p=0.018);GG純合子攜帶者人群SF25ng/mL的率是AA純合子攜帶者人群的3.48倍(p=0.003),在等位基因分析中發(fā)現(xiàn),G等位基因是SF25ng/mL的風(fēng)險(xiǎn)等位基因;AA純合子基因型攜帶者人群1gsTfR水平低于AG和GG基因型攜帶者人群(p=0.001). BMP4基因上的rs4901474位點(diǎn)C等位基因攜帶者人群的1gSF水平高于TT純合子攜帶者人群(p=0.045)。TF基因上的rs1880669位點(diǎn)的A等位基因攜帶者人群sTfR≥4.4 mg/L的率與GG純合子攜帶者人群相比其OR值為2.41(p=0.012),該位點(diǎn)上A等位基因是sTfR≥4.4 mg/L的風(fēng)險(xiǎn)等位基因。HjV基因上的rs7536827位點(diǎn)的AA純合子攜帶者人群sTfR≥4.4 mg/L的率與T等位基因攜帶者人群相比其OR值為1.78(p=0.028),該位點(diǎn)上AA純合子是sTfR≥4.4 mg/L的風(fēng)險(xiǎn)等位基因。在線性回歸分析中,男性與Hb、1g SF和1gsTfR水平均呈正相關(guān)。TMPRSS6基因上的rs4820268與1g sTfR水平呈負(fù)相關(guān)。在Logistic回歸分析中,rMPRSS6基因上的rs855791和rs4820268分別與貧血和SF25ng/mL相關(guān),而HjV基因上的rs7536827位點(diǎn)上的T等位基因可能為鐵缺乏的保護(hù)性等位基因。神經(jīng)管畸形研究中,經(jīng)二代測(cè)序,8個(gè)候選基因上共檢測(cè)出818個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),其中214個(gè)位點(diǎn)符合條件最終進(jìn)入本研究。SARDH基因上的兩個(gè)相對(duì)獨(dú)立的位點(diǎn)rs2797840和rs2073817可能與神經(jīng)管畸形易感性存在關(guān)聯(lián)。在脊柱裂分組中,rs2797840上的稀有堿基G等位基因與其存在關(guān)聯(lián)(p=0.0348)。在葉酸水平分析中,rs2797840上的G等位基因與腦組織中葉酸升高相關(guān)。另外,rs2797840還存在于一些ENCODE調(diào)控區(qū)域,這表明該位點(diǎn)可能會(huì)對(duì)SARDH基因的表達(dá)產(chǎn)生影響。結(jié)論TMPRSS6基因、BMP4基因、TF基因和HjV基因與中國(guó)人群的鐵營(yíng)養(yǎng)狀況存在關(guān)聯(lián),其中TMPRSS6基因與Hb, SF和sTfR均關(guān)聯(lián),顯示出其多態(tài)性對(duì)于鐵營(yíng)養(yǎng)狀況影響較大,并且新發(fā)現(xiàn)了TF基因中的rs1880669位點(diǎn)與鐵營(yíng)養(yǎng)狀況存在關(guān)聯(lián)。SARDH基因上的rs2797840和rs2073817位點(diǎn)漢族人群中可能是神經(jīng)管畸形發(fā)生的指示指標(biāo),而rs2797840還可能是腦組織中葉酸水平的指示指標(biāo)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R153.2
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,本文編號(hào):1655008
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