手足口病病毒EV71衣殼蛋白VP1基因特征分析
本文關(guān)鍵詞: 手足口病 EV VP 同源性分析 出處:《中國病原生物學(xué)雜志》2017年10期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的分析幼童手足口病病毒EV71衣殼蛋白VP1基因特征,為手足口病臨床預(yù)防和控制提供指導(dǎo)。方法隨機收集604例手足口病幼童患者標(biāo)本,培養(yǎng)病毒株并分離鑒定。采用RT-PCR擴增EV71及其VP1區(qū)基因,經(jīng)基因產(chǎn)物測序分析毒株的核苷酸和氨基酸序列同源性。結(jié)果604例手足口病幼童患者標(biāo)本中,男性患者369例(61.09%)和女性235例(38.91%);(34.60%).1~歲179例(29.64%),2~歲216例(35.76%)和3~歲209例(34.60%)。共分離出病毒129株,分離率21.36%,其中EV71 61株(占47.29%),CoxA16 28株(占21.71%),其他腸道病毒40株(占31.01%)。61株EV71的VP1區(qū)基因序列間核苷酸同源性95.7%~100.0%,氨基酸同源性97.3%~100.0%。與C4a亞型代表株的核苷酸同源性96.4%~98.9%,氨基酸同源性99.0%~100.0%。與CoxA16原始株G-10、A、B基因型代表株VP1區(qū)以及C4b、C5亞型代表株的核苷酸同源性分別為66.0%~68.9%、78.6%~82.8%、83.2%~85.5%、95.2%~97.4%和84.5%~87.6%,氨基酸同源性分別為71.4%~75.7%、90.5%~93.6%、95.1%~96.0%、99.0%~99.8%和97.6%~99.4%。結(jié)論手足口病發(fā)病以3~4歲男性幼童為主,且以EV71為主。所分離的EV71流行株屬于C4亞型。
[Abstract]:Objective to analyze the characteristics of EV71 capsid protein VP1 gene of hand, foot and mouth disease virus in young children, and to provide guidance for clinical prevention and control of hand foot and mouth disease. Methods 604 samples of young children with hand foot and mouth disease were collected randomly. EV71 and its VP1 region gene were amplified by RT-PCR. The nucleotide and amino acid sequence homology of the virus strain was analyzed by sequencing the gene products. Results in 604 samples of young children with HFMD, the nucleotide and amino acid sequence homology was analyzed. A total of 129 virus strains were isolated from 369 male patients (61.09%) and 235 women (38.91 cases) and 179 cases (29.6464 years old, 179 cases) and 209 cases (3 ~ 209 cases), respectively. The isolation rate was 21.366.There were 61 strains of EV71 (47.29k.CoxA1628), 40 strains of other enterovirus (31.01%), 95.7% 100.0 homology of VP1 region, 97.3% amino acid homology, 96.498.9 nucleotide homology with C4a subtype representative strain, 96.498.9 amino acid homology, and 98.9% amino acid homology with C4a subtype representative strain. The nucleotide homology was 66.0% in the VP1 region and 68.0% in the C4bC5 subtype, respectively, and 82.82.83.25.5in the position of 95.297.4% and 84.57.6%, the amino acid homology was 71.4% 75.70.5% and 93.695%, respectively. The amino acid homology was 99.099.099.8% and 97.66.40.Conclusion Hand-mouth disease is mainly developed in 34-year-old male young children, and 96.099.099.099.40.ConclusionThe amino acid homology is 71.4% and 84.57.66.The amino acid homology is 71.4%, 95.70.5% and 93.65.95%, respectively, and the amino acid homology is 99.099.099.8% and 97.60.44%, respectively. The isolated EV71 strains belong to C4 subtype.
【作者單位】: 吉林大學(xué)珠海學(xué)院;
【基金】:廣東省教育廳“創(chuàng)新強校工程”項目(No.2016KQNCX209)
【分類號】:R725.1
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,本文編號:1506798
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