脆性X綜合征相關(guān)蛋白FMRP多個亞型的鑒定及其功能研究
發(fā)布時間:2017-11-26 02:01
本文關(guān)鍵詞:脆性X綜合征相關(guān)蛋白FMRP多個亞型的鑒定及其功能研究
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【摘要】:脆性X綜合征(Fragile X syndrome, FXS)是引起遺傳性智力低下的常見疾病之一。FMR1基因三核苷酸重復(fù)序列不穩(wěn)定擴(kuò)增導(dǎo)致脆性X智力低下蛋白(Fragile X mental retardation protein,,F(xiàn)MRP)表達(dá)的轉(zhuǎn)錄沉默是導(dǎo)致FXS的重要原因。已知FMRP的功能實現(xiàn)與其自身結(jié)構(gòu)域的功能和結(jié)構(gòu)密切相關(guān)。FMR1在多個物種都存在基因mRNA轉(zhuǎn)錄本的選擇性剪接,形成不同的轉(zhuǎn)錄本及蛋白亞型(isoform)。不同的FMRP亞型蛋白可能導(dǎo)致在表達(dá)和功能上的重要差異。mFMRP的主要亞型(isoform1)由17個外顯子編碼產(chǎn)生,其它的亞型與之相比均存在不同程度的外顯子序列缺失。最新研究鑒定了mFmr1的12種不同的轉(zhuǎn)錄本亞型;但目前為止大約有4-5種mFMRP亞型蛋白被鑒定出來。因為目前還沒有蛋白亞型特異性抗體,造成對亞型蛋白的具體功能知之甚少。 本研究采用RT-PCR結(jié)合測序的實驗方法,鑒定FVB近交系小鼠的胚胎鼠(E18)和成年鼠(P28)腦組織中mFmr1轉(zhuǎn)錄本亞型,比較各個亞型的使用頻率。然后采用生物信息學(xué)軟件預(yù)測這些轉(zhuǎn)錄本的開放閱讀框(ORF),分析各個亞型蛋白序列的差異。構(gòu)建體外表達(dá)包含V5標(biāo)簽融合亞型蛋白的質(zhì)粒,并通過蛋白印跡(Western Blotting)實驗分析各亞型在N1E-115、Neuro-2A、HEK-293細(xì)胞系中的分布情況,觀察不同亞型結(jié)構(gòu)對其自身分布的影響。從而探索mFMRP的潛在功能和調(diào)控機(jī)制。 我們發(fā)現(xiàn):1、在E18小鼠和P28小鼠全腦組織存在5種序列選擇性剪接模式,對選擇性剪接的發(fā)生位點選擇均符合GT-AG法則,形成了7種不同的mFmr1轉(zhuǎn)錄本亞型。2、mFmr1轉(zhuǎn)錄本亞型的分布具有發(fā)育時期特異性,在神經(jīng)發(fā)育的不同階段可能存在不同的優(yōu)勢類型,使得FMRP與RNA序列的識別和結(jié)合功能發(fā)生相應(yīng)變化,以適應(yīng)不同生長發(fā)育時期的特殊需要。3、同種mFMRP亞型蛋白在不同類型細(xì)胞系中的表達(dá)存在差異,在同一細(xì)胞系中不同亞型蛋白的分布也存在差異,提示不同的亞型蛋白因結(jié)構(gòu)的差異可使其表達(dá)和分布產(chǎn)生差異,影響功能表達(dá)。4、V5標(biāo)簽蛋白在融合蛋白的位置(N-端或C-端)不同影響亞型蛋白的表達(dá)和分布。 本研究鑒定了從小鼠腦組織中分離出的7個mFmr1轉(zhuǎn)錄本亞型,其中Isoform6為首次發(fā)現(xiàn)的亞型,并證實FMRP亞型蛋白在不同細(xì)胞系中的表達(dá)及分布存在差異,推測在NLS結(jié)構(gòu)域上可能存在關(guān)鍵的氨基酸殘基位點,可能影響FMRP的轉(zhuǎn)運(yùn)入核功能。本研究為進(jìn)一步探索mFMRP亞型的具體分布規(guī)律和翻譯調(diào)控機(jī)制提供了一定的基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:廣州醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R749.94
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