為明確辣椒葉脈黃化病毒(Pepper vein yellows virus,PeVYV)在貴州辣椒上的發(fā)生分布及其分子變異情況。用RT-PCR法對(duì)采自貴州省25個(gè)采樣地點(diǎn)的548份辣椒疑似病毒病樣品進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果表明:129份為陽(yáng)性樣品,檢出率為23.54%。將獲得的14個(gè)不同采樣點(diǎn)PeVYV分離物和已報(bào)道的中國(guó)和其他國(guó)家PeVYV分離物進(jìn)行序列比對(duì),P0基因核苷酸同源性為90.9%～100.0%,氨基酸相似性為97.7%～100.0%;CP基因核苷酸同源性為93.7%～100.0%,氨基酸相似性為97.9%～100.0%;MP基因核苷酸同源性為94.7%～100.0%,氨基酸相似性均為100.0%。在系統(tǒng)進(jìn)化樹中,有13個(gè)采樣點(diǎn)PeVYV分離物P0基因聚在一起,與中國(guó)分離物(KP326573)的親緣關(guān)系較近,而遵義播州PeVYV分離物與澳大利亞分離物的親緣關(guān)系較近。貴州所有PeVYV分離物CP基因與中國(guó)、澳大利亞、美國(guó)和西班牙分離物聚為一支,但不同采樣點(diǎn)的PeVYV分離物又聚為兩個(gè)不同的分支。而不同采樣點(diǎn)MP基因全部聚在一起,且與其他地區(qū)PeVYV分離物的差異不明顯。研究結(jié)果表明貴州...

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圖1田間辣椒病毒病葉片癥狀

調(diào)查發(fā)現(xiàn)，田間感染辣椒葉脈黃化病毒的辣椒葉片呈現(xiàn)黃化，花葉，扭曲或皺縮，發(fā)病后期枝條頂部葉片較小，不生長(zhǎng)；整個(gè)植株比正常植株矮�。▓D1）。2.2PeVYVRT-PCR擴(kuò)增結(jié)果

圖2PeVYV的P0、CP和MP基因擴(kuò)增產(chǎn)物圖1～14:14個(gè)辣椒病毒病樣品；15：陰性對(duì)照；16：陽(yáng)性對(duì)照。

用引物P0-F/R、CP-F/R和MP-F/R進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增，分別能擴(kuò)增出長(zhǎng)度為750、620和470bp的單一PCR產(chǎn)物片段（圖2）。2.3PeVYV在貴州辣椒主產(chǎn)區(qū)的發(fā)生情況

圖4基于PeVYV的CP基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析

從PeVYV分離物CP基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹（圖4）可知：貴州不同采樣地點(diǎn)的PeVYV分離物與中國(guó)、澳大利亞、美國(guó)和西班牙分離物聚為一簇群，其中，長(zhǎng)順、惠水、羅甸、安龍、興仁、播州和榕江的PeVYV分離物CP基因聚為一亞群，與中國(guó)親緣關(guān)系較近。思南、綏陽(yáng)、貴陽(yáng)、修文、安順、平壩和....

圖3基于PeVYV的P0基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析

將貴州14個(gè)不同采樣地檢出的PeVYV分離物與已報(bào)道世界各地的11個(gè)PeVYV分離物的P0、CP和MP基因構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹，以馬鈴薯卷葉病毒（Potatoleafrollvirus,PLRV）作為外群。結(jié)果表明：采用Neighbor-Joining聚類分析方法將所有Pe....

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