貴州辣椒葉脈黃化病毒分離物檢測及其P0、CP、MP基因進化分析
發(fā)布時間:2024-03-07 03:41
為明確辣椒葉脈黃化病毒(Pepper vein yellows virus,PeVYV)在貴州辣椒上的發(fā)生分布及其分子變異情況。用RT-PCR法對采自貴州省25個采樣地點的548份辣椒疑似病毒病樣品進行檢測。結(jié)果表明:129份為陽性樣品,檢出率為23.54%。將獲得的14個不同采樣點PeVYV分離物和已報道的中國和其他國家PeVYV分離物進行序列比對,P0基因核苷酸同源性為90.9%~100.0%,氨基酸相似性為97.7%~100.0%;CP基因核苷酸同源性為93.7%~100.0%,氨基酸相似性為97.9%~100.0%;MP基因核苷酸同源性為94.7%~100.0%,氨基酸相似性均為100.0%。在系統(tǒng)進化樹中,有13個采樣點PeVYV分離物P0基因聚在一起,與中國分離物(KP326573)的親緣關(guān)系較近,而遵義播州PeVYV分離物與澳大利亞分離物的親緣關(guān)系較近。貴州所有PeVYV分離物CP基因與中國、澳大利亞、美國和西班牙分離物聚為一支,但不同采樣點的PeVYV分離物又聚為兩個不同的分支。而不同采樣點MP基因全部聚在一起,且與其他地區(qū)PeVYV分離物的差異不明顯。研究結(jié)果表明貴州...
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【部分圖文】:
本文編號:3921335
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圖1田間辣椒病毒病葉片癥狀
調(diào)查發(fā)現(xiàn),田間感染辣椒葉脈黃化病毒的辣椒葉片呈現(xiàn)黃化,花葉,扭曲或皺縮,發(fā)病后期枝條頂部葉片較小,不生長;整個植株比正常植株矮小(圖1)。2.2PeVYVRT-PCR擴增結(jié)果
圖2PeVYV的P0、CP和MP基因擴增產(chǎn)物圖1~14:14個辣椒病毒病樣品;15:陰性對照;16:陽性對照。
用引物P0-F/R、CP-F/R和MP-F/R進行RT-PCR擴增,分別能擴增出長度為750、620和470bp的單一PCR產(chǎn)物片段(圖2)。2.3PeVYV在貴州辣椒主產(chǎn)區(qū)的發(fā)生情況
圖4基于PeVYV的CP基因的系統(tǒng)進化分析
從PeVYV分離物CP基因的系統(tǒng)進化樹(圖4)可知:貴州不同采樣地點的PeVYV分離物與中國、澳大利亞、美國和西班牙分離物聚為一簇群,其中,長順、惠水、羅甸、安龍、興仁、播州和榕江的PeVYV分離物CP基因聚為一亞群,與中國親緣關(guān)系較近。思南、綏陽、貴陽、修文、安順、平壩和....
圖3基于PeVYV的P0基因的系統(tǒng)進化分析
將貴州14個不同采樣地檢出的PeVYV分離物與已報道世界各地的11個PeVYV分離物的P0、CP和MP基因構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,以馬鈴薯卷葉病毒(Potatoleafrollvirus,PLRV)作為外群。結(jié)果表明:采用Neighbor-Joining聚類分析方法將所有Pe....
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