Alfin-like (AL)轉錄因子家族對高鹽、低溫、干旱等非生物脅迫反應具有重要的調控作用。該研究采用同源比對的方法檢索鑒定葡萄AL轉錄因子家族基因、分析其生物信息學特性,并采用qRT-PCR方法分析非生物脅迫下AL基因的表達特征,以探究葡萄AL基因在非生物逆境脅迫中的功能。結果表明:(1)在葡萄中共鑒定出6個AL基因家族成員,分別命名為VvAL1～VvAL6,且6個成員分別分布在6條染色體上。(2)葡萄中AL轉錄因子具有高度保守的DUF3594結構域和PHD結構域,各家族成員均含有5個外顯子和4個內含子;上游啟動子區(qū)域分析發(fā)現大量植物激素與非生物脅迫響應相關的順式作用元件。(3)基因芯片表達模式分析顯示,鹽、干旱、ABA脅迫以及低溫(5℃)處理均顯著影響葡萄AL家族基因(VvAL1～VvAL6)的表達。(4)qRT-PCR檢測顯示,不同脅迫處理下AL基因在葡萄葉片中的表達水平不同;ABA處理下葡萄AL轉錄因子家族基因表達量較對照均顯著下調,但在PEG處理下差異不顯著;在鹽脅迫處理下,VvAL2、VvAL4、VvAL5基因的表達量均顯著上調,分別是對照的23倍、8.5倍和10.5倍...

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圖2葡萄中AL家族基因的結構域分析

利用AL基因家族成員單獨構建的進化樹、外顯子-內含子結構及保守基序信息繪制圖譜(圖4),在圖4,a中,AL基因家族單獨構建的進化樹與之前一致。圖4,b由GSDS在線分析,葡萄AL家族各基因均含有5個外顯子和4個內含子,基因結構相似,基因結構完整。通過MEME軟件在葡萄AL家族基....

圖4葡萄AL家族基因結構和保守基序分析

圖7葡萄AL基因家族在不同處理下的

圖5葡萄AL基因啟動子區(qū)域的順式作用元件分布

圖4葡萄AL家族基因結構和保守基序分析圖6葡萄AL基因家族基因芯片表達分析

圖6葡萄AL基因家族基因芯片表達分析

圖5葡萄AL基因啟動子區(qū)域的順式作用元件分布2.6.2葡萄AL轉錄因子家族應答ABA脅迫表達模式

本文編號：3911813