赤霞珠葡萄果實(shí)蘋果酸生物合成關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子的篩選與鑒定
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【部分圖文】:
圖1植物蘋果酸生物合成途徑
qRT-PCR驗(yàn)證和有機(jī)酸含量分析用樣本分別采集于賀蘭山東麓玉泉營(yíng)、原隆村立蘭酒莊和賀蘭縣銀色高地酒莊,采集方法同上。為提高數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性,4個(gè)果實(shí)發(fā)育時(shí)期各采樣2次,分別為硬果期(花后13d,28d)、綠果期(花后43d,58d)、轉(zhuǎn)色期(花后73d,88d)和成....
圖2赤霞珠果實(shí)發(fā)育時(shí)期3種有機(jī)酸含量變化
根據(jù)‘赤霞珠’果實(shí)發(fā)育時(shí)期樣本轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果,對(duì)所有基因CDS上游啟動(dòng)子區(qū)域(靶元件)進(jìn)行分析及關(guān)聯(lián)轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè),共獲得可能與蘋果酸生物合成途徑12種功能基因結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子6411個(gè),其中FH的3個(gè)功能基因有86個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,MDH的10個(gè)功能基因有717個(gè)轉(zhuǎn)錄因子。2.3果實(shí)....
圖3‘赤霞珠’果實(shí)3種有機(jī)酸含量不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)差異基因分析
結(jié)合上述轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)結(jié)果、與有機(jī)酸含量變化顯著關(guān)聯(lián)的差異表達(dá)基因以及WGCNA分析篩選出的與有機(jī)酸含量變化一致模塊中的基因,通過Venn分析進(jìn)一步篩選出了與蘋果酸生物合成具有高度相關(guān)性的轉(zhuǎn)錄因子。FH的3個(gè)功能基因?qū)?yīng)的轉(zhuǎn)錄因子分別有3、5和2個(gè);MDH的4個(gè)功能基因?qū)?yīng)的轉(zhuǎn)錄....
圖4‘赤霞珠’果實(shí)基因表達(dá)量與有機(jī)酸含量
圖3‘赤霞珠’果實(shí)3種有機(jī)酸含量不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)差異基因分析2.6關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子qRT-PCR驗(yàn)證
本文編號(hào):3909006
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