以一年生實(shí)生山桃苗為試材,通過正常培養(yǎng)、干旱脅迫以及干旱脅迫下外施脫落酸(ABA)的山桃葉片進(jìn)行高通量轉(zhuǎn)錄組測序分析,探究山桃響應(yīng)干旱脅迫的分子機(jī)制,篩選響應(yīng)ABA處理的功能基因。結(jié)果表明:試驗(yàn)共構(gòu)建9個文庫進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。轉(zhuǎn)錄組測序共獲得67.14 Gb Clean Data,各樣品Clean Data均達(dá)到5.81 Gb,Q30堿基百分比在91.71%及以上。與對照相比,干旱處理組差異表達(dá)基因顯著上調(diào)596個,下調(diào)1 025個。與干旱處理組相比,干旱+ABA處理組差異表達(dá)基因顯著上調(diào)394個,下調(diào)117個。GO富集分析表明:對照組、干旱處理組和干旱+ABA處理組在生物學(xué)途徑中富集最多的類別都是代謝過程;在細(xì)胞組件和分子功能中, 3個不同處理組富集最多的基因類別均是細(xì)胞組分和催化活性相關(guān)的基因。KEGG富集分析表明:與對照相比,干旱處理組的樣本有260個差異表達(dá)基因參與72條代謝途徑;與干旱處理組相比,干旱+ABA處理組的樣本有66個差異表達(dá)基因參與了38條代謝途徑。經(jīng)KEGG顯著性富集分析,篩選到淀粉和蔗糖代謝、植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等相關(guān)基因。采用實(shí)時熒光定量PCR對篩選到的基因進(jìn)行了...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 山桃總RNA的提取及c DNA的合成
    1.3 質(zhì)量文庫的評估
    1.4 差異基因篩選
    1.5 差異表達(dá)基因的功能注釋與富集分析
    1.6 差異表達(dá)基因熒光定量PCR分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    2.1 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量分析
    2.2 樣本基因的注釋和差異表達(dá)基因的篩選分析
    2.3 差異表達(dá)基因的Gene Ontology富集分析
    2.4 差異表達(dá)基因的KEGG注釋
    2.5 關(guān)鍵基因的差異表達(dá)分析
3 討論



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