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蘿卜病毒病小RNA分析及資源抗性表現(xiàn)

發(fā)布時(shí)間:2023-11-15 19:24
  病毒病是為害蘿卜的主要病害之一。基于核酸檢測的植物病毒病檢測技術(shù),因其檢測范圍廣、靈敏度高、適合大批量檢測而得以廣泛應(yīng)用。本試驗(yàn)利用小RNA高通量測序方法鑒定蘿卜病毒病的種類,并調(diào)查分析了264份蘿卜核心種質(zhì)資源及育種品系對(duì)病毒病的抗性。結(jié)果表明:蘿卜病毒病的主要病原為蕪菁花葉病毒(TuMV)。參試的核心種質(zhì)資源和品系多數(shù)表現(xiàn)出較好的抗性,且不同品系姊妹系間抗性表現(xiàn)基本趨于一致。田間抗病性調(diào)查結(jié)果顯示:抗病材料有103份,高抗材料有64份,且有25份材料達(dá)到免疫。

【文章頁數(shù)】:7 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 病毒病小RNA分析
        1.2.1 總RNA的提取
        1.2.2 構(gòu)建小RNA文庫及反轉(zhuǎn)錄合成cDNA
        1.2.3 高通量測序和生物信息學(xué)分析
        1.2.4 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制
        1.2.5 sRNA分類注釋及拼接
    1.3 蘿卜種質(zhì)資源抗病性調(diào)查
        1.3.1 播種及田間管理
        1.3.2 病情分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)與病情指數(shù)調(diào)查
2 結(jié)果與分析
    2.1 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制及產(chǎn)出
        2.1.1 測序堿基質(zhì)量值統(tǒng)計(jì)
        2.1.2 測序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)
    2.2 蘿卜病毒病種類的分子鑒定
        2.2.1 sRNA分類注釋
        2.2.2 sRNA拼接
        2.2.3 拼接contigs分類注釋
    2.3 蘿卜核心種質(zhì)資源及育種品系對(duì)病毒病的抗性表現(xiàn)
3 結(jié)論與討論
    3.1 蘿卜病毒病的分子鑒定
    3.2 蘿卜核心種質(zhì)資源及育種品系對(duì)病毒病的抗性表現(xiàn)



本文編號(hào):3864362

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