丁香假單胞菌獼猴桃致病變種(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,簡稱Psa)是引起獼猴桃細(xì)菌性潰瘍病的病原菌。對從感染潰瘍病的東紅獼猴桃枝條中分離得到的1株P(guān)sa野生株(命名為GX05)進行全基因組測序,獲得基因組草圖,分析其中毒力基因、耐藥基因和致病基因的情況。研究發(fā)現(xiàn),多位點序列分型結(jié)果顯示GX05為biovar 3,與毒力因子數(shù)據(jù)庫比對,GX05攜帶99種毒力因子及692個相關(guān)毒力基因,同源性和匹配度最高的毒力因子是PvdL和Irp1;與綜合抗生素抗性基因數(shù)據(jù)庫比對,GX05攜帶336種耐藥基因,與29種抗生素有關(guān);與病原宿主互作數(shù)據(jù)庫比對,不表達(dá)導(dǎo)致病原菌致病力減弱的基因數(shù)量最多,其中同源性和匹配度最高的是PvdL,此外與增強致病力相關(guān)的同源性和匹配度最高的基因是hrcC。通過全基因組測序信息初步分析了1株三型Psa菌株中存在的毒力、耐藥及致病基因情況,對深入研究其致病機制和合理用藥有重要意義。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 菌株的分離純化
    1.2 菌株基因組DNA的提取與菌種鑒定
    1.3 煙草過敏反應(yīng)
    1.4 抗生素敏感性試驗
    1.5 GX05全基因組測序
2 結(jié)果與分析
    2.1 Psa菌株的分離與鑒定
    2.2 煙草過敏反應(yīng)
    2.3 抗生素敏感性試驗結(jié)果
    2.4 Psa菌株GX05全基因組測序結(jié)果
    2.5 Psa菌株GX05毒力因子分析
    2.6 Psa菌株GX05耐藥基因分析
    2.7 Psa菌株GX05致病基因分析
3 討論與結(jié)論



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