發(fā)布時間：2022-12-18 00:53

　　該試驗旨在通過生物信息學(xué)方法分析沙特番茄黃化曲葉病毒AC2基因編碼的轉(zhuǎn)錄激活蛋白TrAP（transcriptional activator protein）的結(jié)構(gòu)及功能。該文通過在線軟件預(yù)測和分析了番茄中AC2基因編碼蛋白的一級結(jié)構(gòu)、二級結(jié)構(gòu)、磷酸位點、糖基位點、三級結(jié)構(gòu)及其重要的功能;通過最大似然法對不同物種AC2基因編碼蛋白序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析。結(jié)果表明:番茄中AC2基因共編碼135個氨基酸,且編碼蛋白屬于不穩(wěn)定的親水性蛋白質(zhì);二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲折疊為主,比例為58.52%;該蛋白不存在跨膜結(jié)構(gòu)域,屬非跨膜蛋白且不存在信號肽;該蛋白1～129個氨基酸區(qū)域為雙生病毒超基因家族（Gemini_AL2 superfamily）結(jié)構(gòu)域;系統(tǒng)進(jìn)化情況和植物分類學(xué)基本一致,沙特番茄雙生病毒AC2基因與南非木薯間的親緣關(guān)系最近。該基因編碼蛋白結(jié)構(gòu)與功能的分析為進(jìn)一步研究AC2雙生病毒基因家族奠定了基礎(chǔ),同時為番茄抗病在病蟲害防治方面提供一種可行的思路。 

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 序列來源
    1.2 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析預(yù)測
        1.2.1 一級結(jié)構(gòu)
        1.2.2 二級結(jié)構(gòu)
        1.2.3磷酸化位點和糖基化位點預(yù)測
        1.2.4 結(jié)構(gòu)域預(yù)測
        1.2.5 三級結(jié)構(gòu)
    1.3 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
    2.1 沙特番茄黃化曲葉病毒Tr AP氨基酸序列
    2.2 蛋白結(jié)構(gòu)分析
        2.2.1 一級結(jié)構(gòu)
        2.2.2 二級結(jié)構(gòu)分析預(yù)測
        2.2.3磷酸化位點和糖基化位點預(yù)測
        2.2.4 結(jié)構(gòu)域預(yù)測
        2.2.5 三級結(jié)構(gòu)
    2.3 AC基因編碼蛋白的系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]營養(yǎng)液濃度對番茄生長、品質(zhì)以及耐貯性的影響[J]. 曹玉鑫,曹紅霞,王萍,吳宣毅.  食品科學(xué). 2018(07)
[2]甘南牦牛H-FABP基因CDS區(qū)多態(tài)性及生物信息學(xué)分析[J]. 曹健,羅玉柱,胡江,劉秀,李少斌,吳應(yīng)童.  甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(04)
[3]豬T細(xì)胞受體β鏈基因的克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 李玩生,劉磊,馮海燕,房永祥,景志忠.  甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2010(03)
[4]河豚4SNc-Tudor蛋白的鑒定及生物信息分析[J]. 徐慶剛,陸健,鄭建洲,陳華友,陳克平.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(03)
[5]棉花曲葉病毒反式作用因子AC2的功能初探[J]. 謝迎秋,孟蒙,朱禎,吳茜,徐鴻林,劉玉樂.  植物學(xué)報. 2001(05)



本文編號：3720996