魏可葡萄氣生根發(fā)育的轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時間:2022-09-27 12:50
葡萄氣生根是在高溫高濕環(huán)境下老蔓上發(fā)育形成的一種特殊根系類型,發(fā)育程度較低,具有分化潛力。通過技術(shù)手段誘導(dǎo)魏可葡萄當(dāng)年生結(jié)果枝莖節(jié)處萌發(fā)氣生根,以同一結(jié)果母枝未處理莖節(jié)為對照進(jìn)行根系轉(zhuǎn)錄基因表達(dá)情況分析,結(jié)果表明,誘導(dǎo)氣生根發(fā)育過程中有3 989個基因表達(dá)量上升,2 830個基因表達(dá)量下調(diào)。采用GO功能分類,可將注釋的基因劃分為40個功能類別,包括催化活性、結(jié)合和代謝過程等。部分根系關(guān)鍵基因表達(dá)結(jié)果表明,生長素、赤霉素、脫落酸在內(nèi)的所有植物激素都參與了調(diào)控過程,結(jié)合生長素下游相應(yīng)基因分析,內(nèi)切葡聚糖酶基因、PRE基因和高親和力硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)體基因在氣生根發(fā)育過程中顯著上調(diào)表達(dá),表明降解莖節(jié)處表皮細(xì)胞壁、利用硝酸鹽在莖節(jié)處富集刺激根芽萌發(fā)是氣生根生長發(fā)育調(diào)控機(jī)理之一。
【文章頁數(shù)】:11 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料準(zhǔn)備
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 RNA提取及處理
1.2.2 文庫構(gòu)建及測序
1.2.3 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)組裝及基因功能注釋
2 結(jié)果與分析
2.1 葡萄根系轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)組裝
2.2 參考基因組對比
2.3 可變剪切分析
2.4 基因表達(dá)分析
2.5 基因功能注釋
2.6 差異基因KEGG富集分析
2.7 生長素響應(yīng)基因分析
2.8 脫落酸代謝調(diào)控
2.9 高表達(dá)基因分析
3 討論與結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]葡萄二次果的誘導(dǎo)及水培盆景培育技術(shù)[J]. 葛金濤,吳秋月,王金生,趙文靜,曹燕妮,劉興滿. 中外葡萄與葡萄酒. 2019(04)
[2]生長素合成、運(yùn)輸和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控植物胚胎早期發(fā)育[J]. 馬俊杰,郭鳳丹,王興軍,侯蕾. 植物生理學(xué)報. 2019(05)
[3]葡萄SAUR基因家族鑒定與生物信息學(xué)分析[J]. 李傲,崔夢杰,陳珂,許瀛之,賈海峰,房經(jīng)貴. 植物遺傳資源學(xué)報. 2018(02)
[4]植物應(yīng)答非生物脅迫信號傳導(dǎo)研究進(jìn)展[J]. 劉鈴,武小龍,諸葛強(qiáng). 分子植物育種. 2018(02)
[5]脫落酸調(diào)控植物根系生長發(fā)育的研究進(jìn)展[J]. 朱曉琛,張漢馬,南文斌. 植物生理學(xué)報. 2017(07)
[6]蘋果生長素輸入載體MdAUX1的基因克隆及在擬南芥和煙草中的遺傳轉(zhuǎn)化[J]. 安建平,王小非,劉鑫,李浩浩,由春香,郝玉金. 植物研究. 2016(06)
[7]水稻根系遺傳特征研究進(jìn)展[J]. 王會民,唐秀英,龍啟樟,黃永蘭,蘆明,徐曉明,魏遠(yuǎn)矚,萬建林. 分子植物育種. 2016(04)
[8]植物硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白研究進(jìn)展[J]. 張合瓊,張漢馬,梁永書,南文斌. 植物生理學(xué)報. 2016(02)
[9]葡萄生長素響應(yīng)基因家族生物信息學(xué)鑒定和表達(dá)分析[J]. 袁華招,趙密珍,吳偉民,于紅梅,錢亞明,王壯偉,王西成. 遺傳. 2015(07)
[10]植物生長素原初響應(yīng)基因Aux/IAA研究進(jìn)展[J]. 司馬曉嬌,鄭炳松. 浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報. 2015(02)
本文編號:3681092
【文章頁數(shù)】:11 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料準(zhǔn)備
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 RNA提取及處理
1.2.2 文庫構(gòu)建及測序
1.2.3 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)組裝及基因功能注釋
2 結(jié)果與分析
2.1 葡萄根系轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)組裝
2.2 參考基因組對比
2.3 可變剪切分析
2.4 基因表達(dá)分析
2.5 基因功能注釋
2.6 差異基因KEGG富集分析
2.7 生長素響應(yīng)基因分析
2.8 脫落酸代謝調(diào)控
2.9 高表達(dá)基因分析
3 討論與結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]葡萄二次果的誘導(dǎo)及水培盆景培育技術(shù)[J]. 葛金濤,吳秋月,王金生,趙文靜,曹燕妮,劉興滿. 中外葡萄與葡萄酒. 2019(04)
[2]生長素合成、運(yùn)輸和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控植物胚胎早期發(fā)育[J]. 馬俊杰,郭鳳丹,王興軍,侯蕾. 植物生理學(xué)報. 2019(05)
[3]葡萄SAUR基因家族鑒定與生物信息學(xué)分析[J]. 李傲,崔夢杰,陳珂,許瀛之,賈海峰,房經(jīng)貴. 植物遺傳資源學(xué)報. 2018(02)
[4]植物應(yīng)答非生物脅迫信號傳導(dǎo)研究進(jìn)展[J]. 劉鈴,武小龍,諸葛強(qiáng). 分子植物育種. 2018(02)
[5]脫落酸調(diào)控植物根系生長發(fā)育的研究進(jìn)展[J]. 朱曉琛,張漢馬,南文斌. 植物生理學(xué)報. 2017(07)
[6]蘋果生長素輸入載體MdAUX1的基因克隆及在擬南芥和煙草中的遺傳轉(zhuǎn)化[J]. 安建平,王小非,劉鑫,李浩浩,由春香,郝玉金. 植物研究. 2016(06)
[7]水稻根系遺傳特征研究進(jìn)展[J]. 王會民,唐秀英,龍啟樟,黃永蘭,蘆明,徐曉明,魏遠(yuǎn)矚,萬建林. 分子植物育種. 2016(04)
[8]植物硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白研究進(jìn)展[J]. 張合瓊,張漢馬,梁永書,南文斌. 植物生理學(xué)報. 2016(02)
[9]葡萄生長素響應(yīng)基因家族生物信息學(xué)鑒定和表達(dá)分析[J]. 袁華招,趙密珍,吳偉民,于紅梅,錢亞明,王壯偉,王西成. 遺傳. 2015(07)
[10]植物生長素原初響應(yīng)基因Aux/IAA研究進(jìn)展[J]. 司馬曉嬌,鄭炳松. 浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報. 2015(02)
本文編號:3681092
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