膠孢炭疽菌（Colletotrichum gloeosporioides）是引發(fā)芒果（Mangifera indica）炭疽病的主要病原體。室內(nèi)平板培養(yǎng)膠孢炭疽菌不產(chǎn)生或產(chǎn)生很少分生孢子的情況時有發(fā)生,但菌絲在機械損傷后24–48小時會產(chǎn)生大量分生孢子。膠孢炭疽菌應(yīng)答機械損傷誘導(dǎo)產(chǎn)孢的核心基因及關(guān)鍵代謝通路尚未見報道。基于轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-seq）技術(shù)檢測了芒果膠孢炭疽菌菌絲在機械損傷處理后2小時內(nèi)5個時間點的基因表達(dá)變化,對差異表達(dá)基因進(jìn)行GO富集和KEGG代謝通路富集分析,并對菌絲響應(yīng)脅迫的基因動態(tài)表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析�；诔Ｎ⒎址匠蘋DE模型結(jié)合變量選擇技術(shù),構(gòu)建了動態(tài)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果表明,有417個差異表達(dá)基因參與應(yīng)答膠孢炭疽菌菌絲機械損傷,分屬12個聚類模塊,有4條通路存在顯著富集,分別是丙酮酸代謝、硫代謝、黃曲霉素合成途徑和二萜合成途徑。結(jié)合功能注釋篩選出12個應(yīng)答菌絲損傷脅迫的核心基因。研究結(jié)果為后續(xù)深入開展芒果膠孢炭疽菌產(chǎn)孢和致病機理研究奠定了重要基礎(chǔ)。 

【文章頁數(shù)】：13 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 供試菌株
    1.2 機械損傷處理菌絲轉(zhuǎn)錄組樣品制備方法
    1.3 RNA提取及高通量測序文庫構(gòu)建
    1.4 序列分析及注釋
    1.5 差異基因篩選與功能富集分析
    1.6 聚類分析
    1.7 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
    1.8 實時熒光定量PCR分析
    1.9 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與討論
    2.1 測序結(jié)果和統(tǒng)計
    2.2 差異基因篩選與富集
    2.3 基因表達(dá)模式解析
    2.4 聚類模塊的生物學(xué)富集
    2.5 脅迫響應(yīng)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
    2.6 應(yīng)答損傷脅迫基因的動態(tài)表達(dá)模式驗證
    2.7 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]柱花草膠孢炭疽菌基因組、轉(zhuǎn)錄組測序及致病相關(guān)基因CgALS分析研究[D]. 黃華平.海南大學(xué) 2016
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碩士論文
[1]芒果膠孢炭疽病菌遺傳轉(zhuǎn)化體系的建立[D]. 李偉.華南熱帶農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004



本文編號：3667174