【目的】生長調(diào)控因子（Growth-regulating factors,GRF）是植物特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,在植物生長發(fā)育和抗逆防御過程中發(fā)揮著重要作用。為揭示香蕉GFR基因等功能,對小果野蕉生長調(diào)控因子（MaGRF）基因家族進行全基因組鑒定和分析,并研究其在香蕉果實成熟和低溫脅迫應(yīng)答過程中的表達模式�！痉椒ā渴褂蒙镄畔W(xué)軟件對MaGRFs家族成員進行全基因組鑒定和分析,基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析MaGRFs在自然成熟和乙烯催熟的香蕉果實成熟過程及4℃低溫處理葉片中的表達情況。【結(jié)果】共鑒定獲得可歸為4個亞家族的20個MaGRF成員,其中15個成員被預(yù)測為miRNA396的靶基因。MaGRFs啟動子上存在大量的植物激素、脅迫響應(yīng)以及生長發(fā)育相關(guān)的順式作用元件和9種轉(zhuǎn)錄因子家族的結(jié)合位點。轉(zhuǎn)錄組結(jié)果顯示,MaGRF7在自然成熟的果實中高水平表達;MaGRF13在自然成熟和乙烯催熟的果實中均高表達;屬于第Ⅰ和第Ⅱ亞家族的多個MaGRFs在果實成熟過程中差異表達顯著;低溫處理顯著誘導(dǎo)MaGRF9、14、15、18和19的表達,顯著抑制MaGRF2、6和13的表達�！窘Y(jié)論】香蕉GRF家族成員較多,它... 

【文章來源】：果樹學(xué)報. 2020,37(12)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：15 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 Ma GRFs基因家族成員鑒定及蛋白理化特性分析
    1.2 Ma GRF家族成員系統(tǒng)進化樹分析
    1.3 Ma GRF基因家族成員共線性及Ka/Ks值分析
    1.4 Ma GRFs基因結(jié)構(gòu)和編碼蛋白保守基序分析
    1.5 Ma GRFs啟動子順式作用元件和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點預(yù)測
    1.6 靶定Ma GRF的香蕉mi RNA預(yù)測
    1.7 Ma GRFs基因表達分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 香蕉GRF家族成員鑒定及編碼蛋白基本理化性質(zhì)分析
    2.2 香蕉GRF家族系統(tǒng)進化樹分析
    2.3 染色體定位和共線性分析
    2.4 Ma GRF基因結(jié)構(gòu)分析
    2.5 香蕉GRF蛋白保守基序分析
    2.6 Ma GRF基因啟動子順式元件分析
    2.7 Ma GRF基因啟動子區(qū)域轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點分析
    2.8 Ma GRF家族成員被mi RNA靶標(biāo)情況預(yù)測結(jié)果
    2.9 Ma GRF基因表達分析
3 討論
    3.1 香蕉GRF成員數(shù)較多
    3.2 不同Ma GRF亞家族成員功能差異較大
    3.3 Ma GRFs的表達受到多種因素的調(diào)控
4 結(jié)論


【參考文獻】：
期刊論文
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[3]香蕉Aux/IAA基因家族的全基因組鑒定及表達分析[J]. 孫雪麗,劉范,田娜,項蕾蕾,郝向陽,王云,彭麗云,王天池,程春振,賴鐘雄.  園藝學(xué)報. 2019(10)
[4]龍眼GRF家族全基因組鑒定及表達模式[J]. 劉蒲東,張舒婷,陳曉慧,蘇立遙,姚德恒,李漢生,張梓浩,陳裕坤,林玉玲,賴鐘雄.  應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報. 2020(02)
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[6]茶樹GRF基因家族的全基因組鑒定及表達分析[J]. 王鵬杰,鄭玉成,林浥,周珍,楊江帆,葉乃興.  西北植物學(xué)報. 2019(03)
[7]三明野生蕉抗寒特性的形態(tài)學(xué)與生理生化研究[J]. 李丹,黃玉吉,朱寧,劉范,田娜,徐涵,程春振,賴鐘雄.  果樹學(xué)報. 2019(01)
[8]毛竹GRF轉(zhuǎn)錄因子家族的全基因組鑒定與分析[J]. 何龍燕,劉武陽,婁永峰,肖復(fù)明.  植物科學(xué)學(xué)報. 2018(05)
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[10]GRF轉(zhuǎn)錄因子對植物生長發(fā)育及脅迫響應(yīng)調(diào)控的分子機制[J]. 馬超,原佳樂,張?zhí)K,賈琦石,馮雅嵐.  核農(nóng)學(xué)報. 2017(11)



本文編號：3642252