利用草莓基因組數(shù)據(jù)鑒定出15個(gè)草莓RPW8同源基因（FaRPW8.1,FaRPW8.2-1～14）,它們之間的堿基比例差異較小,但編碼蛋白的相對(duì)分子量相差較大,范圍為14734.20～196956.90Da,理論等電點(diǎn)5.05～8.52,不穩(wěn)定性指數(shù)范圍39.35～53.50,脂肪族指數(shù)介于93.19～108.68之間,氨基酸組成中以亮氨酸（Leu）和賴氨酸（Lys）為主。保守結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果顯示草莓RPW8同源基因含有1～4個(gè)結(jié)構(gòu)域,其中RPW8為特征結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,FaRPW8.2-12和FaRPW8.2-13同谷子、小麥、水稻RPW8聚為一類,FaRPW8.2-3與番茄、蜜柑、橙子等RPW8基因聚為一類,其余12個(gè)草莓RPW8基因同源基因與其它物種的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),單獨(dú)聚為一類。研究結(jié)果可為草莓抗病育種提供理論依據(jù)。 

【文章來源】：唐山師范學(xué)院學(xué)報(bào). 2020,42(06)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

草莓RPW8同源基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)域分析

基于草莓基因組獲得了15個(gè)草莓的RPW8同源基因，在數(shù)量上多于擬南芥（6個(gè)）、油菜（7個(gè)）、桃子（12個(gè)）和梨（12個(gè)），略低于杏[9,11,13](16個(gè)），說明RPW8基因在草莓基因組有所擴(kuò)展，說明草莓基因組中具有較深厚的白粉病抗性潛力，如果加以合理利用，將對(duì)草莓的抗病育種有很大貢獻(xiàn)。草莓RPW8同源基因主要位于LG5和LG6染色體，僅有個(gè)別基因位于其它染色體上，說明在進(jìn)化上可能由于基因重復(fù)、插入、缺失、交換等事件的發(fā)生，使RPW8基因得以擴(kuò)增并發(fā)生了序列上的變化。草莓的RPW8同源基因G+C含量（平均42.3%）低于A+T含量（平均57.6%),(A+T)/(G+C)為1.36，該研究結(jié)果與杏RPW8同源基因相似[11][G+C含量41.1%,A+T含量58.8%,(A+T)/(G+C)為1.43]，推測(cè)(A+T)/(G+C)可能為RPW8基因的核酸序列重要特征之一。

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號(hào)：3604204