枇杷有色體特異番茄紅素β-環(huán)化酶基因的克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-11 21:53
為了解枇杷有色體特異番茄紅素β-環(huán)化酶基因(CYC-B)的序列及表達(dá)特點(diǎn),本研究以‘大五星’(紅肉)和‘川農(nóng)1-5-9’(白肉)枇杷為材料,采用同源克隆法,從枇杷果實(shí)中克隆了類胡蘿卜素生物合成途徑中關(guān)鍵酶基因之一(CYC-B的c DNA全長(zhǎng)序列),運(yùn)用生物學(xué)軟件對(duì)該序列及推導(dǎo)的氨基酸序列進(jìn)行相關(guān)生物信息學(xué)分析,同時(shí)利用熒光定量PCR技術(shù)探究CYC-B基因在枇杷果實(shí)不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)模式。結(jié)果顯示,該基因全長(zhǎng)1 579 bp,具有1 491 bp的完整開放閱讀框,編碼496個(gè)氨基酸。氨基酸同源性分析表明,該基因編碼的氨基酸序列與白梨(XP009377819.1)和蘋果(Malus domestica) CYC-B基因(XP008361015.1)的同源性分別高達(dá)98%和97%,由此推測(cè)這個(gè)基因?qū)儆阼凌薈YC-B基因(EjCYC-B)。熒光定量PCR分析結(jié)果表明,隨著枇杷果實(shí)的發(fā)育,EjCYC-B的表達(dá)量明顯增加,且不同發(fā)育階段EjCYC-B基因的表達(dá)存在顯著變化;其中,在果皮和果肉中的表達(dá)分別在黃熟期和成熟期達(dá)到最高峰。因此可以推測(cè),EjCYC...
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
植物CYC-B氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹
參考張玲等(2013)的分類方法,根據(jù)花后枇杷果實(shí)的生長(zhǎng)以及果皮著色變化,將枇杷分為未轉(zhuǎn)色期、轉(zhuǎn)色期、褪綠期、黃熟期和成熟期五個(gè)不同發(fā)育階段(圖6),并將果實(shí)分為果皮、果肉后經(jīng)液氮速凍后于-80℃超低溫冰箱保存?zhèn)溆谩?.2.1 枇杷總RNA的提取及c DNA的克隆
根據(jù)蛋白理化性質(zhì)分析結(jié)果顯示,該蛋白分子量為56.24 k D,理論等電點(diǎn)為8.81,帶正電荷(Arg+Lys)及帶負(fù)電荷(Asp+Glu)的殘基總數(shù)分別為60、53,不穩(wěn)定系數(shù)(Instability index)為50.26,屬不穩(wěn)定蛋白。親水性/疏水性分析結(jié)果表明,該蛋白最大親水性氨基酸值分別位于多肽鏈5號(hào)、228號(hào)及230號(hào)位,為-2.822;最大疏水性氨基酸值位于多肽鏈461號(hào)位,為2.444。該蛋白的總平均親水性(GRAVY)為-0.181。因此,它屬于親水性蛋白。圖2‘大五星’和‘川農(nóng)1-5-9’枇杷CYC-B基因氨基酸序列比對(duì)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]枇杷果實(shí)類胡蘿卜素研究進(jìn)展[J]. 劉小洪,孫海艷,陳薇薇,郭啟高,李曉林,梁國(guó)魯. 果樹學(xué)報(bào). 2016(07)
[2]Characterization of Carotenoid Accumulation and Carotenogenic Gene Expression During Fruit Development in Yellow and White Loquat Fruit[J]. ZHANG Ling,ZHANG Zhike,ZHENG Tingting,WEI Weilin,ZHU Yunmei,GAO Yongshun,YANG Xianghui,LIN Shunquan. Horticultural Plant Journal. 2016(01)
[3]園藝植物中類胡蘿卜素合成與調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 高慧君,明家琪,張雅娟,徐娟. 園藝學(xué)報(bào). 2015(09)
[4]枇杷果實(shí)成熟過程中果肉細(xì)胞質(zhì)體的發(fā)育與果肉顏色的變化[J]. 鄭婷婷,魏偉淋,何業(yè)華,楊向暉,林順權(quán). 果樹學(xué)報(bào). 2015(04)
[5]枇杷DXR基因的克隆及其在果實(shí)成熟過程中的表達(dá)分析[J]. 張玲,林順權(quán),胡又厘,鄭婷婷,楊向暉. 果樹學(xué)報(bào). 2013(04)
[6]植物類胡蘿卜素生物合成相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控及其在植物基因工程中的應(yīng)用[J]. 王玉萍,劉慶昌,翟紅. 分子植物育種. 2006(01)
[7]枇杷的營(yíng)養(yǎng)及功能成分研究進(jìn)展[J]. 張玉,王建清. 食品科學(xué). 2005(09)
博士論文
[1]紅肉和白肉枇杷果實(shí)類胡蘿卜素差異積累機(jī)制研究[D]. 傅秀敏.浙江大學(xué) 2013
本文編號(hào):3535464
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
植物CYC-B氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹
參考張玲等(2013)的分類方法,根據(jù)花后枇杷果實(shí)的生長(zhǎng)以及果皮著色變化,將枇杷分為未轉(zhuǎn)色期、轉(zhuǎn)色期、褪綠期、黃熟期和成熟期五個(gè)不同發(fā)育階段(圖6),并將果實(shí)分為果皮、果肉后經(jīng)液氮速凍后于-80℃超低溫冰箱保存?zhèn)溆谩?.2.1 枇杷總RNA的提取及c DNA的克隆
根據(jù)蛋白理化性質(zhì)分析結(jié)果顯示,該蛋白分子量為56.24 k D,理論等電點(diǎn)為8.81,帶正電荷(Arg+Lys)及帶負(fù)電荷(Asp+Glu)的殘基總數(shù)分別為60、53,不穩(wěn)定系數(shù)(Instability index)為50.26,屬不穩(wěn)定蛋白。親水性/疏水性分析結(jié)果表明,該蛋白最大親水性氨基酸值分別位于多肽鏈5號(hào)、228號(hào)及230號(hào)位,為-2.822;最大疏水性氨基酸值位于多肽鏈461號(hào)位,為2.444。該蛋白的總平均親水性(GRAVY)為-0.181。因此,它屬于親水性蛋白。圖2‘大五星’和‘川農(nóng)1-5-9’枇杷CYC-B基因氨基酸序列比對(duì)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]枇杷果實(shí)類胡蘿卜素研究進(jìn)展[J]. 劉小洪,孫海艷,陳薇薇,郭啟高,李曉林,梁國(guó)魯. 果樹學(xué)報(bào). 2016(07)
[2]Characterization of Carotenoid Accumulation and Carotenogenic Gene Expression During Fruit Development in Yellow and White Loquat Fruit[J]. ZHANG Ling,ZHANG Zhike,ZHENG Tingting,WEI Weilin,ZHU Yunmei,GAO Yongshun,YANG Xianghui,LIN Shunquan. Horticultural Plant Journal. 2016(01)
[3]園藝植物中類胡蘿卜素合成與調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 高慧君,明家琪,張雅娟,徐娟. 園藝學(xué)報(bào). 2015(09)
[4]枇杷果實(shí)成熟過程中果肉細(xì)胞質(zhì)體的發(fā)育與果肉顏色的變化[J]. 鄭婷婷,魏偉淋,何業(yè)華,楊向暉,林順權(quán). 果樹學(xué)報(bào). 2015(04)
[5]枇杷DXR基因的克隆及其在果實(shí)成熟過程中的表達(dá)分析[J]. 張玲,林順權(quán),胡又厘,鄭婷婷,楊向暉. 果樹學(xué)報(bào). 2013(04)
[6]植物類胡蘿卜素生物合成相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控及其在植物基因工程中的應(yīng)用[J]. 王玉萍,劉慶昌,翟紅. 分子植物育種. 2006(01)
[7]枇杷的營(yíng)養(yǎng)及功能成分研究進(jìn)展[J]. 張玉,王建清. 食品科學(xué). 2005(09)
博士論文
[1]紅肉和白肉枇杷果實(shí)類胡蘿卜素差異積累機(jī)制研究[D]. 傅秀敏.浙江大學(xué) 2013
本文編號(hào):3535464
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