元江宜昌橙是在云南元江縣新發(fā)現(xiàn)的宜昌橙（Citrus ichangensis Swingle）原始野生資源。為了解元江宜昌橙與長江流域宜昌橙的遺傳差異,以及元江宜昌橙野生種群內(nèi)個(gè)體間的遺傳差異,利用篩選的21對(duì)SSR和InDel引物對(duì)元江宜昌橙群體、長江流域宜昌橙群體、大翼橙群體、香橙（C.junos Siebold ex Tanaka）群體等4個(gè)群體的48份資源進(jìn)行了遺傳多樣性分析。結(jié)果表明,21對(duì)引物共產(chǎn)生了131條多態(tài)性條帶,平均每對(duì)引物檢測(cè)到6.2個(gè)多態(tài)性條帶,多態(tài)性標(biāo)記位點(diǎn)的香農(nóng)信息指數(shù)為0.14～1.11,平均期望雜合度為0.04～0.97。群體遺傳結(jié)構(gòu)分析、UPGMA聚類分析和主坐標(biāo)分析均表明,元江宜昌橙是不同于長江流域宜昌橙的新類型,4個(gè)群體間的遺傳差異較大,群體間的基因流較低。在元江宜昌橙種群內(nèi)存在遺傳異質(zhì)個(gè)體,但種群內(nèi)的遺傳多樣性水平比長江流域宜昌橙群體的遺傳多樣性水平低,香橙群體的遺傳多樣性水平較高。大翼橙群體中的馬來西亞大翼橙（C.macroptera Montrouz.）與宜昌橙遺傳距離較遠(yuǎn),而紅河大翼橙（C.hongheensis Y. L. D. L.）與... 

【文章來源】：中國南方果樹. 2020,49(05)北大核心

【文章頁數(shù)】：11 頁

【部分圖文】：

48份大翼橙種質(zhì)基于SSR和InDel數(shù)據(jù)構(gòu)建的UPGMA聚類樹(1 000次bootstrap檢驗(yàn))

利用GenAlEx 6.501軟件基于遺傳距離進(jìn)行主坐標(biāo)分析的結(jié)果表明,元江宜昌橙(群體)和長江流域宜昌橙(群體)在第一主坐標(biāo)軸上明顯分開。香橙群體在第一主坐標(biāo)軸上與長江流域宜昌橙群體不能分離,但與元江宜昌橙群體分離相當(dāng)明顯。在第二主坐標(biāo)軸上日本香橙1號(hào)(21)、巴中香橙(24)、黔江3號(hào)香橙(27)、公孫桔(29)等香橙與長江流域宜昌橙群體的分離較明顯。大翼橙中的紅河大翼橙1號(hào)(31)、紅河大翼橙雜種(33)在第一主坐標(biāo)軸上和第二主坐標(biāo)軸上均與長江流域宜昌橙群體和元江宜昌橙群體區(qū)分較明顯;紅河大翼橙4號(hào)(34)與元江宜昌橙群體的距離較近;馬來西亞大翼橙(32)遠(yuǎn)離紅河大翼橙和元江宜昌橙,而與香橙中的21、27和29距離較近。主坐標(biāo)分析結(jié)果與遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果、聚類分析結(jié)果一致,也清楚表明長江流域宜昌橙與元江宜昌橙是兩種不同類型的宜昌橙,元江宜昌橙群體內(nèi)存在明顯的遺傳分化,如元江宜昌橙(有刺)15號(hào)(14)遠(yuǎn)離群體,而與紅河大翼橙(31,33)更近,表明元江宜昌橙群體內(nèi)個(gè)別單株的遺傳異質(zhì)性可能與相同地理分布的紅河大翼橙的基因滲入有關(guān)。部分香橙資源(27,29,21,24)在第二主坐標(biāo)軸上與長江流域宜昌橙分離較遠(yuǎn),表明這些香橙資源在遺傳組成上較為獨(dú)特,其長江流域宜昌橙基因所占比例較小。多數(shù)香橙資源與元江宜昌橙的距離較大,再次表明元江宜昌橙與香橙群體的基因交流可能由于地理隔離而受到限制(見圖6)。3 討論

表3 被選21對(duì)引物用于48份大翼橙資源遺傳多樣性分析呈現(xiàn)的多態(tài)性 引物編號(hào) 擴(kuò)增總條帶數(shù)/條 基因多樣性 期望雜合度He 多態(tài)信息含量(PIC) 引物編號(hào) 擴(kuò)增總條帶數(shù)/條 基因多樣性 期望雜合度He 多態(tài)信息含量(PIC) SSR2 11 0.59 0.52 0.55 InDel 9 6 0.57 0.14 0.48 SSR3 9 0.66 0.35 0.60 InDel 10 5 1.11 0.97 0.98 SSR6 7 0.38 0.15 0.33 InDel 11 3 0.16 0.16 0.13 SSR7 8 0.38 0.15 0.33 InDel 12 12 0.31 0.32 0.26 SSR9 7 0.27 0.35 0.22 InDel 14 10 0.37 0.05 0.33 SSR10 5 0.34 0.16 0.32 InDel 16 9 0.29 0.07 0.26 InDel 1 1 0.14 0.04 0.15 InDel 18 8 0.58 0.66 0.51 InDel 2 4 0.34 0.16 0.32 InDel 19 8 0.16 0.05 0.15 InDel 5 10 0.35 0.14 0.32 InDel 20 4 0.36 0.22 0.31 InDel 6 6 0.33 0.05 0.30 InDel 21 10 0.65 0.54 0.61 InDel 8 15 0.56 0.20 0.50表4 4個(gè)大翼橙群體基于21個(gè)位點(diǎn)(SSR和InDel)的遺傳多樣性 群體名 多態(tài)位點(diǎn)百分率P/% 等位變異數(shù)Na 有效等位變異數(shù)Ne 香農(nóng)指數(shù)I 觀測(cè)雜合度Ho 期望雜合度He 無偏期望雜合度uHe 固定指數(shù)F 元江宜昌橙 76.92 2.308 1.585 0.469 0.299 0.275 0.283 0.261 香橙 73.08 2.538 1.882 0.607 0.343 0.360 0.376 0.117 長江流域宜昌橙 84.62 2.538 1.651 0.527 0.308 0.306 0.317 0.298 大翼橙 69.23 1.962 1.640 0.499 0.298 0.319 0.365 0.156

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]云南元江縣首次發(fā)現(xiàn)原始宜昌橙群落[J]. 陳洪明,江東,胡忠榮,李坤明,何永睿,陳善春,李中安,周常勇,李立會(huì),鄭殿升,劉旭.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2012(06)
[2]柑橘潰瘍病抗性相關(guān)的SSR標(biāo)記篩選[J]. 彭祝春,龔桂芝,陳善春,張戈壁,洪棋斌.  園藝學(xué)報(bào). 2010(03)
[3]應(yīng)用cpSSR和EST-SSR標(biāo)記進(jìn)行柑橘特異種質(zhì)資源遺傳背景研究[J]. 王福生,江東.  園藝學(xué)報(bào). 2010(03)
[4]利用SSR標(biāo)記對(duì)中國柚類資源及近緣種遺傳多樣性研究[J]. 劉勇,劉德春,吳波,孫中海.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2006(01)
[5]小果宜昌橙—柑桔屬宜昌橙的新變種[J]. 暴卓然,梁明清,丁素琴,張顯努.  園藝學(xué)報(bào). 1991(01)



本文編號(hào)：3496249