茉莉花實(shí)時(shí)熒光定量PCR內(nèi)參基因的篩選與驗(yàn)證
發(fā)布時(shí)間:2021-10-30 01:39
為篩選適合茉莉花的內(nèi)參基因,以5種組織(根、莖、嫩葉、成熟葉、花)和4個(gè)發(fā)育階段的花(幼蕾期、膨大花蕾期、最長(zhǎng)花蕾期和初綻期)為試驗(yàn)材料,選擇較常見的8個(gè)候選內(nèi)參基因進(jìn)行引物特異性分析,結(jié)果顯示,8個(gè)內(nèi)參基因均擴(kuò)增出單一條帶,溶解曲線均只有明顯的單一峰。采用qRT-PCR技術(shù)分析8個(gè)內(nèi)參基因在不同樣品中的表達(dá)量,結(jié)果顯示,內(nèi)參基因在不同樣品中的表達(dá)量存在差異,各基因在花中的表達(dá)量均顯著低于其他樣品。利用geNorm、NormFinder和BestKeeper軟件對(duì)基因的表達(dá)穩(wěn)定性進(jìn)行評(píng)價(jià),并通過RefFinder對(duì)表達(dá)穩(wěn)定性進(jìn)行綜合分析,結(jié)果表明,適用于不同組織(有花組)的最優(yōu)內(nèi)參基因?yàn)镾AND和UPL7;適用于不同組織(無(wú)花組)的最優(yōu)內(nèi)參基因?yàn)閁PL7和GAPDH;而適宜不同發(fā)育階段花的最優(yōu)內(nèi)參基因?yàn)锳ctin和EF1α。進(jìn)一步利用JsDXS和JsPAL2對(duì)篩選的內(nèi)參基因進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果顯示,以穩(wěn)定性好的Actin、EF1α及Actin+EF1α組合為參照時(shí),JsDXS和JsPAL2在花發(fā)育不同階段的表達(dá)水平的變化趨勢(shì)基本一致,而用最不穩(wěn)定的PP2A為參照時(shí),花發(fā)育不同階段的表達(dá)水平的...
【文章來源】:華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2020,35(06)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
茉莉花8個(gè)候選內(nèi)參基因PCR產(chǎn)物
將各樣品cDNA等量混合后,稀釋10倍作為模板,分別用8個(gè)候選內(nèi)參基因引物進(jìn)行qRT-PCR擴(kuò)增,結(jié)果如圖2所示。各候選內(nèi)參基因溶解曲線均只有明顯的單一峰,說明8個(gè)候選內(nèi)參基因引物擴(kuò)增特異性強(qiáng),符合qRT-PCR試驗(yàn)要求,可用于后續(xù)候選內(nèi)參基因穩(wěn)定性的分析。2.2 候選內(nèi)參基因表達(dá)分析
分別以茉莉花不同組織和花發(fā)育不同階段cDNA為模板,進(jìn)行qRT-PCR分析。結(jié)果如圖3所示,8個(gè)候選內(nèi)參基因在茉莉花不同樣品中的Ct值均有一定的變化,變化的趨勢(shì)各有不同。EF1α在不同樣品的Ct值在19.09~23.27,GAPDH的Ct值在17.89~31.26,Actin的Ct值27.88~29.20,PP2A的Ct值在22.16~34.03,TIP41的Ct值在22.31~33.51,UPL7的Ct值在23.47~31.39,PEPKR1的Ct值在26.96~29.98,SAND的Ct值在25.54~31.20。除Actin外,其他所有候選內(nèi)參基因在花中的Ct值均高于其他組織,即在花中的表達(dá)量均最低。因各候選內(nèi)參基因的Ct值(除Actin)在花與其他組織中的差異較大,對(duì)后期結(jié)果影響較大,故在候選內(nèi)參基因穩(wěn)定性評(píng)價(jià)中,將不同組織分為“有花組”(包含根、莖、嫩葉、成熟葉、花)和“無(wú)花組”(包含根、莖、嫩葉、成熟葉)進(jìn)行分析。8個(gè)候選內(nèi)參基因平均Ct值為21.53~28.68,其中EF1α的Ct值最小,說明其表達(dá)豐度較高(圖4)。圖4 茉莉花不同樣品中候選內(nèi)參基因的Ct值
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]梨果實(shí)細(xì)胞分裂期內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定性分析[J]. 蒲小秋,田嘉,李疆,張艷,李鵬,覃偉銘,井春芝. 經(jīng)濟(jì)林研究. 2020(01)
[2]茉莉花芳樟醇生物合成關(guān)鍵基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 陳笛,陳雪津,郭永春,王鵬杰,岳川,陳桂信,葉乃興. 西北植物學(xué)報(bào). 2019(08)
[3]發(fā)育期火龍果內(nèi)參基因的篩選和驗(yàn)證[J]. 崇慧影,文曉鵬. 生物技術(shù). 2019(01)
[4]黃山欒樹實(shí)時(shí)熒光定量PCR內(nèi)參基因的篩選[J]. 呂運(yùn)舟,董筱昀,黃利斌. 分子植物育種. 2019(02)
[5]茉莉生殖發(fā)育與分子生物學(xué)特性研究分析[J]. 鄧衍明,齊香玉,蘇家樂. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2019(02)
[6]茉莉花JsPAL2基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 熊青,宋姣敏,崔萌,許穎妍,俞瀅,葉乃興,陳桂信. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2018(07)
[7]平歐雜種榛實(shí)時(shí)熒光定量PCR內(nèi)參基因的篩選與體系建立[J]. 楊丹,李清,王貴禧,馬慶華,朱利泉. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(12)
[8]珙桐實(shí)時(shí)定量PCR內(nèi)參基因的篩選及穩(wěn)定性評(píng)價(jià)[J]. 任銳,戴鵬輝,李萌,劉志明,曹福祥. 植物生理學(xué)報(bào). 2016(10)
[9]桂花組織基因表達(dá)中熒光定量PCR內(nèi)參基因的篩選[J]. 付建新,張超,王藝光,趙宏波. 浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(05)
[10]秋水仙素濃度和處理時(shí)間對(duì)茉莉腋芽生長(zhǎng)發(fā)育的影響[J]. 鄧衍明,孫曉波,賈新平,梁麗建,蘇家樂. 植物資源與環(huán)境學(xué)報(bào). 2016(03)
本文編號(hào):3465790
【文章來源】:華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2020,35(06)北大核心CSCD
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【部分圖文】:
茉莉花8個(gè)候選內(nèi)參基因PCR產(chǎn)物
將各樣品cDNA等量混合后,稀釋10倍作為模板,分別用8個(gè)候選內(nèi)參基因引物進(jìn)行qRT-PCR擴(kuò)增,結(jié)果如圖2所示。各候選內(nèi)參基因溶解曲線均只有明顯的單一峰,說明8個(gè)候選內(nèi)參基因引物擴(kuò)增特異性強(qiáng),符合qRT-PCR試驗(yàn)要求,可用于后續(xù)候選內(nèi)參基因穩(wěn)定性的分析。2.2 候選內(nèi)參基因表達(dá)分析
分別以茉莉花不同組織和花發(fā)育不同階段cDNA為模板,進(jìn)行qRT-PCR分析。結(jié)果如圖3所示,8個(gè)候選內(nèi)參基因在茉莉花不同樣品中的Ct值均有一定的變化,變化的趨勢(shì)各有不同。EF1α在不同樣品的Ct值在19.09~23.27,GAPDH的Ct值在17.89~31.26,Actin的Ct值27.88~29.20,PP2A的Ct值在22.16~34.03,TIP41的Ct值在22.31~33.51,UPL7的Ct值在23.47~31.39,PEPKR1的Ct值在26.96~29.98,SAND的Ct值在25.54~31.20。除Actin外,其他所有候選內(nèi)參基因在花中的Ct值均高于其他組織,即在花中的表達(dá)量均最低。因各候選內(nèi)參基因的Ct值(除Actin)在花與其他組織中的差異較大,對(duì)后期結(jié)果影響較大,故在候選內(nèi)參基因穩(wěn)定性評(píng)價(jià)中,將不同組織分為“有花組”(包含根、莖、嫩葉、成熟葉、花)和“無(wú)花組”(包含根、莖、嫩葉、成熟葉)進(jìn)行分析。8個(gè)候選內(nèi)參基因平均Ct值為21.53~28.68,其中EF1α的Ct值最小,說明其表達(dá)豐度較高(圖4)。圖4 茉莉花不同樣品中候選內(nèi)參基因的Ct值
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]梨果實(shí)細(xì)胞分裂期內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定性分析[J]. 蒲小秋,田嘉,李疆,張艷,李鵬,覃偉銘,井春芝. 經(jīng)濟(jì)林研究. 2020(01)
[2]茉莉花芳樟醇生物合成關(guān)鍵基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 陳笛,陳雪津,郭永春,王鵬杰,岳川,陳桂信,葉乃興. 西北植物學(xué)報(bào). 2019(08)
[3]發(fā)育期火龍果內(nèi)參基因的篩選和驗(yàn)證[J]. 崇慧影,文曉鵬. 生物技術(shù). 2019(01)
[4]黃山欒樹實(shí)時(shí)熒光定量PCR內(nèi)參基因的篩選[J]. 呂運(yùn)舟,董筱昀,黃利斌. 分子植物育種. 2019(02)
[5]茉莉生殖發(fā)育與分子生物學(xué)特性研究分析[J]. 鄧衍明,齊香玉,蘇家樂. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2019(02)
[6]茉莉花JsPAL2基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 熊青,宋姣敏,崔萌,許穎妍,俞瀅,葉乃興,陳桂信. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2018(07)
[7]平歐雜種榛實(shí)時(shí)熒光定量PCR內(nèi)參基因的篩選與體系建立[J]. 楊丹,李清,王貴禧,馬慶華,朱利泉. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(12)
[8]珙桐實(shí)時(shí)定量PCR內(nèi)參基因的篩選及穩(wěn)定性評(píng)價(jià)[J]. 任銳,戴鵬輝,李萌,劉志明,曹福祥. 植物生理學(xué)報(bào). 2016(10)
[9]桂花組織基因表達(dá)中熒光定量PCR內(nèi)參基因的篩選[J]. 付建新,張超,王藝光,趙宏波. 浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(05)
[10]秋水仙素濃度和處理時(shí)間對(duì)茉莉腋芽生長(zhǎng)發(fā)育的影響[J]. 鄧衍明,孫曉波,賈新平,梁麗建,蘇家樂. 植物資源與環(huán)境學(xué)報(bào). 2016(03)
本文編號(hào):3465790
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