根據(jù)全基因組測序已完成的栽培蘋果基因組,設(shè)計、篩選針對新疆野蘋果的特異性SSR引物。通過PCR擴增、基因測序篩選了15對可以在新疆野蘋果和栽培蘋果中擴增出穩(wěn)定性高且具備多態(tài)性目的條帶的特異性SSR引物;其中8對僅能在栽培蘋果中擴增出特異性目的條帶。15對特異性SSR引物對新疆野蘋果和栽培蘋果不同居群的SSR分析表明,新疆野蘋果遺傳多樣性較為豐富,與栽培蘋果不同居群分化程度較為顯著,基因流水平較低。聚類分析表明,這15對特異性SSR引物可以將新疆野蘋果和栽培蘋果不同居群清晰區(qū)分。本研究利用新開發(fā)的SSR引物不僅可以揭示新疆野蘋果和栽培蘋果的遺傳多樣性和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,對初步了解SSR變異位點的生物學(xué)功能以及豐富新疆野蘋果和栽培蘋果基因組的認識也有一定的作用,從而為更好地有效利用相關(guān)資源提供研究基礎(chǔ)。 

【文章來源】：江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(21)

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
        1.1.1 樣品調(diào)查采集
        1.1.2 試劑和儀器
    1.2 試驗方法
        1.2.1 DNA提取
        1.2.2 SSR引物設(shè)計
        1.2.3 PCR擴增
    1.3 數(shù)據(jù)處理和分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 SSR引物PCR擴增分析
    2.2 新疆野蘋果、栽培蘋果遺傳分化和SSR位點多態(tài)性分析
    2.3 新疆野蘋果和栽培蘋果系統(tǒng)發(fā)育分析
3 結(jié)論與討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]新疆野蘋果葉形性狀變異及其與SSR標記關(guān)聯(lián)分析[J]. 左力輝,張文林,邱彤,張軍,楊敏生.  園藝學(xué)報. 2015(04)
[2]天山野蘋果林蘋果小吉丁與蘋果腐爛病復(fù)合危害研究[J]. 劉愛華,張新平,溫俊寶,岳朝陽,阿里木,焦淑萍,張靜文,克熱曼.  新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(12)
[3]基于ITS和matK序列探討新疆野蘋果與中國蘋果的系統(tǒng)演化關(guān)系[J]. 朱元娣,曹敏格,許正,王昆,張文.  園藝學(xué)報. 2014(02)
[4]中國新疆野蘋果天然群體遺傳多樣性SSR分析[J]. 董研,張軍,任亞超,韓志校.  植物遺傳資源學(xué)報. 2013(05)
[5]新疆野蘋果資源遺傳多樣性SSR分析[J]. 秦偉,沙紅,劉立強,廖康,耿文娟,王云.  果樹學(xué)報. 2012(02)
[6]新疆蘋果種質(zhì)資源親緣關(guān)系的SSR分析[J]. 秦偉,劉立強,廖康,耿文娟,唐芳.  新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(01)
[7]天山西部新疆野蘋果種群特征[J]. 劉華,臧潤國,丁易,張煒銀,郭仲軍,白志強,劉雙成.  林業(yè)科學(xué). 2010(11)
[8]新疆野蘋果研究進展[J]. 張艷敏,馮濤,張春雨,何天明,張小燕,劉遵春,王艷玲,束懷瑞,陳學(xué)森.  園藝學(xué)報. 2009(03)
[9]新疆野蘋果群體遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性的SRAP分析[J]. 張春雨,陳學(xué)森,林群,苑兆和,張紅,張小燕,劉崇祺,吳傳金.  園藝學(xué)報. 2009(01)
[10]新疆發(fā)生蘋果小吉丁蟲[J]. 王春曉,趙健桐,隋建中,趙福,馬福杰.  新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 1995(05)

博士論文
[1]天山馬鹿種群數(shù)量，遺傳結(jié)構(gòu)，家域及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究[D]. 周璨林.新疆大學(xué) 2015



本文編號：3405387