根據(jù)全基因組測序已完成的栽培蘋果基因組,設(shè)計、篩選針對新疆野蘋果的特異性SSR引物。通過PCR擴增、基因測序篩選了15對可以在新疆野蘋果和栽培蘋果中擴增出穩(wěn)定性高且具備多態(tài)性目的條帶的特異性SSR引物;其中8對僅能在栽培蘋果中擴增出特異性目的條帶。15對特異性SSR引物對新疆野蘋果和栽培蘋果不同居群的SSR分析表明,新疆野蘋果遺傳多樣性較為豐富,與栽培蘋果不同居群分化程度較為顯著,基因流水平較低。聚類分析表明,這15對特異性SSR引物可以將新疆野蘋果和栽培蘋果不同居群清晰區(qū)分。本研究利用新開發(fā)的SSR引物不僅可以揭示新疆野蘋果和栽培蘋果的遺傳多樣性和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,對初步了解SSR變異位點的生物學功能以及豐富新疆野蘋果和栽培蘋果基因組的認識也有一定的作用,從而為更好地有效利用相關(guān)資源提供研究基礎(chǔ)。 

【文章來源】：江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2020,48(21)

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
        1.1.1 樣品調(diào)查采集
        1.1.2 試劑和儀器
    1.2 試驗方法
        1.2.1 DNA提取
        1.2.2 SSR引物設(shè)計
        1.2.3 PCR擴增
    1.3 數(shù)據(jù)處理和分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 SSR引物PCR擴增分析
    2.2 新疆野蘋果、栽培蘋果遺傳分化和SSR位點多態(tài)性分析
    2.3 新疆野蘋果和栽培蘋果系統(tǒng)發(fā)育分析
3 結(jié)論與討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]新疆野蘋果葉形性狀變異及其與SSR標記關(guān)聯(lián)分析[J]. 左力輝,張文林,邱彤,張軍,楊敏生.  園藝學報. 2015(04)
[2]天山野蘋果林蘋果小吉丁與蘋果腐爛病復合危害研究[J]. 劉愛華,張新平,溫俊寶,岳朝陽,阿里木,焦淑萍,張靜文,克熱曼.  新疆農(nóng)業(yè)科學. 2014(12)
[3]基于ITS和matK序列探討新疆野蘋果與中國蘋果的系統(tǒng)演化關(guān)系[J]. 朱元娣,曹敏格,許正,王昆,張文.  園藝學報. 2014(02)
[4]中國新疆野蘋果天然群體遺傳多樣性SSR分析[J]. 董研,張軍,任亞超,韓志校.  植物遺傳資源學報. 2013(05)
[5]新疆野蘋果資源遺傳多樣性SSR分析[J]. 秦偉,沙紅,劉立強,廖康,耿文娟,王云.  果樹學報. 2012(02)
[6]新疆蘋果種質(zhì)資源親緣關(guān)系的SSR分析[J]. 秦偉,劉立強,廖康,耿文娟,唐芳.  新疆農(nóng)業(yè)科學. 2011(01)
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[9]新疆野蘋果群體遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性的SRAP分析[J]. 張春雨,陳學森,林群,苑兆和,張紅,張小燕,劉崇祺,吳傳金.  園藝學報. 2009(01)
[10]新疆發(fā)生蘋果小吉丁蟲[J]. 王春曉,趙健桐,隋建中,趙福,馬福杰.  新疆農(nóng)業(yè)科學. 1995(05)

博士論文
[1]天山馬鹿種群數(shù)量，遺傳結(jié)構(gòu)，家域及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究[D]. 周璨林.新疆大學 2015



本文編號：3405387