【目的】克隆枇杷EjWRKY15基因并對其組織表達(dá)模式及蛋白特性進(jìn)行分析。【方法】從枇杷轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中獲得EjWRKY15基因ORF序列,克隆該基因,對獲得的基因序列進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析,并通過qRT-PCR探究其在不同組織中的表達(dá)模式。同時(shí)對EjWRKY15蛋白分子的理化特性、磷酸化位點(diǎn)、跨膜區(qū)、信號肽、親疏水性、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)和亞細(xì)胞定位等蛋白特性進(jìn)行預(yù)測分析。【結(jié)果】枇杷EjWRKY15基因含有開放閱讀框951 bp,共編碼316個(gè)氨基酸,具有WRKY家族典型結(jié)構(gòu)特征。系統(tǒng)進(jìn)化結(jié)果表明,EjWRKY15序列與蘋果WRKY61序列同源度高達(dá)95%,說明從進(jìn)化角度來看,EjWRKY15與蘋果WRKY61的親緣關(guān)系最為密切。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析結(jié)果顯示,該基因具有組織表達(dá)特異性,在根中相對表達(dá)量較高,果實(shí)次之;對EjWRKY15蛋白進(jìn)行理化性質(zhì)測定,其分子質(zhì)量為35.79 kDa,等電點(diǎn)為5.09,脂溶指數(shù)為56.45,不穩(wěn)定性指數(shù)為69.72,平均親水性為-0.598,為親水性蛋白。該蛋白含有33個(gè)磷酸化位點(diǎn),包含絲氨酸（Ser）、蘇氨酸（Thr）和酪氨酸（Try）,數(shù)量分別為25... 

【文章來源】：果樹學(xué)報(bào). 2020,37(12)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

Ej WRKY15基因克隆及結(jié)構(gòu)域A.EjWRKY15基因ORF克��；M.Magic Ruler IV;EjW15.ORF克�。籅.EjWRKY15基因結(jié)構(gòu)域。

枇杷Ej WRKY15基因不同組織表達(dá)模式

蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果顯示，Ej WRKY15蛋白的二級結(jié)構(gòu)主要包括α螺旋、延伸鏈、α轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲4種類型，主要以α螺旋和無規(guī)則卷曲為主，比例分別為30.70%、56.65%，其次為延伸鏈8.27%、β轉(zhuǎn)角4.43%（圖5);Ej WRKY15蛋白的三級結(jié)構(gòu)分析表明，其結(jié)構(gòu)域主要由4個(gè)β-折疊組成，依次為β-折疊1(WRKYGQK）、β-折疊2(RSYYKC）、β-折疊3(GVRKHVER）、β-折疊4(AVVTTY）（圖6）。2.5 Ej WRKY15蛋白信號肽及跨膜結(jié)構(gòu)域分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]植物抗逆相關(guān)蛋白激酶的結(jié)構(gòu)與功能[J]. 楊樂,齊妍,劉生祥,張雙喜,李連城,陳明,徐兆師,馬有志.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2013(04)



本文編號：3373948