竹葉花椒肉桂酰輔酶A還原酶基因克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2025-05-07 05:30
肉桂酰輔酶A還原酶(cinnamoyl-CoA reductase, CCR)在木質(zhì)素生物合成途徑中起著關(guān)鍵作用。本研究依據(jù)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)設(shè)計(jì)特異性引物,采用RT-PCR方法從竹葉花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一個(gè)全新的CCR基因的全長c DNA序列,命名為ZaCCR。序列分析結(jié)果表明,ZaCCR包含完整的cDNA開放閱讀框(OFR),由990 bp組成,編碼329個(gè)氨基酸。Blast比對結(jié)果顯示該蛋白質(zhì)屬于CCR家族蛋白;系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果顯示竹葉花椒(Zanthoxylum armatum)與蕓香科植物甜橙(Sweet orange, Citrus sinensis)、蜜柑(Satsuma mandarin, Citrus unshiu)等親緣關(guān)系較近。熒光定量PCR檢測顯示,ZaCCR在竹葉花椒中的表達(dá)量從大到小分別為:嫁接樹的莖、實(shí)生樹的莖、嫁接樹的葉、實(shí)生樹的葉。
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
本文編號(hào):4043674
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圖2 竹葉花椒Za CCR蛋白與其他植物CCR蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹
研究顯示CCR在木質(zhì)素的生物合成途徑中起著不可或缺的作用,認(rèn)為其可能調(diào)控木質(zhì)素生物合成途徑中碳的流向(李波等,2006)。本研究從轉(zhuǎn)錄組角度設(shè)計(jì)CCR基因的特異性引物,通過基因測序成功驗(yàn)證了所克隆基因?yàn)橹袢~花椒CCR基因,該基因全長990bp,編碼329個(gè)氨基酸。蛋白序列分析發(fā)....
圖1 CCR蛋白序列比對
將推導(dǎo)出來的ZaCCR蛋白序列在美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)進(jìn)行比對,得到其他植物CCR蛋白序列,用MEGA7中自帶的ClusterW進(jìn)行蛋白序列多重比對后,用Neighbor-joining算法(自檢舉1000次)繪制出竹葉花椒ZaCCR蛋白與其他植物的CCR....
圖3 Za CCR分別在嫁接樹和實(shí)生樹的莖和葉中的表達(dá)情況
通過對竹葉花椒ZaCCR蛋白進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)該蛋白與蕓香科的甜橙(Citrussinensis)、蜜柑(Citrusunshiu)、克里曼丁桔(Citrusclementina)CCR蛋白同源性較高,再次驗(yàn)證了本試驗(yàn)所克隆基因?yàn)镃CR基因;ń肥侵袊耘鄽v史悠久的....
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