茅蒼術(shù)試管苗繼代培養(yǎng)的轉(zhuǎn)錄組分析
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【部分圖文】:
圖1 All-Unigene長度分布圖
茅蒼術(shù)試管苗3個不同繼代時期共9個樣本的196583條Unigene中123623個Unigene在不同數(shù)據(jù)庫中得到了注釋,占總Unigene的62.89%,沒有注釋到的Unigene為72960個,占37.11%。其中,Unigene在NR數(shù)據(jù)庫注釋到的數(shù)目最多,為113....
圖2 茅蒼術(shù)繼代培養(yǎng)的試管苗差異表達基因數(shù)量統(tǒng)計圖
為了進一步了解茅蒼術(shù)試管苗繼代培養(yǎng)過程中發(fā)生遺傳變異現(xiàn)象的分子機制,將差異表達基因進行了GO功能分析,并對比其生物學功能。結(jié)果表明,共有43351個差異表達基因在GO功能庫得到注釋,分布在生物學過程、分子功能以及細胞組分三大功能類別的45個小類,這三大類占比分別為40.56%(....
圖3 茅蒼術(shù)繼代培養(yǎng)的試管苗差異表達基因的GO功能分布圖
根據(jù)差異表達基因在KEGG數(shù)據(jù)庫中的注釋結(jié)果顯示,共有15629個差異表達基因注釋到6大類特定的Pathway代謝通路中,分別為組織系統(tǒng)(18.05%)、遺傳信息處理(10.80%)、環(huán)境信息處理(9.02%)、代謝機制(31.31%)、細胞過程(8.76%)和人類疾病(22.....
圖4 茅蒼術(shù)繼代培養(yǎng)的試管苗差異表達基因的KEGG功能注釋分布圖
圖3茅蒼術(shù)繼代培養(yǎng)的試管苗差異表達基因的GO功能分布圖根據(jù)差異表達基因在KEGG數(shù)據(jù)庫中的注釋結(jié)果,篩選與茅蒼術(shù)繼代培養(yǎng)有關(guān)顯著富集的代謝通路(以P<0.05為標準),結(jié)果見表2。發(fā)現(xiàn)分布在代謝途徑(ko01100)、MAPK信號通路(ko04010)、植物激素信號轉(zhuǎn)導(ko0....
本文編號:4031897
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