不同發(fā)育時期亞麻莖稈中木質素積累相關miRNA及其靶基因的挖掘分析
發(fā)布時間:2024-04-11 22:26
【目的】深入挖掘分析亞麻莖稈不同發(fā)育時期木質素積累相關的miRNA及其靶基因,為解析亞麻纖維層木質素動態(tài)積累提供理論依據!痉椒ā恳噪p亞4號(低木質素)和NEW(高木質素)花后20、30和40 d的莖稈為試驗材料,基于miRNA測序和降解組測序結果分析miRNA轉錄水平動態(tài)變化及其靶基因注釋功能,并采用實時熒光定量PCR檢測2個亞麻品種間表達差異最顯著的miRNA及其靶基因的表達模式!窘Y果】構建雙亞4號和NEW花后20、30和40 d莖稈的miRNA文庫,從中鑒定出305個miRNA,包括143個保守的miRNA和162個新鑒定的miRNA,且這些miRNA的靶基因不同轉錄本并非均受miRNA調控。將鑒定的305個miRNA與亞麻基因組序列信息進行靶基因預測,結果鑒定出286個miRNA的4807個靶基因,另外19個miRNA未預測到靶基因。通過對降解組測序數據進行整合分析,共獲得21個miRNA的97個靶基因,共檢測到97個降解位點,僅占鑒定出亞麻莖稈中miRNA靶基因總數(4807個)的2%,仍有大量的靶基因未被鑒定。對降解組中被降解的97個靶基因進行功能注釋,發(fā)現有22個與植物...
【文章頁數】:10 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
1.2.1 mi RNA文庫構建及測序分析
1.2.2 降解組c DNA文庫構建及測序分析
1.2.3 實時熒光定量PCR驗證
1.3 統計分析
2 結果分析
2.1 mi RNA轉錄水平分析結果
2.2 降解組測序分析結果
2.3 實時熒光定量PCR驗證結果
3 討論
4 結論
本文編號:3951235
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0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
1.2.1 mi RNA文庫構建及測序分析
1.2.2 降解組c DNA文庫構建及測序分析
1.2.3 實時熒光定量PCR驗證
1.3 統計分析
2 結果分析
2.1 mi RNA轉錄水平分析結果
2.2 降解組測序分析結果
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