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不同發(fā)育時(shí)期亞麻莖稈中木質(zhì)素積累相關(guān)miRNA及其靶基因的挖掘分析

發(fā)布時(shí)間:2024-04-11 22:26
  【目的】深入挖掘分析亞麻莖稈不同發(fā)育時(shí)期木質(zhì)素積累相關(guān)的miRNA及其靶基因,為解析亞麻纖維層木質(zhì)素動(dòng)態(tài)積累提供理論依據(jù)!痉椒ā恳噪p亞4號(hào)(低木質(zhì)素)和NEW(高木質(zhì)素)花后20、30和40 d的莖稈為試驗(yàn)材料,基于miRNA測(cè)序和降解組測(cè)序結(jié)果分析miRNA轉(zhuǎn)錄水平動(dòng)態(tài)變化及其靶基因注釋功能,并采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)2個(gè)亞麻品種間表達(dá)差異最顯著的miRNA及其靶基因的表達(dá)模式!窘Y(jié)果】構(gòu)建雙亞4號(hào)和NEW花后20、30和40 d莖稈的miRNA文庫,從中鑒定出305個(gè)miRNA,包括143個(gè)保守的miRNA和162個(gè)新鑒定的miRNA,且這些miRNA的靶基因不同轉(zhuǎn)錄本并非均受miRNA調(diào)控。將鑒定的305個(gè)miRNA與亞麻基因組序列信息進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),結(jié)果鑒定出286個(gè)miRNA的4807個(gè)靶基因,另外19個(gè)miRNA未預(yù)測(cè)到靶基因。通過對(duì)降解組測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析,共獲得21個(gè)miRNA的97個(gè)靶基因,共檢測(cè)到97個(gè)降解位點(diǎn),僅占鑒定出亞麻莖稈中miRNA靶基因總數(shù)(4807個(gè))的2%,仍有大量的靶基因未被鑒定。對(duì)降解組中被降解的97個(gè)靶基因進(jìn)行功能注釋,發(fā)現(xiàn)有22個(gè)與植物...

【文章頁數(shù)】:10 頁

【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 試驗(yàn)方法
        1.2.1 mi RNA文庫構(gòu)建及測(cè)序分析
        1.2.2 降解組c DNA文庫構(gòu)建及測(cè)序分析
        1.2.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證
    1.3 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果分析
    2.1 mi RNA轉(zhuǎn)錄水平分析結(jié)果
    2.2 降解組測(cè)序分析結(jié)果
    2.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證結(jié)果
3 討論
4 結(jié)論



本文編號(hào):3951235

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