目的對來自不同地域的多花黃精野生資源的核糖體內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)2(internal transcribed spacer 2,ITS2)和psbA-trnH基因間隔區(qū)序列進行系統(tǒng)發(fā)育分析,探索不同地理來源的多花黃精資源的遺傳多樣性和親緣關(guān)系。方法用聚合酶鏈式反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)的方法擴增獲得多花黃精ITS和psbA-trnH的核酸序列,與美國國家技術(shù)信息中心(NCBI)相對應(yīng)的核酸序列比對獲得多花黃精ITS2和psbA-trnH核酸序列。用鄰接法(Neighbor joining)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,用Kimura two-parameter(K2-P)模型分析遺傳距離,用Mega和DNAman軟件進行多重比對分析。結(jié)果安徽青陽樣品的ITS2序列為224bp,其余24份樣品的ITS2序列均為225bp,福建泰寧的1份樣品為620bp,其余24份多花黃精樣品的psbA-trnH序列均為621 bp,2個序列分別存在7個和4個變異位點。采用ITS2序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹將25份資源分為2個大的類群,湖南和貴州的5份資源種群聚為一類,其他20份資源聚為一類,...

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圖1基于ITS2(A)和psbA-trnH(B)序列的多花黃精資源的系統(tǒng)發(fā)育樹

本研究分別擴增了25份多花黃精資源的ITS序列和psbA-trnH區(qū)段DNA序列。ITS2序列包括部分5.8SrRNA序列+ITS2序列+部分28SrRNA序列，psbA-trnH序列包括psbA基因全長+psbA-trnH間區(qū)全長+trnH基因全長。參照KX375075....

圖225個多花黃精樣本的ITS2序列多重比對結(jié)果

對25個樣品的ITS2序列進行分析，發(fā)現(xiàn)ITS2序列存在7個變異位點，安徽青陽樣品的堿基“G”缺失，安徽青陽樣品與其他24個樣品之間的“C”-“T”堿基互換，貴州花溪、貴州劍河、湖南洪江、湖南新寧、湖南資興等5個樣品和其余20個樣品之間的“A”-“C”堿基互換，湖南洪江、湖南新寧....

圖325個多花黃精樣本的psbA-trnH序列多重比對結(jié)果

圖225個多花黃精樣本的ITS2序列多重比對結(jié)果4討論

圖1基于ITS2(A)和psbA-trnH(B)序列的多花黃精資源的系統(tǒng)發(fā)育樹

本研究分別擴增了25份多花黃精資源的ITS序列和psbA-trnH區(qū)段DNA序列。ITS2序列包括部分5.8SrRNA序列+ITS2序列+部分28SrRNA序列，psbA-trnH序列包括psbA基因全長+psbA-trnH間區(qū)全長+trnH基因全長。參照KX375075....

本文編號：3919462