黃金艾蒿的非靶向代謝組和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2024-02-05 08:01
目的:鑒定黃金艾蒿中次生代謝物質(zhì)及其合成的關(guān)鍵基因。方法:通過(guò)非靶向代謝組學(xué)鑒定黃金艾蒿葉片中的次生代謝物質(zhì)成分,利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析主要代謝成分合成途徑的關(guān)鍵基因。結(jié)果:基于非靶向代謝組在黃金艾蒿葉片中鑒定出氨基酸類、生物堿類、奎寧酸及其衍生物類以及黃酮類等共98種代謝物,其中黃酮類物質(zhì)有21種,包括圣草素、柚皮素、異鼠李素、異牡荊素以及芹菜素和山柰酚的糖苷衍生物等;谵D(zhuǎn)錄組測(cè)序,經(jīng)過(guò)de novo組裝、去冗余后共獲得45 494條Unigene,平均長(zhǎng)度為702.17 bp, N50為830 bp。經(jīng)過(guò)與公共數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行同源比對(duì),共有36 866(81.03%)條Unigene獲得功能注釋,其中15 025(33.03%)條Unigene在KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)中得到注釋,共涉及129個(gè)代謝通路。根據(jù)基因功能進(jìn)一步鑒定到53個(gè)Unigene參與類黃酮的生物合成,包括黃酮類合成的關(guān)鍵酶PAL、CHS、CHI、F3H和FLS等。同時(shí)還鑒定到245個(gè)細(xì)胞色素P450家族基因和74個(gè)糖基轉(zhuǎn)移酶家族基因。結(jié)論:該研究結(jié)果為下一步有針對(duì)性地研究黃金艾蒿的代謝物質(zhì)活性和開(kāi)展黃酮類化合物合成關(guān)鍵基因的功能研...
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本文編號(hào):3895910
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圖1黃金艾蒿Unigene的GO功能分類
表2Unigene的功能注釋注釋的數(shù)據(jù)庫(kù)注釋的數(shù)量百分比/%KOG2082545.78NR3604079.22Pfam2505455.07Swissprot2082445.77GO1990243.75KEGG1502533.....
圖2黃金艾蒿Unigene的KEGG功能分類
根據(jù)KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)注釋結(jié)果,黃金艾蒿Unigene主要分為五大類功能,包括代謝(metabolism,5041,49.89%)、有機(jī)系統(tǒng)(organismalsystems,235,2.33%)、遺傳信息過(guò)程(geneticinformationprocessing,....
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