發(fā)布時(shí)間：2023-08-03 20:04

　　為研究川佛手不同發(fā)育時(shí)期轉(zhuǎn)錄水平差異,探究調(diào)控川佛手有效成分生物合成的基因。該研究利用Illumina Hiseq 4000高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)不同發(fā)育時(shí)期的川佛手果實(shí)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,獲得121 235條unigene,平均長度2 434 bp,利用DESeq篩選獲得3 379個(gè)差異基因,主要集中在信號(hào)傳導(dǎo)、生物調(diào)控、代謝過程等生物過程,富集到淀粉、蔗糖的代謝、苯丙素的生物合成、類黃酮的生物合成等代謝通路。進(jìn)一步對(duì)川佛手有效成分生物合成相關(guān)基因進(jìn)行動(dòng)態(tài)比較:PAL,CHI,CYP75B1,ZDS,4CL,FLS的隨著果實(shí)由綠變黃表達(dá)量呈逐漸上升趨勢(shì);COMT,F3H,CYP73A的表達(dá)量呈先升高后降低趨勢(shì);CCR,HCT,HRP呈先下調(diào)后上調(diào)表達(dá)。該研究為進(jìn)一步挖掘川佛手有效成分生物合成過程中的關(guān)鍵基因,解析調(diào)控其有效成分生物合成途徑提供研究基礎(chǔ)。

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 材料
    1.1 樣品
    1.2 儀器
2 方法
    2.1 總RNA的提取
    2.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
    2.3 下機(jī)序列篩選與組裝
    2.4 unigene的功能注釋
    2.5 差異表達(dá)基因的篩選
3 結(jié)果與分析
    3.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析
    3.2 序列比對(duì)與注釋信息
    3.3 不同發(fā)育時(shí)期差異表達(dá)基因分析
    3.4 不同發(fā)育時(shí)期差異表達(dá)基因的KEGG代謝通路分析
    3.5 佛手有效成分生物合成相關(guān)基因的挖掘
4 討論



本文編號(hào)：3838723