【目的】使用黑果枸杞的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)開發(fā)適合枸杞的EST-SSR引物,用于分析評(píng)價(jià)枸杞品種和種質(zhì)的遺傳多樣性,為黑果枸杞種質(zhì)資源評(píng)價(jià)和新品種培育提供理論依據(jù)�！痉椒ā炕贜CBI公共數(shù)據(jù)庫已經(jīng)發(fā)表的黑果枸杞果實(shí)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),分析得到枸杞的EST-SSR分子標(biāo)記,合成了符合設(shè)計(jì)標(biāo)準(zhǔn)的182對(duì)EST-SSR引物,經(jīng)過擴(kuò)增和多態(tài)性篩選后,將多態(tài)性好的引物用于30份枸杞材料的遺傳多樣性分析�！窘Y(jié)果】在182對(duì)引物中,有176對(duì)引物可以擴(kuò)增出條帶,共篩選出20對(duì)多態(tài)性好、有特異性的引物,其多數(shù)引物擴(kuò)增條帶數(shù)為2～8條。使用20對(duì)引物在30份枸杞材料中共擴(kuò)增得到121條條帶,平均每對(duì)引物擴(kuò)增出6.05條,有效等位基因數(shù)(N_e)的均值為1.473 1個(gè),Nei’s多樣性指數(shù)(H)的均值為0.291 7,Shannon信息指數(shù)(I)的均值為0.451 7,多態(tài)性信息含量(PIC)均值為0.667,30份材料的遺傳相似系數(shù)為0.459 2～0.991 8,表明品種間具有較豐富的遺傳差異。聚類分析結(jié)果表明,30份枸杞材料被分為6個(gè)組,黑果枸杞與紅果枸杞明顯歸于不同類型,不同種源地的黑果枸杞...

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 基因組DNA的提取
        1.2.2 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)處理及引物設(shè)計(jì)
        1.2.3 引物的篩選
        1.2.4 SSR-PCR反應(yīng)體系
        1.2.5 PCR產(chǎn)物的檢測
    1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
    2.1 SSR引物擴(kuò)增結(jié)果分析
    2.2 遺傳相似性與聚類分析
3 結(jié)論與討論



本文編號(hào)：3763220