利用生物信息學(xué)方法對(duì)陸地棉SPL基因家族進(jìn)行了全基因組鑒定,共鑒定到30個(gè)家族成員,對(duì)它們的理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位和二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了預(yù)測(cè)分析,并構(gòu)建了陸地棉SPL基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。研究表明:陸地棉中SPL基因編碼氨基酸的數(shù)量為141～1081,平均為527.9,相對(duì)分子質(zhì)量介于16.11～119.59 kDa,等電點(diǎn)為5.25～9.88;二級(jí)結(jié)構(gòu)主要元件為無(wú)規(guī)則卷曲,系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)其分為6個(gè)亞群,結(jié)合基因結(jié)構(gòu)和保守基序發(fā)現(xiàn)SPL基因高度保守;組織表達(dá)模式表明,有9個(gè)基因在各組織中的表達(dá)量很高,其中GhirD08G004350在花瓣中高表達(dá)。探討了SPL基因家族在主要栽培種陸地棉中的進(jìn)化及功能,為SPL基因克隆及后續(xù)重要的生物學(xué)功能研究提供借鑒與參考。</sub> 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 SPL基因的鑒定
    1.2 陸地棉SPL基因家族成員的特性、基因結(jié)構(gòu)與染色體定位分析
    1.3 多序列比對(duì)與系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建
    1.4 陸地棉SPL家族基因的表達(dá)模式分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 SPL家族成員的鑒定和理化分析
    2.2 SPL的系統(tǒng)進(jìn)化分析
    2.3 SPL基因家族的結(jié)構(gòu)
    2.4 SPL基因在染色體上的定位
    2.5 SPL的二級(jí)結(jié)構(gòu)分析
    2.6 SPL基因的表達(dá)模式分析
3 結(jié)論與討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]菠蘿SPL基因家族全基因組鑒定及其在開(kāi)花誘導(dǎo)中的表達(dá)分析[J]. 潘曉璐,張秀梅,許婷婷,侯世貴,張紅娜.  分子植物育種. 2020(20)
[2]SPL調(diào)控因子在植物生長(zhǎng)調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 陳婉冰,周波.  分子植物育種. 2020(05)
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