石豆蘭屬（Bulbophyllum）植物具有極高的觀賞和藥用價(jià)值,然而有關(guān)其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和物種鑒定仍缺乏研究。因此,本研究對(duì)石豆蘭屬3種藥用植物（赤唇石豆蘭、長(zhǎng)足石豆蘭、富寧卷瓣蘭）的葉綠體基因組進(jìn)行了測(cè)序分析,并以此為基礎(chǔ)開展了相應(yīng)研究。經(jīng)組裝注釋后發(fā)現(xiàn),石豆蘭屬植物葉綠體基因組共編碼108個(gè)基因,其中蛋白質(zhì)編碼基因74個(gè)、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因30個(gè)、核糖體RNA基因4個(gè)�；趍VISTA和節(jié)點(diǎn)處比較分析發(fā)現(xiàn),石豆蘭屬植物葉綠體基因組結(jié)構(gòu)較為保守,差異主要存在于非編碼區(qū)。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,石豆蘭屬與石斛屬親緣關(guān)系最近。SSR分析顯示單核苷酸重復(fù)數(shù)目最多,且大部分SSR位點(diǎn)存在于基因間隔區(qū)。此外,對(duì)非編碼序列進(jìn)行比較分析,共篩選出10個(gè)高變序列,其中psbI-trnS、psbC-trnS、clpP-ex1-psbB、psaJ-rpl33、rpl33-rps18這5個(gè)非編碼區(qū)序列的組合,具有最高的序列變異度,可用于石豆蘭屬藥用植物的鑒定研究。綜上可知,本研究通過對(duì)石豆蘭屬植物葉綠體基因組的比較分析,為系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和物種鑒定提供了理論依據(jù)。 

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
材料與方法
結(jié)果與分析
    1石豆蘭葉綠體基因組基本特征
    2 m VISTA分析
    3節(jié)點(diǎn)擴(kuò)張收縮
    4 SSR位點(diǎn)分析
    5石豆蘭的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系
    6非編碼區(qū)變異度計(jì)算和高變序列的篩選與驗(yàn)證
討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Accurate authentication of Dendrobium officinale and its closely related species by comparative analysis of complete plastomes[J]. Shuying Zhu,Zhitao Niu,Qingyun Xue,Hui Wang,Xuezhu Xie,Xiaoyu Ding.  Acta Pharmaceutica Sinica B. 2018(06)



本文編號(hào)：3689948