以花生（Arachis hypogaea Linn.）品種‘Florunner’為研究對象,利用RNA-seq技術對花生異型雄蕊進行轉(zhuǎn)錄組測序;在此基礎上,運用Nr、KOG、GO和KEGG數(shù)據(jù)庫進行同源序列比對和基因功能分析。結(jié)果顯示:花生異型雄蕊轉(zhuǎn)錄組測序共獲得數(shù)據(jù)量約31.46 G,其中,clean reads所占比例均在96.0%以上;經(jīng)過組裝和拼接后得到197 193個contigs,片段總長度240 463 900 bp,最長片段為15 810 bp,非冗余unigenes片段的平均長度為1 219 bp,GC含量為39.1%,片段長度N50為1 966 bp;長度大于等于1 000 bp的unigenes占unigenes總數(shù)的43.4%,表明組裝完整性較高,可用于注釋分析。與Nr數(shù)據(jù)庫的比對結(jié)果顯示:共有129 223個unigenes注釋到Nr數(shù)據(jù)庫,占unigenes總數(shù)的65.5%;其中,1×10^-100<E≤1×10^-5的unigenes占54.2%,說明注釋的unigenes序列與Nr數(shù)據(jù)庫的同源序列具有高度相似... 

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 總RNA的提取和檢測
        1.2.2 文庫制備和測序
        1.2.3 原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計和功能注釋
2 結(jié)果和分析
    2.1 測序結(jié)果和數(shù)據(jù)組裝結(jié)果分析
    2.2 unigenes功能注釋分析
        2.2.1 序列相似性分析
        2.2.2 KOG功能分析
        2.2.3 GO功能分析
        2.2.4 KEGG代謝通路分析
3 討論和結(jié)論


【參考文獻】：
期刊論文
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[3]Intrafloral differentiation of stamens in heterantherous flowers[J]. 1,2Zhong-Lai LUO 1,2Lei GU 1Dian-Xiang ZHANG 1(South China Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Guangzhou 510650, China) 2(Graduate University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China).  Journal of Systematics and Evolution. 2009(01)
[4]異型雄蕊的研究進展[J]. 羅中萊,張奠湘.  熱帶亞熱帶植物學報. 2005(06)
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本文編號：3649044