為分析不同來源廣金錢草的遺傳關(guān)系,本研究利用SLAF-seq技術(shù)對(duì)來自廣東、廣西、海南的20份廣金錢草樣品進(jìn)行測(cè)序,共獲得SLAF標(biāo)簽322 360個(gè),鑒定到72 395個(gè)多態(tài)性SLAF標(biāo)簽。進(jìn)行過濾后開發(fā)得到SNP多態(tài)標(biāo)記220 704個(gè),分析得到94 505個(gè)高一致性的群體SNP。通過對(duì)20份不同來源的廣金錢草個(gè)體完成系統(tǒng)進(jìn)化樹、群體結(jié)構(gòu)分析,結(jié)果表明,20份廣金錢草來源于同一祖先,但由于地理隔離的影響使得個(gè)體間發(fā)生了遺傳分化。通過系統(tǒng)進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn)分布在廣東、廣西及海南瓊中、屯昌的廣金錢草具有較近的親緣關(guān)系。研究結(jié)果為種質(zhì)保護(hù)和遺傳改良提供參考。 

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 結(jié)果與分析
    1.1 測(cè)序數(shù)據(jù)與評(píng)估
    1.2 SLAF標(biāo)簽與SNP標(biāo)記的鑒定
    1.3 遺傳進(jìn)化分析
        1.3.1 遺傳多樣性分析
        1.3.2 系統(tǒng)發(fā)育分析
        1.3.3 遺傳結(jié)構(gòu)分析
2 討論
3 材料與方法
    3.1 試驗(yàn)材料
    3.2 基因組DNA制備
    3.3 酶切方案設(shè)計(jì)
    3.4 Illumina HiSeq測(cè)序及產(chǎn)出數(shù)據(jù)的質(zhì)量分析
    3.5 SLAF標(biāo)簽和SNP標(biāo)記開發(fā)


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[6]廣金錢草種子萌發(fā)特性及種子硬實(shí)研究[J]. 唐曉敏,程軒軒,楊全,張春榮,盧挺,潘海運(yùn).  種子. 2014(03)
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[8]浙江產(chǎn)車前（Plantago asiatica）種群遺傳分化的主坐標(biāo)分析[J]. 郭水良,張東旭,曹同.  應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2002(10)

碩士論文
[1]廣金錢草生長(zhǎng)和品質(zhì)適宜性區(qū)劃研究[D]. 李丹.廣東藥科大學(xué) 2017



本文編號(hào)：3648287