非生物脅迫下蒙古黃芪與堿蓬基因組MSAP對(duì)比分析
發(fā)布時(shí)間:2022-02-26 22:07
本研究對(duì)比分析了珍惜中藥材蒙古黃芪與堿蓬基因組的DNA甲基化之間的關(guān)系。挑選內(nèi)蒙古等地區(qū)的非生物脅迫因素——高鹽,以蒙古黃芪和堿蓬培養(yǎng)7 d苗齡幼苗為前期材料,利用NaCl模擬不同程度的高鹽脅迫,提取二者的DNA后進(jìn)行基因組的甲基化分析,分別研究高鹽脅迫下DNA甲基化程度的變化。結(jié)果顯示,與正常生長下的蒙古黃芪和堿蓬基因組相比,蒙古黃芪DNA甲基化程度隨鹽濃度增加,MSAP比例從大到小在51.2%~35.3%之間變化;堿蓬DNA甲基化程度隨鹽濃度增加,MSAP比例從大到小在68.4%~56.8%之間變化。說明蒙古黃芪和堿蓬DNA甲基化的MSAP比率隨鹽濃度增加呈下降趨勢(shì),與脅迫呈顯著負(fù)相關(guān)。且古黃芪MSAP的下降趨勢(shì)更加明顯,由此假設(shè),由于鹽生堿蓬屬耐鹽性植物,自身具有良好的抗鹽機(jī)制,因此,與蒙古黃芪比較,鹽脅迫下,堿蓬某些抗鹽基因更易被啟動(dòng),進(jìn)一步論證發(fā)現(xiàn)鹽脅迫引起的低甲基化與抗鹽基因表達(dá)之間存在一定的關(guān)系。
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(12)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
堿蓬和蒙古黃芪DNA的提取及其1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
圖1 堿蓬和蒙古黃芪DNA的提取及其1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果與正常生長下的蒙古黃芪和堿蓬基因組相比,蒙古黃芪,DNA甲基化程度隨鹽濃度增加,MSAP比例從大到小在51.2%~35.3%之間變化;堿蓬,DNA甲基化程度隨鹽濃度增加,MSAP比例從大到小在68.4%~56.8%之間變化。兩種材料都出現(xiàn)隨鹽濃度升高,MSAP比率呈下降趨勢(shì)。這個(gè)結(jié)論與以下結(jié)論類似,李雪林等(2009)研究表明棉花經(jīng)梯度鹽濃度處理后,DNA甲基化比率均低于對(duì)照41.2%;孫麗芳等(2017)研究表明玉米經(jīng)梯度鹽濃度處理后,其中只有50 mmol/L Na Cl處理高于CK,其他處理呈下降趨勢(shì),去甲基化變化幅度相對(duì)較大。
結(jié)果與正常生長下的蒙古黃芪和堿蓬基因組相比,蒙古黃芪,DNA甲基化程度隨鹽濃度增加,MSAP比例從大到小在51.2%~35.3%之間變化;堿蓬,DNA甲基化程度隨鹽濃度增加,MSAP比例從大到小在68.4%~56.8%之間變化。兩種材料都出現(xiàn)隨鹽濃度升高,MSAP比率呈下降趨勢(shì)。這個(gè)結(jié)論與以下結(jié)論類似,李雪林等(2009)研究表明棉花經(jīng)梯度鹽濃度處理后,DNA甲基化比率均低于對(duì)照41.2%;孫麗芳等(2017)研究表明玉米經(jīng)梯度鹽濃度處理后,其中只有50 mmol/L Na Cl處理高于CK,其他處理呈下降趨勢(shì),去甲基化變化幅度相對(duì)較大。圖4 堿蓬DNA甲基化隨鹽濃度變化曲線
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]非生物脅迫蒙古黃芪基因組的MSAP分析[J]. 韓雅楠,趙犇鵬,崔向軍. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020(07)
[2]鹽脅迫誘導(dǎo)玉米苗期DNA甲基化變異的研究[J]. 孫麗芳,胡凱鳳,高樹仁,王霞,趙偉,苗興芬,楊克軍. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2017(04)
[3]黃芪生物學(xué)及化學(xué)成分研究進(jìn)展[J]. 王玲麗,豐華玲,楊柯,滕紅梅,胡正海. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(06)
[4]NaCl和Na2CO3對(duì)不同棉花基因組的DNA甲基化影響[J]. 陸許可,王德龍,陰祖軍,王俊娟,樊偉麗,王帥,趙小潔,張?zhí)毂?葉武威. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(16)
[5]鹽脅迫對(duì)菘藍(lán)基因組DNA甲基化的影響[J]. 楊飛,聶浩,徐延浩. 中藥材. 2013(04)
[6]利用MSAP分析18個(gè)芥藍(lán)齊口期的表觀遺傳多樣性[J]. 史衛(wèi)東,黃如葵,陳振東,羅海玲,康紅衛(wèi),梁家作,劉杏連. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2012(05)
[7]鹽脅迫下紅花基因組DNA甲基化的MSAP分析[J]. 李慧,彭立新,于瑋瑋,馮濤,林木強(qiáng),閻國榮. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2011(12)
[8]堿蓬資源的開發(fā)價(jià)值[J]. 任偉重,姜華,鄭音,修玉萍. 遼寧農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(05)
[9]NaCl脅迫下堿蓬基因組MSAP分析[J]. 趙秀娟,韓雅楠,蔡祿. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(18)
[10]鹽脅迫下棉花基因組DNA表觀遺傳變化的MSAP分析[J]. 李雪林,林忠旭,聶以春,郭小平,張獻(xiàn)龍. 作物學(xué)報(bào). 2009(04)
碩士論文
[1]NaCl脅迫下蒙古黃芪和堿蓬基因組DNA甲基化水平分析[D]. 韓雅楠.內(nèi)蒙古科技大學(xué) 2011
[2]水稻胚性愈傷組織誘導(dǎo)和植株再生伴隨DNA胞嘧啶甲基化的減少和恢復(fù)[D]. 苗高健.東北師范大學(xué) 2009
本文編號(hào):3645067
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(12)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
堿蓬和蒙古黃芪DNA的提取及其1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
圖1 堿蓬和蒙古黃芪DNA的提取及其1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果與正常生長下的蒙古黃芪和堿蓬基因組相比,蒙古黃芪,DNA甲基化程度隨鹽濃度增加,MSAP比例從大到小在51.2%~35.3%之間變化;堿蓬,DNA甲基化程度隨鹽濃度增加,MSAP比例從大到小在68.4%~56.8%之間變化。兩種材料都出現(xiàn)隨鹽濃度升高,MSAP比率呈下降趨勢(shì)。這個(gè)結(jié)論與以下結(jié)論類似,李雪林等(2009)研究表明棉花經(jīng)梯度鹽濃度處理后,DNA甲基化比率均低于對(duì)照41.2%;孫麗芳等(2017)研究表明玉米經(jīng)梯度鹽濃度處理后,其中只有50 mmol/L Na Cl處理高于CK,其他處理呈下降趨勢(shì),去甲基化變化幅度相對(duì)較大。
結(jié)果與正常生長下的蒙古黃芪和堿蓬基因組相比,蒙古黃芪,DNA甲基化程度隨鹽濃度增加,MSAP比例從大到小在51.2%~35.3%之間變化;堿蓬,DNA甲基化程度隨鹽濃度增加,MSAP比例從大到小在68.4%~56.8%之間變化。兩種材料都出現(xiàn)隨鹽濃度升高,MSAP比率呈下降趨勢(shì)。這個(gè)結(jié)論與以下結(jié)論類似,李雪林等(2009)研究表明棉花經(jīng)梯度鹽濃度處理后,DNA甲基化比率均低于對(duì)照41.2%;孫麗芳等(2017)研究表明玉米經(jīng)梯度鹽濃度處理后,其中只有50 mmol/L Na Cl處理高于CK,其他處理呈下降趨勢(shì),去甲基化變化幅度相對(duì)較大。圖4 堿蓬DNA甲基化隨鹽濃度變化曲線
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]鹽脅迫誘導(dǎo)玉米苗期DNA甲基化變異的研究[J]. 孫麗芳,胡凱鳳,高樹仁,王霞,趙偉,苗興芬,楊克軍. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2017(04)
[3]黃芪生物學(xué)及化學(xué)成分研究進(jìn)展[J]. 王玲麗,豐華玲,楊柯,滕紅梅,胡正海. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(06)
[4]NaCl和Na2CO3對(duì)不同棉花基因組的DNA甲基化影響[J]. 陸許可,王德龍,陰祖軍,王俊娟,樊偉麗,王帥,趙小潔,張?zhí)毂?葉武威. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(16)
[5]鹽脅迫對(duì)菘藍(lán)基因組DNA甲基化的影響[J]. 楊飛,聶浩,徐延浩. 中藥材. 2013(04)
[6]利用MSAP分析18個(gè)芥藍(lán)齊口期的表觀遺傳多樣性[J]. 史衛(wèi)東,黃如葵,陳振東,羅海玲,康紅衛(wèi),梁家作,劉杏連. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2012(05)
[7]鹽脅迫下紅花基因組DNA甲基化的MSAP分析[J]. 李慧,彭立新,于瑋瑋,馮濤,林木強(qiáng),閻國榮. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2011(12)
[8]堿蓬資源的開發(fā)價(jià)值[J]. 任偉重,姜華,鄭音,修玉萍. 遼寧農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(05)
[9]NaCl脅迫下堿蓬基因組MSAP分析[J]. 趙秀娟,韓雅楠,蔡祿. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(18)
[10]鹽脅迫下棉花基因組DNA表觀遺傳變化的MSAP分析[J]. 李雪林,林忠旭,聶以春,郭小平,張獻(xiàn)龍. 作物學(xué)報(bào). 2009(04)
碩士論文
[1]NaCl脅迫下蒙古黃芪和堿蓬基因組DNA甲基化水平分析[D]. 韓雅楠.內(nèi)蒙古科技大學(xué) 2011
[2]水稻胚性愈傷組織誘導(dǎo)和植株再生伴隨DNA胞嘧啶甲基化的減少和恢復(fù)[D]. 苗高健.東北師范大學(xué) 2009
本文編號(hào):3645067
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