西北荒漠區(qū)野生黑果枸杞種質(zhì)資源遺傳多樣性分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-01 18:57
目的:分析不同來源野生黑果枸杞遺傳差異和親緣關(guān)系,為黑果枸杞資源鑒定和有效利用提供科學(xué)依據(jù)。方法:采用SSR分子標(biāo)記對(duì)西北四省區(qū)22份野生枸杞種質(zhì)材料進(jìn)行鑒定,利用POPGENE 1.32和NTSYS-pc 2.10生物信息學(xué)軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,分析黑果枸杞種質(zhì)遺傳多樣性,計(jì)算遺傳相似系數(shù),繪制聚類圖。結(jié)果:篩選出多態(tài)性SSR引物37對(duì),在22個(gè)樣品中共檢測(cè)到233個(gè)基因位點(diǎn),其中多態(tài)性位點(diǎn)213個(gè),多態(tài)性比率(Polymorphism ratio,P)達(dá)91.4%。材料間遺傳相似系數(shù)(Genetic similarity,GS)在0.483 1~0.936 4之間,平均有效等位基因數(shù)(Effective number of alleles,Ne)為1.331 4,多樣性指數(shù)(Nei’s gene diversity,H)為0.210 6,Shannon信息指數(shù)(Shannon’s information index,I)為0.338 4。聚類分析(Unweighted pair group of arithmetic means,UPGMA)顯示,在相似系數(shù)為0.61和0.77處,可...
【文章來源】:中國野生植物資源. 2020,39(11)CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
引物對(duì)CAN130829、TOM180、SSR22對(duì)22份枸杞材料的PCR擴(kuò)增結(jié)果
本研究采用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)來自甘肅、青海、寧夏、新疆不同省區(qū)的22個(gè)枸杞材料進(jìn)行遺傳多樣性分析,篩選出37對(duì)SSR引物共檢測(cè)到233個(gè)等位變異,其中多態(tài)性位點(diǎn)213個(gè),平均每個(gè)引物擴(kuò)增條帶數(shù)為6.3條,多態(tài)性位點(diǎn)比率為91.4%,遺傳相似系數(shù)在0.483 1~0.936 4之間,平均GS值為0.628 6,在分子水平上證明了不同省區(qū)供試黑果枸杞之間差異較大,遺傳多樣性較為豐富。通過遺傳距離測(cè)算明確了供試材料間親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近,以大武口十分溝和阿克塞多巴溝的黑果枸杞遺傳相似系數(shù)最大(0.936 4),可能是由于地區(qū)之間相互引種引起枸杞遺傳背景相似;而表型性狀非常相似的寧杞1號(hào)和寧杞2號(hào)借助分子標(biāo)記可以有效區(qū)分開來,充分證明了SSR標(biāo)記技術(shù)可以從分子水平上有效鑒別枸杞種質(zhì)間的遺傳差異。本研究篩選出的37對(duì)SSR引物,將為枸杞品種鑒定和今后枸杞遺傳育種研究提供技術(shù)支撐。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于SSR標(biāo)記的不同優(yōu)勢(shì)等級(jí)云南松遺傳多樣性分析[J]. 蔡年輝,許玉蘭,王亞楠,陳詩,汪夢(mèng)婷,李根前. 植物研究. 2019(01)
[2]利用SSR標(biāo)記構(gòu)建枸杞品種分子身份證[J]. 尹躍,趙建華,安巍,李彥龍,何軍,曹有龍. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(09)
[3]枸杞品種SSR熒光指紋圖譜構(gòu)建及遺傳關(guān)系分析[J]. 尹躍,安巍,趙建華,李彥龍,樊云芳,曹有龍. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2017(01)
[4]黑果枸杞抗逆性及栽培育種研究進(jìn)展[J]. 劉麗萍,張東智,張沖,陳金煥. 生物技術(shù)通報(bào). 2016(10)
[5]新疆枸杞種質(zhì)資源遺傳多樣性分析及DNA指紋圖譜構(gòu)建[J]. 查美琴,趙玉玲,李疆,朱瑜,羅淑萍,胡月. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2016(06)
[6]黑果枸杞色素研究進(jìn)展[J]. 金玲,婁濤濤,陳天強(qiáng),張旭. 亞太傳統(tǒng)醫(yī)藥. 2016(05)
[7]十七份中美枸杞材料的SSR遺傳多樣性[J]. 胡秉芬,張寶琳,蔡國軍,王三英,仲玲玲,武蕾. 北方園藝. 2016(01)
[8]柴達(dá)木地區(qū)野生黑果枸杞種群遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 王錦楠,陳進(jìn)福,陳武生,周新洋,許東,李際紅,亓?xí)? 植物生態(tài)學(xué)報(bào). 2015(10)
[9]利用SSR技術(shù)對(duì)十七份枸杞材料進(jìn)行遺傳多樣性分析及標(biāo)準(zhǔn)指紋圖譜構(gòu)建[J]. 邵千順,高磊,南雄雄,徐美隆,李永華,王錦秀. 北方園藝. 2015(12)
[10]黑果枸杞資源分布及其經(jīng)濟(jì)價(jià)值[J]. 韓麗娟,葉英,索有瑞. 中國野生植物資源. 2014(06)
碩士論文
[1]枸杞品種(系)分子鑒定及親緣關(guān)系分析[D]. 尹躍.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[2]黑果枸杞果實(shí)多糖的制備與抗疲勞、降血糖生物功效的研究[D]. 陳曉琴.新疆師范大學(xué) 2007
本文編號(hào):3562643
【文章來源】:中國野生植物資源. 2020,39(11)CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
引物對(duì)CAN130829、TOM180、SSR22對(duì)22份枸杞材料的PCR擴(kuò)增結(jié)果
本研究采用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)來自甘肅、青海、寧夏、新疆不同省區(qū)的22個(gè)枸杞材料進(jìn)行遺傳多樣性分析,篩選出37對(duì)SSR引物共檢測(cè)到233個(gè)等位變異,其中多態(tài)性位點(diǎn)213個(gè),平均每個(gè)引物擴(kuò)增條帶數(shù)為6.3條,多態(tài)性位點(diǎn)比率為91.4%,遺傳相似系數(shù)在0.483 1~0.936 4之間,平均GS值為0.628 6,在分子水平上證明了不同省區(qū)供試黑果枸杞之間差異較大,遺傳多樣性較為豐富。通過遺傳距離測(cè)算明確了供試材料間親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近,以大武口十分溝和阿克塞多巴溝的黑果枸杞遺傳相似系數(shù)最大(0.936 4),可能是由于地區(qū)之間相互引種引起枸杞遺傳背景相似;而表型性狀非常相似的寧杞1號(hào)和寧杞2號(hào)借助分子標(biāo)記可以有效區(qū)分開來,充分證明了SSR標(biāo)記技術(shù)可以從分子水平上有效鑒別枸杞種質(zhì)間的遺傳差異。本研究篩選出的37對(duì)SSR引物,將為枸杞品種鑒定和今后枸杞遺傳育種研究提供技術(shù)支撐。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于SSR標(biāo)記的不同優(yōu)勢(shì)等級(jí)云南松遺傳多樣性分析[J]. 蔡年輝,許玉蘭,王亞楠,陳詩,汪夢(mèng)婷,李根前. 植物研究. 2019(01)
[2]利用SSR標(biāo)記構(gòu)建枸杞品種分子身份證[J]. 尹躍,趙建華,安巍,李彥龍,何軍,曹有龍. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(09)
[3]枸杞品種SSR熒光指紋圖譜構(gòu)建及遺傳關(guān)系分析[J]. 尹躍,安巍,趙建華,李彥龍,樊云芳,曹有龍. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2017(01)
[4]黑果枸杞抗逆性及栽培育種研究進(jìn)展[J]. 劉麗萍,張東智,張沖,陳金煥. 生物技術(shù)通報(bào). 2016(10)
[5]新疆枸杞種質(zhì)資源遺傳多樣性分析及DNA指紋圖譜構(gòu)建[J]. 查美琴,趙玉玲,李疆,朱瑜,羅淑萍,胡月. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2016(06)
[6]黑果枸杞色素研究進(jìn)展[J]. 金玲,婁濤濤,陳天強(qiáng),張旭. 亞太傳統(tǒng)醫(yī)藥. 2016(05)
[7]十七份中美枸杞材料的SSR遺傳多樣性[J]. 胡秉芬,張寶琳,蔡國軍,王三英,仲玲玲,武蕾. 北方園藝. 2016(01)
[8]柴達(dá)木地區(qū)野生黑果枸杞種群遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 王錦楠,陳進(jìn)福,陳武生,周新洋,許東,李際紅,亓?xí)? 植物生態(tài)學(xué)報(bào). 2015(10)
[9]利用SSR技術(shù)對(duì)十七份枸杞材料進(jìn)行遺傳多樣性分析及標(biāo)準(zhǔn)指紋圖譜構(gòu)建[J]. 邵千順,高磊,南雄雄,徐美隆,李永華,王錦秀. 北方園藝. 2015(12)
[10]黑果枸杞資源分布及其經(jīng)濟(jì)價(jià)值[J]. 韓麗娟,葉英,索有瑞. 中國野生植物資源. 2014(06)
碩士論文
[1]枸杞品種(系)分子鑒定及親緣關(guān)系分析[D]. 尹躍.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[2]黑果枸杞果實(shí)多糖的制備與抗疲勞、降血糖生物功效的研究[D]. 陳曉琴.新疆師范大學(xué) 2007
本文編號(hào):3562643
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