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東方山羊豆種質資源ISSR分析

發(fā)布時間:2021-10-21 21:53
  【目的】分析東方山羊豆種質資源遺傳多樣性,為其種質資源鑒定評價、新品種選育及開發(fā)利用提供理論參考�!痉椒ā恳�4份引進東方山羊豆種質及其29份雜交后代為材料,利用ISSR引物對其進行多態(tài)性擴增,并以PopGene32計算其遺傳參數(shù),采用NTsys-pc 2.1計算遺傳相似系數(shù),運用SHAN模型中的非加權配對算術平均法(UPGMA)繪制聚類樹狀圖�!窘Y果】從24條ISSR引物中篩選出8條擴增條帶清晰、多態(tài)性良好且易擴增的引物,利用其從33份東方山羊豆種質材料中共擴增出79條條帶,其中65條具有多態(tài)性,多態(tài)百分率為82.15%;觀察等位基因數(shù)(Na)為1.6667~2.0000,平均為1.8215,有效等位基因數(shù)(Ne)為1.2212~1.5740,平均為1.4242;Nei’基因多樣性指數(shù)(H)為0.1521~0.3322,平均為0.2509,Shannon多態(tài)信息指數(shù)(I)為0.2473~0.4976,平均為0.3813。這些種質材料遺傳相似系數(shù)為0.5696~0.9241,平均為0.7623,在0.7140處可劃分為三大類群(Ⅰ~Ⅲ),分別包含25、3和5份種質材料,不同地理來源種質相... 

【文章來源】:南方農(nóng)業(yè)學報. 2020,51(11)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

東方山羊豆種質資源ISSR分析


33份東方山羊豆種質材料基因組DNA的檢測結果

山羊,材料,親緣關系,基因組DNA


引物834對33份東方山羊豆種質材料的PCR擴增結果

種質資源,山羊,聚類分析,類群


通過UPGMA法對33份供試材料的ISSR多態(tài)性進行聚類分析,結果如圖4所示。33份東方山羊豆種質資源在遺傳相似系數(shù)0.7140處可分為三大類群(Ⅰ~Ⅲ)。第Ⅰ類群包括25份種質,其在遺傳相似系數(shù)0.7260處又可分為2個亞群Ⅰ-1和Ⅰ-2:Ⅰ-1亞類包括23份種質,其中GY07號白花(編號7)、ZNK18(編號26)、GYN18(編號29)和GYP18(編號30)與其他19份種質的遺傳相似系數(shù)介于0.7380~0.7500,說明其親緣關系較遠,遺傳多樣性較豐富;進一步分析發(fā)現(xiàn),在這19份種質中,GY04號白花(編號4)與GY05號白花(編號5)種質間的親緣關系最近,遺傳差異最小,其余17份種質中位于同一小分支種質的親緣關系較近,遺傳多樣性較低,如ZNH18(編號23)與GYI18(編號24)二者間、ZNE18(編號22)、ZN小葉(編號20)和GY大葉(編號19)三者間等。Ⅰ-2亞群包括GY08號白花(編號8)和GY17號白花(編號15)2份種質,二者的遺傳相似系數(shù)為0.7342,說明其親緣關系較遠,存在一定的遺傳差異。第Ⅱ類群包括GY10號白花(編號10)、GY16號白花(編號14)和GYD18白花(編號16)3份種質。第Ⅲ類群包括GYJ18(編號25)、GYM18(編號28)、GYQ18(編號31)、GYS18(編號33)和GYR18(編號32)等5份種質,其中GYR18與另外4份遺傳相似系數(shù)介于0.7140~0.7260,說明其親緣關系較遠,遺傳差異較大,遺傳多樣性較豐富。綜上所述,不同地理來源種質相互混雜分布,種質資源間遺傳分布與地理來源間無明顯相關性,第Ⅱ類群和第Ⅲ類群東方山羊豆種質材料間遺傳多樣性較第Ⅰ類群豐富。3 討論

【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:3449782

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