基于cp DNA序列,研究柴達(dá)木野生黑果枸杞（Lycium ruthenicum）的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)和單倍型進化關(guān)系,可為其種群的遺傳保護提供理論依據(jù)。該研究基于3個篩選的葉綠體多態(tài)引物:psb A-trn H、psb K-psb I和trn V,利用群體遺傳分析方法研究柴達(dá)木盆地野生黑果枸杞的遺傳變異格局:利用軟件DnaSP6.0和Permut2.0計算分子多樣性指標(biāo),利用分子方差分析研究組間和種群間的遺傳變異來源,利用單倍型網(wǎng)絡(luò)分析和主坐標(biāo)分析研究單倍型的聚類關(guān)系;利用最大似然樹和貝葉斯系統(tǒng)樹分析單倍型的譜系進化關(guān)系。結(jié)果顯示:葉綠體序列psb A-trn H、psb K-psb I和trn V拼接后的總長度為1 454 bp,鑒別出14個核苷酸變異位點,共定義了7個單倍型。種群間總的遺傳多樣（hT）和種群內(nèi)遺傳多樣性（hS）分別為0.916和0.512。AMOVA分析結(jié)果表明,80%以上的遺傳變異來源于組間和種群間。葉綠體單倍型的貝葉斯系統(tǒng)樹和最大似然樹均表明柴達(dá)木盆地黑果枸杞種群聚為2支:德令哈和格爾木為一支,諾木洪為另一支。單倍型網(wǎng)絡(luò)和主坐標(biāo)分析結(jié)果揭示的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和聚類關(guān)... 

【文章來源】：植物生態(tài)學(xué)報. 2020,44(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

柴達(dá)木盆地黑果枸杞7個葉綠體單倍型(H1–H7)的地理分布及其單倍型網(wǎng)絡(luò)。圖中居群編碼與表1一致,餅圖表示各居群的單倍型頻率。A,單倍型網(wǎng)絡(luò),圖中圓圈大小與單倍型頻率成正比,節(jié)點間的分支長度大致與單倍型的突變數(shù)成正比,相應(yīng)分支附近附有步長;龍葵作為外類群。

柴達(dá)木盆地黑果枸杞基于種群水平的前三個坐標(biāo)的主坐標(biāo)分析(PCo A)。

柴達(dá)木盆地黑果枸杞種群間總的遺傳多樣性(hT=0.916)顯著高于種群內(nèi)遺傳多樣性(hS=0.512)。相關(guān)學(xué)者基于核DNA標(biāo)記對西北部分黑果枸杞種群及對柴達(dá)木盆地黑果枸杞種群的遺傳多樣性研究,也表明該植物種群具有較高的遺傳多樣性水平(Liu et al.,2012;王錦楠等,2015)。另外,對柴達(dá)木盆地黑果枸杞種群開展的表型性狀變異研究,也表明該植物存在豐富的形態(tài)變異(劉桂英等,2016)。一方面,黑果枸杞是絲綢之路鹽堿地、荒漠地最具有開發(fā)價值的特色資源物種,也是枸杞原生態(tài)區(qū)遺傳多樣性相對豐富的原始物種(郝媛媛等,2016)。另一方面,采樣區(qū)黑果枸杞的生境多樣性較高,包括湖泊盆地、沖積扇、河流沿岸、風(fēng)積沙丘邊緣和山間鹽土平原,環(huán)境的異質(zhì)性利于遺傳突變的產(chǎn)生和遺傳變異的累積(Ma et al.,2019;孫芳芳等,2019)。而且,基于葉綠體序列變異還揭示出諾木洪組的兩個種群表現(xiàn)出了相對較高的遺傳多樣性水平(表1)。這可能是由于諾木洪農(nóng)場和林業(yè)站黑果枸杞種群的個體數(shù)相對較多,受干擾較小,利于遺傳變異的產(chǎn)生與積累。諾木洪也被推測為柴達(dá)木地區(qū)野生黑果枸杞種質(zhì)資源的中心分布區(qū)(王錦楠等,2015;劉桂英等,2016)。3.2 柴達(dá)木盆地黑果枸杞種群的遺傳結(jié)構(gòu)與遺傳分化

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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