以500個茶（Camellia sinensis （L.） O. Ktze.）葉片的蛋白質(zhì)作為數(shù)據(jù)集,比較TargetP、WoLF PSORT、LocTree和Plant-mPLoc 4種軟件預測亞細胞定位的可信度和靈敏度。結(jié)果顯示,4種軟件預測可信度均高于80%,依次排序為TargetP> LocTree> WoLF PSORT> Plant-mPLoc。其中,LocTree對細胞質(zhì)蛋白和分泌蛋白檢測靈敏度最高,但對葉綠體蛋白靈敏度最低; Plant-mPLoc檢測核蛋白最靈敏,但對細胞質(zhì)蛋白最不敏感;TargetP檢測葉綠體蛋白最靈敏,但僅能區(qū)分3個亞細胞器官; WoLF PSORT對分泌蛋白檢測靈敏度最低,但對其他蛋白均較靈敏�；谏鲜鼋Y(jié)果,該研究針對4種軟件提出了合理的使用建議。 

【文章來源】：植物科學學報. 2020,38(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

4種算法分析500個茶葉片蛋白質(zhì)的亞細胞定位

500個茶葉片蛋白質(zhì)亞細胞定位

圖2 500個茶葉片蛋白質(zhì)亞細胞定位綜上，4種軟件中Loc Tree對cy蛋白、分泌途徑蛋白檢測靈敏度最高，Target P和Plantm PLoc分別對ch蛋白和核蛋白檢測最為靈敏。

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3408076