以500個(gè)茶（Camellia sinensis （L.） O. Ktze.）葉片的蛋白質(zhì)作為數(shù)據(jù)集,比較TargetP、WoLF PSORT、LocTree和Plant-mPLoc 4種軟件預(yù)測(cè)亞細(xì)胞定位的可信度和靈敏度。結(jié)果顯示,4種軟件預(yù)測(cè)可信度均高于80%,依次排序?yàn)門(mén)argetP> LocTree> WoLF PSORT> Plant-mPLoc。其中,LocTree對(duì)細(xì)胞質(zhì)蛋白和分泌蛋白檢測(cè)靈敏度最高,但對(duì)葉綠體蛋白靈敏度最低; Plant-mPLoc檢測(cè)核蛋白最靈敏,但對(duì)細(xì)胞質(zhì)蛋白最不敏感;TargetP檢測(cè)葉綠體蛋白最靈敏,但僅能區(qū)分3個(gè)亞細(xì)胞器官; WoLF PSORT對(duì)分泌蛋白檢測(cè)靈敏度最低,但對(duì)其他蛋白均較靈敏。基于上述結(jié)果,該研究針對(duì)4種軟件提出了合理的使用建議。 

【文章來(lái)源】：植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2020,38(05)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

4種算法分析500個(gè)茶葉片蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位

500個(gè)茶葉片蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位

圖2 500個(gè)茶葉片蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位綜上，4種軟件中Loc Tree對(duì)cy蛋白、分泌途徑蛋白檢測(cè)靈敏度最高，Target P和Plantm PLoc分別對(duì)ch蛋白和核蛋白檢測(cè)最為靈敏。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]花椰菜BobACT基因的克隆及其作為內(nèi)參基因的研究[J]. 林琿,朱海生,溫慶放,黃麗芳.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2019(03)
[2]蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)研究進(jìn)展[J]. 李立奇,萬(wàn)瑛.  免疫學(xué)雜志. 2009(05)
[3]蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位的生物信息學(xué)研究[J]. 張松,黃波,夏學(xué)峰,孫之榮.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2007(06)
[4]植物蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位研究進(jìn)展[J]. 邢浩然,劉麗娟,劉國(guó)振.  華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2006(S2)



本文編號(hào)：3408076