飼料作物的同源基因數(shù)據(jù)庫構建及對農(nóng)用飼料方面的應用
發(fā)布時間:2021-09-22 11:23
隨著玉米、水稻、小麥等多種飼料作物的不同版本參考基因組序列陸續(xù)公布,基因組學研究已進入"泛基因組時代"。針對現(xiàn)有的飼料作物同源基因查詢數(shù)據(jù)庫,僅考慮每個飼料作物中的一個參考基因組已不能滿足不同飼料作物物種多版本基因組的同源基因查詢研究需求。在中國農(nóng)業(yè)大學小麥研究中心構建的"小麥族GeneTribe"同源基因數(shù)據(jù)庫基礎上,通過構建多飼料作物的泛基因組同源基因數(shù)據(jù)庫GenelnterTribe,實現(xiàn)不同飼料作物同源基因可查詢,推動大數(shù)據(jù)時代農(nóng)業(yè)研究進入新的境界。
【文章來源】:中國飼料. 2020,(24)北大核心
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 多種飼料作物基因共線性分析
2 多飼料作物泛基因組同源基因數(shù)據(jù)庫的傳遞性原理分析
2.1 傳遞性分析的總的算法核心原理
2.2 使用公認的參考基因組進行跨物種親緣關系比對
2.3 通過“假基因組”即人造基因組進行物種與物種之間親緣關系的比對算法
3 多飼料作物泛基因組同源基因數(shù)據(jù)庫的搭建流程及文件基礎
4 多作物泛基因組同源基因數(shù)據(jù)庫在飼料方面的前景
4.1 探尋不同飼料作物之間的親緣關系,評估成為潛在飼料作物的可能性
4.2 提升飼料作物的產(chǎn)量和品質
4.3 為飼料作物分子育種提供指導
【參考文獻】:
期刊論文
[1]高粱PHD-Finger基因家族的鑒定、分類及表達特征分析[J]. 楊溥原,崔江慧,任根增,高玉坤,魏世林,常金華. 山地農(nóng)業(yè)生物學報. 2020(04)
[2]小麥Dof轉錄因子家族全基因組鑒定和表達分析[J]. 任永康,牛瑜琦,逯成芳,唐朝暉. 河南農(nóng)業(yè)科學. 2020(09)
[3]小麥基因組研究現(xiàn)狀與展望[J]. 傅向東,劉倩,李振聲,張愛民,凌宏清,童依平,劉志勇. 中國科學院院刊. 2018(09)
博士論文
[1]基于高通量測序技術的小麥和紫莖澤蘭基因組學初步研究[D]. 聶小軍.西北農(nóng)林科技大學 2013
本文編號:3403677
【文章來源】:中國飼料. 2020,(24)北大核心
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 多種飼料作物基因共線性分析
2 多飼料作物泛基因組同源基因數(shù)據(jù)庫的傳遞性原理分析
2.1 傳遞性分析的總的算法核心原理
2.2 使用公認的參考基因組進行跨物種親緣關系比對
2.3 通過“假基因組”即人造基因組進行物種與物種之間親緣關系的比對算法
3 多飼料作物泛基因組同源基因數(shù)據(jù)庫的搭建流程及文件基礎
4 多作物泛基因組同源基因數(shù)據(jù)庫在飼料方面的前景
4.1 探尋不同飼料作物之間的親緣關系,評估成為潛在飼料作物的可能性
4.2 提升飼料作物的產(chǎn)量和品質
4.3 為飼料作物分子育種提供指導
【參考文獻】:
期刊論文
[1]高粱PHD-Finger基因家族的鑒定、分類及表達特征分析[J]. 楊溥原,崔江慧,任根增,高玉坤,魏世林,常金華. 山地農(nóng)業(yè)生物學報. 2020(04)
[2]小麥Dof轉錄因子家族全基因組鑒定和表達分析[J]. 任永康,牛瑜琦,逯成芳,唐朝暉. 河南農(nóng)業(yè)科學. 2020(09)
[3]小麥基因組研究現(xiàn)狀與展望[J]. 傅向東,劉倩,李振聲,張愛民,凌宏清,童依平,劉志勇. 中國科學院院刊. 2018(09)
博士論文
[1]基于高通量測序技術的小麥和紫莖澤蘭基因組學初步研究[D]. 聶小軍.西北農(nóng)林科技大學 2013
本文編號:3403677
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