NAC轉(zhuǎn)錄因子家族是植物特有的一類重要轉(zhuǎn)錄因子,廣泛參與植物生長、發(fā)育以及器官的建成、逆境脅迫應(yīng)答等過程。為進(jìn)一步研究白羊草（Bothriochloa ischaemum）NAC轉(zhuǎn)錄因子家族,本研究利用生物信息學(xué)方法對白羊草NAC基因所編碼的蛋白理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)、保守基序、亞細(xì)胞定位、潛在磷酸化位點及系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行了分析。結(jié)果顯示,具有NAC結(jié)構(gòu)域的21條白羊草氨基酸序列共分為10個亞家族,蛋白二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲為主要組成部分,含有5個保守基序,大多數(shù)NAC蛋白定位于細(xì)胞核,均含有潛在的絲氨酸（Ser）、蘇氨酸（Thr）、和酪氨酸（Tyr）磷酸化位點。本研究將為白羊草NAC基因家族的進(jìn)一步功能分析奠定重要的研究基礎(chǔ)。 

【文章來源】：草地學(xué)報. 2020,28(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

白羊草NAC基因家族成員的系統(tǒng)進(jìn)化分析

從理化性質(zhì)分析結(jié)果中發(fā)現(xiàn)(表1),白羊草NAC蛋白序列的平均長度為363個氨基酸,平均分子量為40.07 kDa,其中白羊草NAC轉(zhuǎn)錄因子家族中蛋白分子量最大的蛋白為BiNAC18,編碼673個氨基酸,相對分子量為75.92 kDa,分子量最小的蛋白為BiNAC10,編碼141個氨基酸,相對分子量為16.97 kDa。白羊草NAC基因家族蛋白包含酸性蛋白12個,堿性蛋白9個,其中BiNAC5的堿性最強(10.79),BiNAC8的酸性最強(4.4);從白羊草NAC蛋白的親水性預(yù)測結(jié)果可以看出,21個NAC蛋白的親水性平均系數(shù)均為負(fù)值,說明它們都是親水性蛋白,只是在親水的程度上存在著差異,其中兩性氨基酸的數(shù)量為9個,分別為BiNAC1(-0.497)、BiNAC2(-0.438)、BiNAC7(-0.402)、BiNAC8(-0.452)、BiNAC14(-0.377)、BiNAC16(-0.409)、BiNAC18(-0.439)、BiNAC19(-0.207)、BiNAC20(-0.464)。蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)>40即為不穩(wěn)定蛋白質(zhì),白羊草NAC轉(zhuǎn)錄因子家族中有4個穩(wěn)定性蛋白,17個不穩(wěn)定蛋白。2.4 白羊草NAC轉(zhuǎn)錄因子家族基因蛋白質(zhì)的磷酸化修飾位點的預(yù)測分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]白羊草葉片和根系干旱脅迫下microRNAs差異表達(dá)分析[J]. 李春艷,董潔,鐘華,董寬虎.  草地學(xué)報. 2019(03)
[2]蓖麻NAC轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定及生物信息學(xué)分析[J]. 代夢媛,高梅,李文昌.  分子植物育種. 2020(06)
[3]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子功能研究進(jìn)展[J]. 王春雨,張茜.  生物技術(shù)通報. 2018(11)
[4]薔薇科植物MLO蛋白家族的生物信息學(xué)分析[J]. 向貴生,王開錦,晏慧君,李淑斌,周寧寧,唐開學(xué),邱顯欽.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(05)
[5]茶樹NAC轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定及生物信息學(xué)分析[J]. 韓雅彭,程琳,楊凌霄,王向南,張媛媛,王磊.  河南大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(03)
[6]番茄NAC轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定及生物信息學(xué)分析[J]. 陳秀玲,王傲雪,張珍珠,李景富.  植物生理學(xué)報. 2014(04)
[7]白羊草NAC轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 方志紅,王學(xué)敏,李俊,董潔,高洪文,董寬虎.  草地學(xué)報. 2013(03)
[8]大豆TCP轉(zhuǎn)錄因子家族結(jié)構(gòu)域分析及功能預(yù)測[J]. 劉洋,張慧,辛大偉,王琳琳,張麗偉,劉春燕,陳慶山,胡國華.  大豆科學(xué). 2012(05)
[9]大豆LEA基因家族全基因組鑒定、分類和表達(dá)[J]. 李樂,許紅亮,楊興露,李雅軒,胡英考.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(19)
[10]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子的種類、特征及功能[J]. 李偉,韓蕾,錢永強,孫振元.  應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報. 2011(04)

碩士論文
[1]NAC轉(zhuǎn)錄因子與乙烯合成及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)基因間的相互調(diào)控作用[D]. 劉晨.天津大學(xué) 2016
[2]葡萄NAC轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)及生物信息學(xué)分析[D]. 劉佳鑫.遼寧師范大學(xué) 2014



本文編號：3382957