利用InDel標(biāo)記構(gòu)建甘藍(lán)型油菜的分子身份證
發(fā)布時間:2021-08-18 21:09
由于甘藍(lán)型油菜品種數(shù)量的增多和品種間的遺傳多樣性水平較低,僅根據(jù)農(nóng)藝性狀對品種進(jìn)行鑒別的難度逐漸增大。為準(zhǔn)確快速地區(qū)分油菜品種,本研究從186個InDel標(biāo)記中篩選出19個InDel標(biāo)記,這19個In Del標(biāo)記來自甘藍(lán)型油菜的不同染色體上,并且每個InDel標(biāo)記在品種(系)間均只有2種等位變異;通過對19個In Del標(biāo)記在品種中的等位變異進(jìn)行數(shù)字化賦值,構(gòu)建了76份甘藍(lán)型品種(系)和2份白菜型油菜品種的分子標(biāo)記身份證。利用InDel標(biāo)記構(gòu)建甘藍(lán)型油菜分子身份證的操作簡便可行,并且品種(系)的標(biāo)記信息數(shù)據(jù)更加簡潔直觀,有助于油菜品種資源的有效區(qū)分和利用,可以在油菜品種的純合度鑒定、真實性鑒定和品種權(quán)益保護(hù)等方面提供幫助。
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(14)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
76份甘藍(lán)型油菜和2份白菜型油菜的聚類
在甘藍(lán)型油菜每條染色體上選取1個InDel標(biāo)記,共選取19個InDel標(biāo)記用于構(gòu)建油菜的分子身份證。選取的InDel標(biāo)記在品種(系)中的電泳圖中僅有兩條電泳條帶,然后根據(jù)各InDel標(biāo)記在品種中的分離進(jìn)行賦值。賦值規(guī)則如下,每個InDel標(biāo)記中僅含有較短的一種帶型的品種賦值為“1”、僅含有較長一種帶型的賦值為“2”、兩種帶型都有的品種賦值為“3”、兩種帶型均沒有的品種賦值為“0”(圖2)。每個品種中19個InDel標(biāo)記的賦值參照其所在油菜染色體按從A01~A10,C01~C09的順序排列,這樣由“1”、“2”和“3”組成的19位數(shù)字串即為相應(yīng)品種的分子身份證。作者貢獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于高通量測序的棉花InDel標(biāo)記開發(fā)及其應(yīng)用[J]. 陸海燕,陳璐,王顯生,趙涵,沈奇. 棉花學(xué)報. 2019(04)
[2]基于InDel標(biāo)記的大白菜育種材料分子身份證構(gòu)建[J]. 劉栓桃,張志剛,王榮花,王立華,李巧云,趙智中. 中國蔬菜. 2019(02)
[3]基于InDel標(biāo)記的國內(nèi)綠豆品種遺傳多樣性分析及指紋圖譜構(gòu)建[J]. 李群三,陳景斌,顧和平,袁星星,陳新,崔瑾. 植物遺傳資源學(xué)報. 2019(01)
[4]微衛(wèi)星分子標(biāo)記及其在動物遺傳育種中的研究進(jìn)展[J]. 楊萬云,鄭軍軍,賈博寅,常樹卓,劉慧,李春義,王桂武,楊福合. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(11)
[5]利用SSR標(biāo)記構(gòu)建水稻核心親本指紋圖譜[J]. 曾曉珊,彭丹,石媛媛,謝偉,劉愛民. 作物研究. 2016(05)
[6]13個中國葡萄優(yōu)新品種的分子身份證構(gòu)建[J]. 王慧玲,閆愛玲,孫磊,張國軍,王曉玥,徐海英. 生物技術(shù)通報. 2016(04)
[7]甘藍(lán)型油菜育種親本材料遺傳多樣性的SSR分析[J]. 何俊平,張書芬,王建平,文雁成,曹金華,蔡東芳,趙磊,朱家成. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2015(06)
[8]基于ISSR標(biāo)記的16個核桃品種遺傳多樣性分析及分子身份構(gòu)建[J]. 李國田,張美勇,相昆,徐穎,沈廣寧,薛培生,楊軍. 核農(nóng)學(xué)報. 2015(10)
[9]油菜品種及高油育種材料遺傳多樣性SSR分析[J]. 李曉榮,張菁雯,趙燕妮,徐獻(xiàn)鋒,胡玉梅,于澄宇. 西北植物學(xué)報. 2015(02)
[10]北方地區(qū)白菜型冬油菜與春油菜的SSR和InDel遺傳多樣性分析[J]. 方彥,楊剛,孫萬倉,王麗萍,張樹娟,楊建勝,劉林波,劉自剛,曾秀存,武軍艷. 中國油料作物學(xué)報. 2015(01)
本文編號:3350632
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(14)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
76份甘藍(lán)型油菜和2份白菜型油菜的聚類
在甘藍(lán)型油菜每條染色體上選取1個InDel標(biāo)記,共選取19個InDel標(biāo)記用于構(gòu)建油菜的分子身份證。選取的InDel標(biāo)記在品種(系)中的電泳圖中僅有兩條電泳條帶,然后根據(jù)各InDel標(biāo)記在品種中的分離進(jìn)行賦值。賦值規(guī)則如下,每個InDel標(biāo)記中僅含有較短的一種帶型的品種賦值為“1”、僅含有較長一種帶型的賦值為“2”、兩種帶型都有的品種賦值為“3”、兩種帶型均沒有的品種賦值為“0”(圖2)。每個品種中19個InDel標(biāo)記的賦值參照其所在油菜染色體按從A01~A10,C01~C09的順序排列,這樣由“1”、“2”和“3”組成的19位數(shù)字串即為相應(yīng)品種的分子身份證。作者貢獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于高通量測序的棉花InDel標(biāo)記開發(fā)及其應(yīng)用[J]. 陸海燕,陳璐,王顯生,趙涵,沈奇. 棉花學(xué)報. 2019(04)
[2]基于InDel標(biāo)記的大白菜育種材料分子身份證構(gòu)建[J]. 劉栓桃,張志剛,王榮花,王立華,李巧云,趙智中. 中國蔬菜. 2019(02)
[3]基于InDel標(biāo)記的國內(nèi)綠豆品種遺傳多樣性分析及指紋圖譜構(gòu)建[J]. 李群三,陳景斌,顧和平,袁星星,陳新,崔瑾. 植物遺傳資源學(xué)報. 2019(01)
[4]微衛(wèi)星分子標(biāo)記及其在動物遺傳育種中的研究進(jìn)展[J]. 楊萬云,鄭軍軍,賈博寅,常樹卓,劉慧,李春義,王桂武,楊福合. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(11)
[5]利用SSR標(biāo)記構(gòu)建水稻核心親本指紋圖譜[J]. 曾曉珊,彭丹,石媛媛,謝偉,劉愛民. 作物研究. 2016(05)
[6]13個中國葡萄優(yōu)新品種的分子身份證構(gòu)建[J]. 王慧玲,閆愛玲,孫磊,張國軍,王曉玥,徐海英. 生物技術(shù)通報. 2016(04)
[7]甘藍(lán)型油菜育種親本材料遺傳多樣性的SSR分析[J]. 何俊平,張書芬,王建平,文雁成,曹金華,蔡東芳,趙磊,朱家成. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2015(06)
[8]基于ISSR標(biāo)記的16個核桃品種遺傳多樣性分析及分子身份構(gòu)建[J]. 李國田,張美勇,相昆,徐穎,沈廣寧,薛培生,楊軍. 核農(nóng)學(xué)報. 2015(10)
[9]油菜品種及高油育種材料遺傳多樣性SSR分析[J]. 李曉榮,張菁雯,趙燕妮,徐獻(xiàn)鋒,胡玉梅,于澄宇. 西北植物學(xué)報. 2015(02)
[10]北方地區(qū)白菜型冬油菜與春油菜的SSR和InDel遺傳多樣性分析[J]. 方彥,楊剛,孫萬倉,王麗萍,張樹娟,楊建勝,劉林波,劉自剛,曾秀存,武軍艷. 中國油料作物學(xué)報. 2015(01)
本文編號:3350632
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