煙草開(kāi)花期影響煙葉的產(chǎn)量和品質(zhì),是決定生態(tài)適應(yīng)性和產(chǎn)量的重要性狀,與各種生物或非生物脅迫密切相關(guān)。研究煙草開(kāi)花期的遺傳規(guī)律,進(jìn)而解析調(diào)控開(kāi)花時(shí)間的分子基礎(chǔ),對(duì)煙草品種改良具有重要意義。本研究選用煙草MAGIC（Multiparent Advanced Generation Inter-crossing）群體為材料,利用高密度煙草SNP（Single Nucleotide Polymorphism）芯片進(jìn)行基因型分析,進(jìn)而對(duì)開(kāi)花期性狀進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome-Wide Association Study,GWAS）。結(jié)果表明,共檢測(cè)到13個(gè)與煙草開(kāi)花期性狀顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn),其中位于12號(hào)染色體109 616 410bp位置上的SNP為最顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)。根據(jù)參考基因組,初步確定了控制開(kāi)花期的關(guān)鍵候選基因Ntab0279610,該基因與擬南芥控制開(kāi)花的關(guān)鍵基因SOC1高度同源,可能在控制煙草開(kāi)花時(shí)間上起到關(guān)鍵作用。研究結(jié)果為進(jìn)一步揭示煙草開(kāi)花期遺傳調(diào)控機(jī)制及育種改良奠定了基礎(chǔ)。 

【文章來(lái)源】：中國(guó)煙草科學(xué). 2020,41(06)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

MAGIC群體材料開(kāi)花期的表型分布圖

采用TASSEL V 5.0軟件MLM模型，對(duì)519份MAGIC群體材料進(jìn)行開(kāi)花期的全基因組關(guān)聯(lián)分析，如圖2、3所示。其中共檢測(cè)到13個(gè)與開(kāi)花期顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)（p<0.000 1）（表1），分別位于煙草第4、5、6、8、12、13、15、17、19號(hào)染色體上，根據(jù)p值排序，在煙草全基因組染色體上的物理位置分別為：12號(hào)染色體，109 616 410 bp;8號(hào)染色體，2 266 918 bp;8號(hào)染色體，135 192 920 bp;17號(hào)染色體，43 342 018 bp;6號(hào)染色體，74 138 868bp;4號(hào)染色體，35 423 572 bp;4號(hào)染色體，91 394779 bp;12號(hào)染色體，57 703 873 bp;13號(hào)染色體，76 563 713 bp;15號(hào)染色體，21 104 329 bp;5號(hào)染色體，138 720 068 bp;6號(hào)染色體，146 052 300bp;19號(hào)染色體，40 502 891 bp；其中，4、6、8號(hào)染色體分別檢測(cè)出2個(gè)顯著性位點(diǎn)，12號(hào)染色體上109 616 410 bp處的SNP位點(diǎn)顯著性最高，p值為4.79；單個(gè)位點(diǎn)表型變異貢獻(xiàn)率（R2）范圍為3.38～4.74%，其中最顯著位點(diǎn)的表型貢獻(xiàn)率為4.49%。圖3 全基因組關(guān)聯(lián)分析分位數(shù)-分位數(shù)圖（QQ圖）

全基因組關(guān)聯(lián)分析分位數(shù)-分位數(shù)圖（QQ圖）

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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