發(fā)布時間：2021-08-07 21:31

　　由于人口、糧食、耕地之間的矛盾日益加劇,棉花的生產需要向鹽堿地、干旱坡地、沿海灘涂等非耕地轉移,因此,探索棉花耐鹽機理,選育耐鹽品種對棉花的生產具有重要意義。本研究從陸地棉耐鹽種質資源GM04中克隆了GhWRKY71基因全長c DNA。該基因最大開放讀碼框為960 bp,編碼319個氨基酸,其預測的等電點為6.31,蛋白質分子量為35.5 kD。功能域分析表明:GhWRKY71含有1個WRKY的結構域,其鋅指結構為C2H2類型,屬于Ⅱ類WRKY轉錄因子;氨基酸序列比對和進化樹分析表明陸地棉GhWRKY71與可可樹的WRKY71相似性最高;熒光定量PCR分析表明GhWRKY71基因在根、莖、葉中都有表達,該基因是一個組成型表達基因;GhWRKY71基因在根、莖、葉中的表達均受NaCl脅迫誘導,與對照相比其表達量明顯上調,表明GhWRKY71基因在陸地棉響應鹽脅迫過程中具有一定的作用。 

【文章來源】：基因組學與應用生物學. 2020,39(09)北大核心CSCD

【文章頁數】：8 頁

【部分圖文】：

棉花根,莖,葉總RNA瓊脂糖凝膠電泳

利用NCBI在線工具CD research分析Gh WR-KY71氨基酸序列，發(fā)現其WRKY的功能保守域位于173～230之間。Gh WRKY71含有1個WRKY的結構域，其鋅指結構為C2H2類型，由此可見，GhWRKY71屬于Ⅱ類轉錄因子(圖4)。利用Net Phos 3.0預測Gh WRKY71磷酸化潛在位點，發(fā)現Gh WRKY71有6個酪氨酸、11個蘇氨酸和37個絲氨酸位點為潛在磷酸化位點。其中位于第190、213處的絲氨酸磷酸化位點，位于第192處的酪氨酸磷酸化位點和位于第210、205處的蘇氨酸磷酸化位點在WRKY的保守功能域內，推測這5個磷酸化位點可能對Gh WRKY71轉錄因子活性的調控具有重要作用(圖5)。

利用在線工具BLAST(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)對Gh WRKY71的氨基酸序列進行在線序列比對，發(fā)現其與可可樹(Theobroma cacao)、榴蓮(Durio zibethinus)、葡萄(Vitis vinifera)、毛白楊(Populus trichocarpa)、蘋果(Malus domestica)、煙草(Nicotiana sylvestris)氨基酸序列的相似性分別為83%、82%、65%、56%、56%、50%(圖6)。利用DNAMAN軟件對這些植物WRKY71氨基酸序列進行多序列比對，結果顯示陸地棉Gh WRKY71氨基酸序列與其他植物氨基酸序列的一致性為64.73%，其中WRKY功能結構域的一致性為100%，表明陸地棉Gh WRKY71氨基酸序列總體上是保守的，能夠形成穩(wěn)定的蛋白質結構，與其它植物的WRKY71具有相似的生物學功能。圖4 Gh WRKY71功能域預測

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3328580