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鎘脅迫下菜心BrpZIP11和BrpIRT1基因功能研究

發(fā)布時(shí)間:2024-03-13 03:28
  菜心屬于十字花科蕓薹屬,是華南地區(qū)特色蔬菜。近年來(lái)由于經(jīng)濟(jì)快速發(fā)展,土壤重金屬污染越來(lái)越嚴(yán)重,導(dǎo)致菜心Cd含量嚴(yán)重超標(biāo)。ZIP家族是一種與二價(jià)金屬轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)的基因家族,能夠通過(guò)跨膜結(jié)構(gòu)域跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)多種二價(jià)陽(yáng)離子,包括Cd2+、Mn2+、Fe2+和Zn2+。我們前期對(duì)菜心鎘處理后轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),菜心ZIP家族多個(gè)成員均響應(yīng)鎘脅迫。因此,本研究將對(duì)菜心ZIP家族基因的表達(dá)特性及其中兩個(gè)鎘響應(yīng)上調(diào)表達(dá)的基因的功能進(jìn)行研究,深入認(rèn)識(shí)菜心吸收轉(zhuǎn)運(yùn)鎘的分子機(jī)制,為培育鎘吸收積累低的菜心品種奠定基礎(chǔ)。本研究基于前期對(duì)菜心鎘處理后轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析結(jié)果,并結(jié)合白菜全基因組序列信息,克隆獲得菜心(新世紀(jì)四九甜菜心)的BrpZIPs基因家族CDS和啟動(dòng)子片段,對(duì)其進(jìn)行相關(guān)的生物信息學(xué)分析,并對(duì)BrpZIPs家族多個(gè)基因在甜菜心中的表達(dá)模式進(jìn)行分析。進(jìn)一步對(duì)兩個(gè)鎘脅迫誘導(dǎo)表達(dá)明顯的基因BrpZIP11和BrpIRT1進(jìn)行了表達(dá)、及其蛋白的定位及功能的研究。主要獲得了如下結(jié)果:1.通過(guò)分析前期實(shí)驗(yàn)室前期的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)并結(jié)合...

【文章頁(yè)數(shù)】:82 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1ZIP家族蛋白拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)圖[37]

圖1-1ZIP家族蛋白拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)圖[37]

鎘脅迫下菜心BrpZIP11和BrpIRT1基因功能研究41.2ZIP家族概述1.2.1ZIP家族基因命名及其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)ZIP家族的第一個(gè)成員是與Fe轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)的IRT1(iron-regulatedtransporter)。由于ZRT與IRT1結(jié)構(gòu)相似,但ZRT主要轉(zhuǎn)運(yùn)Zn,所以被....


圖1-2擬南芥和水稻中ZIP家族基因發(fā)揮功能的位置[44]

圖1-2擬南芥和水稻中ZIP家族基因發(fā)揮功能的位置[44]

鎘脅迫下菜心BrpZIP11和BrpIRT1基因功能研究5性。如Pence等發(fā)現(xiàn)遏菜中克隆的ZNT1除了高親和力的吸收Z(yǔ)n2+外,也能以較低親和力吸收Cd2+[43]。大多數(shù)的ZIPs都參與轉(zhuǎn)運(yùn)底物穿過(guò)細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)的過(guò)程,但也有一些能夠從細(xì)胞器向細(xì)胞質(zhì)外排金屬離子。圖1-2是....


圖1-3技術(shù)路線示意圖

圖1-3技術(shù)路線示意圖

鎘脅迫下菜心BrpZIP11和BrpIRT1基因功能研究7圖1-3技術(shù)路線示意圖


圖3-1菜心ZIP家族克隆凝膠電泳圖

圖3-1菜心ZIP家族克隆凝膠電泳圖

鎘脅迫下菜心BrpZIP11和BrpIRT1基因功能研究22第三章結(jié)果與分析3.1菜心ZIP家族基因克隆菜心序列尚未公布,為獲得菜心中ZIP家族準(zhǔn)確序列。以數(shù)據(jù)庫(kù)中同屬于蕓薹屬、蕓薹種的白菜的ZIP基因組序列作為參考,設(shè)計(jì)引物,以甜菜心cDNA為模板,克隆菜心ZIP家族基因?寺....



本文編號(hào):3927119

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