【目的】為了研究光亮橡膠樹葉綠體基因組序列特征,從基因組層面評(píng)價(jià)光亮橡膠樹的育種可利用性,從而為橡膠樹近緣野生種的深度評(píng)價(jià)和有效利用提供參考依據(jù)�！痉椒ā恳怨饬料鹉z樹嫩葉為材料,通過(guò)提取高質(zhì)量基因組DNA、構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)、illumina HiSeq 2000測(cè)序、葉綠體基因組拼接組裝、生物信息學(xué)注釋,獲得了完整的光亮橡膠樹葉綠體基因組圖譜,并將其與大戟科其他12個(gè)已完成葉綠體基因組測(cè)序的物種進(jìn)行了進(jìn)化分析�！窘Y(jié)果】光亮橡膠樹葉綠體基因組為典型的雙鏈環(huán)狀結(jié)構(gòu),其大小為161 124 bp,由1個(gè)大單拷貝區(qū)域、1個(gè)小單拷貝區(qū)域和2個(gè)反向重復(fù)區(qū)域這4個(gè)區(qū)域組成;光亮橡膠樹葉綠體基因組包含A堿基51 495個(gè)、T堿基52 022個(gè)、G堿基28 915個(gè)、C堿基28 692個(gè),GC含量為35.75%;通過(guò)生物信息學(xué)注釋共得到134個(gè)基因,其中,86個(gè)為蛋白編碼基因,4個(gè)為假基因,36個(gè)為tRNA基因,8個(gè)為rRNA基因;從基因功能來(lái)看,86個(gè)蛋白編碼基因主要參與光合系統(tǒng)Ⅰ、光合系統(tǒng)Ⅱ、細(xì)胞色素b/f復(fù)合體、ATP合成酶、NADH脫氫酶、核糖體蛋白、RNA聚合酶等生物學(xué)過(guò)程;利用葉綠體基因組蛋白編...

【文章頁(yè)數(shù)】：10 頁(yè)

【部分圖文】：

圖1光亮橡膠樹葉綠體基因組圖譜

以超低溫保存的光亮橡膠樹淺綠色嫩葉為材料，按照試劑盒規(guī)定的流程提取了基因組DNA，經(jīng)Agilent2100Bioanalyzer質(zhì)量檢測(cè)發(fā)現(xiàn)，DNA未降解、不包含RNA或蛋白質(zhì)等雜質(zhì)，DNA質(zhì)量符合構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)的要求。然后采用1.2.2中所述的方法構(gòu)建了DNA測(cè)序文庫(kù)，并采用....

圖2基于葉綠體基因組的大戟科植物系統(tǒng)發(fā)育樹

基于大戟科的13種植物葉綠體基因組蛋白編碼基因序列的進(jìn)化分析結(jié)果表明，13個(gè)物種在其進(jìn)化中可明顯地分為3個(gè)類群。其中，4種橡膠樹屬植物和木薯分為1類群，麻瘋樹、巴豆、油桐、東京桐和蓖麻5個(gè)物種分為1類群，甘遂、乳漿大戟和綠玉樹3個(gè)物種分為1類群。這一分析結(jié)果與傳統(tǒng)分類學(xué)中依據(jù)形態(tài)....

本文編號(hào)：3928119