兩種不同生境中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的多樣性
發(fā)布時(shí)間:2023-05-10 18:37
植物內(nèi)生菌廣泛分布于植物的各種組織及器官中,對(duì)植物的生長(zhǎng)表現(xiàn)出各種作用,而植物種子中的內(nèi)生菌對(duì)植物的作用也越來越受到人們的關(guān)注。以榆中縣和秦安縣兩種不同生境的中國沙棘種子為材料,分析中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌多樣性,以期探究生境對(duì)種子內(nèi)生菌多樣性的影響,并為進(jìn)一步研究種子內(nèi)生菌與沙棘的相互作用提供依據(jù)。研究利用純培養(yǎng)方法和高通量測(cè)序方法分別進(jìn)行中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌多樣性分析。對(duì)純培養(yǎng)分離得到的內(nèi)生細(xì)菌,利用16S rRNA基因序列分析法結(jié)合形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行內(nèi)生細(xì)菌的鑒定;對(duì)高通量測(cè)序得到的數(shù)據(jù)進(jìn)行基于OTUs(Operational Taxonomic units,可操作分類單元)的物種注釋分析。通過純培養(yǎng)方法從榆中縣中國沙棘種子中分離得到4株內(nèi)生細(xì)菌,分屬于芽孢桿菌屬(Bacillus)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)和假單胞菌屬(Pseudomonas);秦安縣中國沙棘種子中分離得到5株內(nèi)生細(xì)菌,分屬于芽孢桿菌屬(Bacillus)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)和不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter)。采用高通量測(cè)序方法檢測(cè)到榆中縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌分屬于7個(gè)...
【文章頁數(shù)】:11 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 采樣地概況
1.1.2 主要設(shè)備與試劑
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的純培養(yǎng)
(1)沙棘種子可培養(yǎng)內(nèi)生細(xì)菌的分離與純化
(2)沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的形態(tài)鑒定
(3)沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的分子鑒定
1.2.2 沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的高通量測(cè)序
2 結(jié)果與分析
2.1 榆中縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌多樣性
2.1.1 榆中縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的純培養(yǎng)
(1)內(nèi)生細(xì)菌的形態(tài)特征
(2)內(nèi)生細(xì)菌的16S rRNA基因序列分析
2.1.2 榆中縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的高通量測(cè)序
(1)樣品復(fù)雜度分析及OTUs數(shù)目統(tǒng)計(jì)
(2)內(nèi)生細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成
2.2 秦安縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌多樣性
2.2.1 秦安縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的純培養(yǎng)
(1)內(nèi)生細(xì)菌的形態(tài)特征
(2)內(nèi)生細(xì)菌的16S rRNA基因序列分析
2.2.2 秦安縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的高通量測(cè)序
(1)樣品復(fù)雜度分析及OTUs數(shù)目統(tǒng)計(jì)
(2)內(nèi)生細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成
2.3 榆中縣和秦安縣兩種不同生境中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌多樣性比較
2.3.1 內(nèi)生細(xì)菌純培養(yǎng)的差異
2.3.2 內(nèi)生細(xì)菌高通量測(cè)序的差異
(1)內(nèi)生細(xì)菌Alpha多樣性指數(shù)分析
(2)內(nèi)生細(xì)菌Venn圖分析
(3)內(nèi)生細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成分析
3 討論
本文編號(hào):3813283
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1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 采樣地概況
1.1.2 主要設(shè)備與試劑
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的純培養(yǎng)
(1)沙棘種子可培養(yǎng)內(nèi)生細(xì)菌的分離與純化
(2)沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的形態(tài)鑒定
(3)沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的分子鑒定
1.2.2 沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的高通量測(cè)序
2 結(jié)果與分析
2.1 榆中縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌多樣性
2.1.1 榆中縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的純培養(yǎng)
(1)內(nèi)生細(xì)菌的形態(tài)特征
(2)內(nèi)生細(xì)菌的16S rRNA基因序列分析
2.1.2 榆中縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的高通量測(cè)序
(1)樣品復(fù)雜度分析及OTUs數(shù)目統(tǒng)計(jì)
(2)內(nèi)生細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成
2.2 秦安縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌多樣性
2.2.1 秦安縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的純培養(yǎng)
(1)內(nèi)生細(xì)菌的形態(tài)特征
(2)內(nèi)生細(xì)菌的16S rRNA基因序列分析
2.2.2 秦安縣中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌的高通量測(cè)序
(1)樣品復(fù)雜度分析及OTUs數(shù)目統(tǒng)計(jì)
(2)內(nèi)生細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成
2.3 榆中縣和秦安縣兩種不同生境中國沙棘種子內(nèi)生細(xì)菌多樣性比較
2.3.1 內(nèi)生細(xì)菌純培養(yǎng)的差異
2.3.2 內(nèi)生細(xì)菌高通量測(cè)序的差異
(1)內(nèi)生細(xì)菌Alpha多樣性指數(shù)分析
(2)內(nèi)生細(xì)菌Venn圖分析
(3)內(nèi)生細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成分析
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