發(fā)布時間：2023-02-10 20:43

　　本研究以銀杏葉品種(Ginkgo biloba L.)家佛手室內(nèi)盆栽為試材,對3年生銀杏幼苗進行亞硒酸鈉葉面噴灑處理,并分析其萜內(nèi)酯相關(guān)基因的表達變化。挖掘與萜類化合物合成相關(guān)基因并對其差異表達基因進行篩選和分析,研究結(jié)果表明,亞硒酸鈉處理葉片轉(zhuǎn)錄組測序共獲得142 834條Unigene,平均長度656 bp,基因差異表達(DEG)篩選得到5 292個基因,并將其進行KOG功能分類。通過對萜類化合物合成相關(guān)KEGG途徑進行分析,篩選出6條候選基因。采用實時熒光定量(qRT-PCR)對選取的候選差異基因進行驗證,其中DXS、MECT、HMGR上調(diào)表達,與轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果一致,而DXR、MECPs、MVD在轉(zhuǎn)錄組測序中雖無明顯差異,但q RT-PCR結(jié)果表明其在硒處理后的5周內(nèi)就有明顯差異變化。本實驗為銀杏提供了較為全面的基因信息和代謝途徑數(shù)據(jù),為硒處理條件下銀杏分子調(diào)控機制的深入研究奠定基礎(chǔ)。

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 結(jié)果與分析
    1.1 測序結(jié)果和注釋數(shù)據(jù)
        1.1.1 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量分析
        1.1.2 測序數(shù)據(jù)注釋信息分析
        1.1.3 KOG功能分類
    1.2 基因功能分析與差異表達基因篩選
        1.2.1 萜內(nèi)酯生物合成相關(guān)基因篩選
        1.2.2 差異表達基因的KEGG富集分析
    1.3 差異基因及其實時熒光定量驗證分析
2 討論
3 材料與方法
    3.1 材料
    3.2 轉(zhuǎn)錄組測序與分析
    3.3 實時熒光定量PCR分析
作者貢獻



本文編號：3739880