【目的】目前杉木分子標(biāo)記數(shù)量無(wú)法滿(mǎn)足種質(zhì)資源評(píng)價(jià)及分子標(biāo)記輔助育種等相關(guān)研究需求,需要開(kāi)發(fā)更多的杉木SSR標(biāo)記十分重要�！痉椒ā恳躁惿郊t心杉轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),進(jìn)行EST-SSR標(biāo)記的檢測(cè)和開(kāi)發(fā),并對(duì)陳山紅心杉二代種子園進(jìn)行遺傳變異分析�！窘Y(jié)果】轉(zhuǎn)錄組測(cè)序共獲得99 122 394個(gè)reads片段,包含了14.87 Gb的序列數(shù)據(jù)。序列組裝后,獲得76 597個(gè)unigene,共計(jì)104.18 Mb數(shù)據(jù),平均長(zhǎng)983 bp。尋找到8 072個(gè)SSR位點(diǎn),單核苷酸和三核苷酸是主要重復(fù)類(lèi)型,分別占總數(shù)的66.30%和17.48%,其次是二核苷酸重復(fù)類(lèi)型,占總數(shù)的12.31%。AT/TA和AG/TC是主要的雙堿基重復(fù)序列,分別占總位點(diǎn)數(shù)的6.79%和1.93%。AGA/TCT和AAG/TTC是主要的三堿基重復(fù)序列,分別占總位點(diǎn)數(shù)的1.45%和1.44%。從隨機(jī)挑選的150對(duì)SSR引物中篩選出11對(duì)多態(tài)性引物。陳山紅心杉二代種子園SSR位點(diǎn)間的平均等位基因數(shù)為4.4個(gè),有效等位基因?yàn)?.4個(gè);群體平均觀察雜合度、期望雜合度、Shannon多樣性指數(shù)分別為0.533 5、0.563 8、1.0... 

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【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 植物材料
    1.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
    1.3 EST-SSR挖掘和引物設(shè)計(jì)
    1.4 引物篩選與產(chǎn)物檢測(cè)
    1.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的組裝
    2.2 轉(zhuǎn)錄組中EST-SSR位點(diǎn)的分布特點(diǎn)
    2.3 EST-SSR引物的篩選
    2.4 陳山紅心杉二代種子園遺傳多樣性和遺傳相似系數(shù)
3 結(jié)論和討論
    3.1 陳山紅心杉轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)質(zhì)量和EST-SSR的分布特點(diǎn)
    3.2 陳山紅心杉二代種子園遺傳多樣性


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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